MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	CGGT	2	8	3977	3984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011901	CTGA	2	8	7711	7718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011901	AGGC	2	8	10627	10634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011901	ACCC	2	8	13325	13332	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_011901	GCCC	2	8	13636	13643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_011901	GAAC	2	8	13822	13829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011901	GTGA	2	8	14378	14385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011901	CGCA	2	8	14681	14688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011901	GGTC	2	8	22496	22503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011901	GCCG	2	8	35914	35921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011901	GTTC	2	8	39190	39197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011901	CGGG	2	8	46993	47000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011901	ACTG	2	8	57507	57514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011901	TTAT	2	8	57999	58006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011901	CTTT	2	8	58036	58043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011901	GCAT	2	8	61264	61271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011901	TGGC	2	8	64848	64855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011901	TCTG	2	8	64922	64929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011901	GTAA	2	8	68157	68164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011901	AATA	2	8	68177	68184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011901	GCTG	2	8	74106	74113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011901	GGCG	2	8	84533	84540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011901	TAGG	2	8	87496	87503	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011901	TGGG	2	8	88604	88611	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011901	CCGG	2	8	93836	93843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011901	TCCC	2	8	93914	93921	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011901	GGCA	2	8	95123	95130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011901	CTTG	2	8	100280	100287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011901	GTCC	2	8	106187	106194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011901	CCGG	2	8	108286	108293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011901	CCAC	2	8	108720	108727	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_011901	GCCT	2	8	108741	108748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011901	GGAG	2	8	108877	108884	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011901	GAAG	2	8	108895	108902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011901	GGCT	2	8	109938	109945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011901	GGGC	2	8	110087	110094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011901	GCCC	2	8	110140	110147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011901	TCGA	2	8	123809	123816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011901	GACA	2	8	123889	123896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011901	CTGT	2	8	127559	127566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011901	CCCG	2	8	127582	127589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_011901	CGCC	2	8	144411	144418	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_011901	GGAC	2	8	144437	144444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011901	CTCG	2	8	145206	145213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011901	GAAT	2	8	150191	150198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011901	GCCT	2	8	150649	150656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011901	CGAA	2	8	150820	150827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011901	TGCG	2	8	154904	154911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011901	GGGT	2	8	155535	155542	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011901	TAGG	2	8	160856	160863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011901	TGCC	2	8	161278	161285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011901	TGAT	2	8	164260	164267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011901	GGGC	2	8	164487	164494	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011901	ACGG	2	8	176041	176048	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011901	GCAA	2	8	178093	178100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011901	CTCA	2	8	184765	184772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011901	TTGT	2	8	187398	187405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011901	TGGC	2	8	193851	193858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011901	AATC	2	8	194189	194196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011901	GCCC	2	8	205903	205910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011901	CAAT	2	8	205935	205942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011901	GCCC	2	8	206009	206016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_011901	CCGG	2	8	213993	214000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011901	TACC	2	8	233089	233096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011901	GGCG	2	8	237257	237264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011901	GTTT	2	8	238915	238922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011901	ACCC	2	8	238975	238982	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_011901	TCAT	2	8	239061	239068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011901	TGTA	2	8	241687	241694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011901	AGCC	2	8	246364	246371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011901	GAAC	2	8	250116	250123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011901	TGGC	2	8	251564	251571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011901	CGCT	2	8	251610	251617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011901	GCTC	2	8	251630	251637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011901	CGGC	2	8	251638	251645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011901	GGAA	2	8	255306	255313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011901	GCCT	2	8	262193	262200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011901	TCCC	2	8	263268	263275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_011901	GGGC	2	8	265473	265480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011901	CCGA	2	8	268930	268937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011901	GCCG	2	8	269038	269045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011901	CGGC	2	8	269081	269088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011901	TCCG	2	8	269857	269864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011901	CGCA	2	8	271248	271255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011901	CCAG	2	8	271317	271324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011901	GAAG	2	8	283213	283220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011901	GGTG	2	8	283499	283506	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011901	GGGA	2	8	288497	288504	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011901	TCAA	2	8	288556	288563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011901	GTTC	2	8	292168	292175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011901	TTTA	2	8	293383	293390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011901	GAAA	2	8	294718	294725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011901	GGTC	2	8	294998	295005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011901	GAGT	2	8	295892	295899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011901	GGTC	2	8	298702	298709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011901	CCAG	2	8	305353	305360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011901	TCTT	2	8	305801	305808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011901	AAAC	2	8	305850	305857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011901	TCTG	2	8	305995	306002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011901	AAAC	2	8	306441	306448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011901	ATTT	2	8	308854	308861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011901	ACCT	2	8	310996	311003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011901	AAGA	2	8	313214	313221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011901	CCTG	2	8	313236	313243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011901	ATTC	2	8	313280	313287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011901	CGGG	2	8	318032	318039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011901	AGTT	2	8	324186	324193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011901	CGGG	2	8	325228	325235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011901	GCGG	2	8	333908	333915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011901	CATT	2	8	340383	340390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011901	CAAG	3	12	340485	340496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011901	GTCA	2	8	346868	346875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011901	ATGG	2	8	346881	346888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011901	GATC	2	8	346890	346897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011901	GCTG	2	8	348821	348828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011901	TGAA	2	8	350801	350808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011901	CGTG	2	8	352609	352616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011901	CGGC	2	8	355010	355017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011901	CTGT	2	8	355411	355418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011901	CCCG	2	8	358160	358167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_011901	GCGA	2	8	362968	362975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011901	CGCC	2	8	366360	366367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_011901	CGCC	2	8	369182	369189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_011901	GCTG	2	8	379988	379995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011901	CTTT	2	8	380054	380061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011901	AAAG	2	8	380070	380077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011901	CCGT	2	8	380161	380168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011901	CAAG	2	8	380603	380610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011901	CACC	2	8	380747	380754	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_011901	GGGC	2	8	380858	380865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011901	GCCC	2	8	387064	387071	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011901	CCAG	2	8	387081	387088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011901	AGGC	2	8	387100	387107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011901	GTCG	2	8	387120	387127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011901	GGCG	2	8	387731	387738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011901	GGGC	2	8	389739	389746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011901	TAGA	2	8	390504	390511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011901	GCCC	2	8	390522	390529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_011901	TAAT	2	8	396184	396191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011901	TGAT	2	8	396358	396365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011901	TGTT	2	8	407958	407965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011901	GGGA	2	8	409405	409412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011901	GATG	2	8	410907	410914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011901	CGAT	2	8	411393	411400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011901	AAAC	2	8	412430	412437	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011901	TCTT	2	8	414946	414953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011901	GGGT	2	8	421226	421233	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011901	CTTT	2	8	421380	421387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011901	AAAG	2	8	421396	421403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011901	GCCC	2	8	421731	421738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_011901	ACGG	2	8	421823	421830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011901	CAAG	2	8	421927	421934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011901	GGTT	2	8	423962	423969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011901	GTTG	2	8	424007	424014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_011901	GCCG	2	8	450234	450241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_011901	CGGG	2	8	452627	452634	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
159	NC_011901	CCGC	2	8	452658	452665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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162	NC_011901	TCCC	2	8	461555	461562	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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174	NC_011901	CATA	2	8	501046	501053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_011901	AGTT	2	8	509168	509175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011901	TCGA	2	8	512032	512039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_011901	GCCC	2	8	520506	520513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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282	NC_011901	TGAA	2	8	853057	853064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_011901	AAAG	2	8	1329309	1329316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_011901	CTTT	2	8	1345239	1345246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_011901	AAAG	2	8	1345255	1345262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_011901	AAAG	2	8	1345268	1345275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_011901	CCGT	2	8	1345346	1345353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_011901	CCTG	2	8	1345588	1345595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_011901	CAAG	2	8	1345886	1345893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_011901	GACC	2	8	1352210	1352217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_011901	GCCC	2	8	1371076	1371083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
490	NC_011901	CAGT	2	8	1372788	1372795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_011901	CACC	2	8	1373428	1373435	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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494	NC_011901	CGGG	2	8	1380196	1380203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
495	NC_011901	GCAA	2	8	1381090	1381097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_011901	TTTG	2	8	1387891	1387898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_011901	ACGA	2	8	1391059	1391066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_011901	CAAG	2	8	1391150	1391157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_011901	ACAA	2	8	1391355	1391362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_011901	AATC	2	8	1391517	1391524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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