MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 7921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011901	TTG	2	6	1306911	1306916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_011901	GTC	2	6	1306927	1306932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_011901	AAAT	2	8	1306963	1306970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011901	AGG	2	6	1307859	1307864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011901	CAT	2	6	1310582	1310587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011901	GC	3	6	1320333	1320338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_011901	AG	3	6	1320339	1320344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011901	CAG	2	6	1320424	1320429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_011901	AGC	2	6	1322290	1322295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_011901	T	6	6	1322304	1322309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_011901	AC	3	6	1323436	1323441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_011901	TGC	2	6	1324061	1324066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_011901	GC	3	6	1324065	1324070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_011901	AGGT	2	8	1324985	1324992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011901	GAG	2	6	1327602	1327607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011901	GCAG	2	8	1327615	1327622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_011901	GGCA	2	8	1327623	1327630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_011901	AGG	2	6	1327635	1327640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011901	CAG	2	6	1327691	1327696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_011901	AGC	2	6	1327708	1327713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_011901	CTC	2	6	1327766	1327771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_011901	TTG	2	6	1327793	1327798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011901	AAAG	2	8	1329309	1329316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011901	GCAT	2	8	1329363	1329370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_011901	GT	3	6	1331281	1331286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011901	TGA	2	6	1332179	1332184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011901	GTG	2	6	1332196	1332201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011901	GC	3	6	1332276	1332281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_011901	TCC	2	6	1335921	1335926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_011901	AAC	2	6	1338154	1338159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_011901	AGA	3	9	1338166	1338174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011901	AAT	2	6	1338272	1338277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011901	GCC	2	6	1339422	1339427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_011901	GCCC	2	8	1339461	1339468	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3035	NC_011901	GGC	2	6	1339500	1339505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_011901	GCC	2	6	1339511	1339516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_011901	AG	3	6	1339634	1339639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011901	GACTT	2	10	1340693	1340702	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3039	NC_011901	GGC	2	6	1340722	1340727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_011901	GGGT	2	8	1345142	1345149	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011901	GCTG	2	8	1345158	1345165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_011901	GTTT	2	8	1345188	1345195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011901	CTTT	2	8	1345239	1345246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_011901	AAAG	2	8	1345255	1345262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011901	AAAG	2	8	1345268	1345275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011901	GC	3	6	1345310	1345315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_011901	CCGT	2	8	1345346	1345353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_011901	CGC	2	6	1345370	1345375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_011901	GCG	2	6	1345382	1345387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_011901	G	7	7	1345438	1345444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011901	GCA	2	6	1345455	1345460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_011901	CCA	2	6	1345523	1345528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_011901	CCTG	2	8	1345588	1345595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_011901	C	6	6	1345596	1345601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3055	NC_011901	GCCAG	2	10	1345677	1345686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_011901	GAA	2	6	1345706	1345711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011901	GCC	2	6	1345714	1345719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_011901	CCG	2	6	1345720	1345725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_011901	CTT	2	6	1345862	1345867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_011901	CAAG	2	8	1345886	1345893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_011901	GC	3	6	1345917	1345922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_011901	CAC	2	6	1346090	1346095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_011901	GGGC	2	8	1349824	1349831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_011901	GCG	2	6	1351052	1351057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_011901	GGTGCT	2	12	1351075	1351086	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3066	NC_011901	CGG	2	6	1351107	1351112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_011901	GC	4	8	1351128	1351135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_011901	CTG	2	6	1351190	1351195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_011901	TGT	2	6	1351225	1351230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011901	CCA	2	6	1351396	1351401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_011901	CTA	2	6	1351403	1351408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011901	CCA	2	6	1351410	1351415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_011901	CTA	2	6	1351417	1351422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_011901	CTA	2	6	1351424	1351429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_011901	CTA	2	6	1351431	1351436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_011901	CTA	2	6	1351438	1351443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_011901	GCC	2	6	1352198	1352203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_011901	GACC	2	8	1352210	1352217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_011901	CAT	2	6	1352771	1352776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_011901	GC	3	6	1357960	1357965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_011901	TGA	2	6	1359135	1359140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011901	TGT	2	6	1359155	1359160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011901	G	6	6	1359188	1359193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011901	TTG	2	6	1359781	1359786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011901	TCA	2	6	1359794	1359799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_011901	TGA	2	6	1361594	1361599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011901	TTG	2	6	1361618	1361623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011901	CCT	2	6	1364727	1364732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_011901	GAT	2	6	1365715	1365720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011901	AGC	2	6	1365737	1365742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_011901	TGG	2	6	1365779	1365784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011901	A	6	6	1365823	1365828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011901	AATTG	2	10	1365875	1365884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011901	GA	3	6	1365912	1365917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011901	TGT	2	6	1370855	1370860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011901	GGC	2	6	1371008	1371013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_011901	GCC	2	6	1371019	1371024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_011901	CGG	2	6	1371065	1371070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_011901	GCCC	2	8	1371076	1371083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3100	NC_011901	TCT	2	6	1371090	1371095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_011901	TC	3	6	1372209	1372214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_011901	TCC	2	6	1372575	1372580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_011901	TC	3	6	1372611	1372616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_011901	TTC	2	6	1372670	1372675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_011901	GA	3	6	1372739	1372744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011901	CAGT	2	8	1372788	1372795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_011901	TC	3	6	1373368	1373373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_011901	TGT	2	6	1373375	1373380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011901	CACC	2	8	1373428	1373435	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3110	NC_011901	GGGC	2	8	1376696	1376703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_011901	GCC	2	6	1376720	1376725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_011901	TGACC	2	10	1379441	1379450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3113	NC_011901	TGG	2	6	1379488	1379493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011901	TGT	2	6	1379578	1379583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011901	ATG	2	6	1379610	1379615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011901	CTG	2	6	1379629	1379634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_011901	GTT	2	6	1379643	1379648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011901	GCG	2	6	1379657	1379662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_011901	GC	3	6	1379673	1379678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_011901	AGG	2	6	1379711	1379716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011901	CCCG	2	8	1380172	1380179	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3122	NC_011901	CGGG	2	8	1380196	1380203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_011901	AAC	2	6	1380250	1380255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_011901	GCAA	2	8	1381090	1381097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_011901	TCG	2	6	1381219	1381224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_011901	GGA	2	6	1381235	1381240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011901	GCC	2	6	1381835	1381840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_011901	AC	3	6	1381842	1381847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_011901	TTC	2	6	1386069	1386074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_011901	CGG	2	6	1386082	1386087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_011901	GGC	2	6	1386101	1386106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_011901	GCC	2	6	1387667	1387672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_011901	GA	3	6	1387758	1387763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_011901	CT	4	8	1387834	1387841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3135	NC_011901	TTTG	2	8	1387891	1387898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3144	NC_011901	TGA	2	6	1391044	1391049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_011901	CTG	2	6	1391113	1391118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3164	NC_011901	CCT	2	6	1396560	1396565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3165	NC_011901	CTC	2	6	1397901	1397906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3172	NC_011901	TGTT	2	8	1398156	1398163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_011901	TGCGC	2	10	1398221	1398230	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3247	NC_011901	AGCG	2	8	1435710	1435717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_011901	ATT	2	6	1438689	1438694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_011901	GAG	2	6	1442137	1442142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_011901	GATCC	2	10	1444015	1444024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3251	NC_011901	ATC	2	6	1446558	1446563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_011901	GCCCG	2	10	1447075	1447084	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3254	NC_011901	CCGC	2	8	1447088	1447095	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3255	NC_011901	GC	3	6	1447767	1447772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_011901	CTC	2	6	1447798	1447803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3258	NC_011901	CTC	2	6	1447826	1447831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_011901	CG	3	6	1449427	1449432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_011901	GGC	2	6	1449957	1449962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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