MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011653	TTTC	2	8	647	654	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011653	ACTT	2	8	6760	6767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011653	TTAA	2	8	17601	17608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011653	TCAA	2	8	17861	17868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011653	ATTT	2	8	19424	19431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011653	TCCC	2	8	23924	23931	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_011653	ATTT	2	8	24908	24915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011653	ATTA	2	8	33095	33102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011653	TGTT	2	8	39968	39975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011653	ACTA	2	8	39997	40004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011653	TCCC	2	8	61304	61311	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_011653	CCTT	2	8	64990	64997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011653	TATT	2	8	68720	68727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011653	TAAA	2	8	89939	89946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011653	TAAA	2	8	89949	89956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011653	ATTT	2	8	89957	89964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011653	CTCC	2	8	94619	94626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_011653	ACTT	2	8	106834	106841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011653	TAAA	2	8	112094	112101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011653	AAAT	2	8	118953	118960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011653	CATA	2	8	118980	118987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011653	TTCT	2	8	120939	120946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011653	AGAA	2	8	120966	120973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011653	TAAT	2	8	123455	123462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011653	ATTA	2	8	139628	139635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011653	CTTC	2	8	142792	142799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011653	CACC	2	8	142833	142840	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_011653	TCCT	2	8	158802	158809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011653	AAAT	2	8	161964	161971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011653	AAGT	2	8	163085	163092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011653	AACG	2	8	164924	164931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011653	AATA	2	8	171254	171261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011653	GAAT	2	8	176125	176132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011653	TTTA	2	8	187770	187777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011653	GAAA	2	8	190370	190377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011653	TATC	2	8	216118	216125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011653	AAAT	2	8	216126	216133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011653	AGTA	2	8	216170	216177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011653	TACA	2	8	219860	219867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011653	TTCC	2	8	221528	221535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011653	AGGG	2	8	223531	223538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011653	CATT	2	8	229595	229602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011653	TTTA	2	8	230669	230676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011653	TTAT	2	8	230777	230784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011653	TTAG	2	8	238632	238639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011653	TTAA	2	8	243975	243982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011653	TAAA	2	8	244607	244614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011653	AAAG	2	8	259001	259008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011653	AAAG	2	8	259187	259194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011653	AGGA	2	8	259270	259277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011653	GAAA	2	8	259312	259319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011653	AAAT	2	8	259500	259507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011653	TACA	2	8	259839	259846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011653	TATT	2	8	276660	276667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011653	TGTA	2	8	284265	284272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011653	TATT	2	8	284321	284328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011653	CATA	2	8	309228	309235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011653	TATT	2	8	309760	309767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011653	TTCT	2	8	310031	310038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011653	ATTT	2	8	311959	311966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011653	AAAC	2	8	312004	312011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011653	AATT	2	8	326751	326758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011653	AAAT	2	8	326869	326876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011653	TCTA	2	8	327016	327023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011653	AAAC	2	8	327750	327757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011653	ATAA	2	8	329304	329311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011653	TTTA	2	8	329383	329390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011653	TTTC	2	8	329524	329531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011653	TATC	2	8	329647	329654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011653	TATT	2	8	329818	329825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011653	TTAA	2	8	338405	338412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011653	ATTT	2	8	346198	346205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011653	ACAA	2	8	348599	348606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011653	ATAA	2	8	367440	367447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011653	TCAA	2	8	367518	367525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011653	TCAA	2	8	367573	367580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011653	TCAT	2	8	367675	367682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011653	TCTA	2	8	367918	367925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011653	TTTC	2	8	367985	367992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011653	AAGA	2	8	368370	368377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011653	TATT	2	8	368587	368594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011653	CTTT	2	8	368664	368671	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011653	CATA	2	8	369666	369673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011653	CATA	2	8	369721	369728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011653	CTTT	2	8	369740	369747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011653	ATTT	2	8	370274	370281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011653	AAAT	2	8	371925	371932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011653	TTTC	2	8	375033	375040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011653	TATT	2	8	379127	379134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011653	ATTA	2	8	380596	380603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011653	CTTA	2	8	381969	381976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011653	AGTT	2	8	382026	382033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011653	ATAC	2	8	383760	383767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011653	ATTT	2	8	397329	397336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011653	AACA	2	8	438146	438153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011653	ATCA	2	8	467280	467287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011653	TTTG	2	8	484941	484948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011653	CTTA	2	8	489858	489865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011653	AGTA	2	8	491031	491038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011653	TCAA	2	8	491092	491099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011653	CTAA	2	8	491635	491642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011653	ATTT	2	8	492018	492025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011653	ACTA	2	8	492072	492079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011653	AAGA	2	8	492405	492412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011653	ATAA	2	8	492917	492924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011653	AATT	2	8	493313	493320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011653	AGTT	2	8	493365	493372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011653	TAAT	2	8	494882	494889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011653	ATTA	2	8	498193	498200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011653	GAAT	2	8	498669	498676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011653	ATAA	2	8	498736	498743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011653	AAAT	2	8	498888	498895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011653	TAAA	2	8	498898	498905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011653	TCAT	2	8	499075	499082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011653	TAGG	2	8	500245	500252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011653	TTCA	2	8	501541	501548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011653	ATAA	2	8	501671	501678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011653	TTTA	2	8	501750	501757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011653	GAAG	2	8	502267	502274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011653	AAAG	2	8	502489	502496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011653	TCAT	2	8	502558	502565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011653	CATT	2	8	502941	502948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011653	ACAA	2	8	503649	503656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011653	TTGA	2	8	523361	523368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011653	TAAA	2	8	524444	524451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011653	ATTA	2	8	527704	527711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011653	CCAG	2	8	531907	531914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011653	TTAT	2	8	545903	545910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011653	ATTT	2	8	558069	558076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011653	AATT	2	8	558087	558094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011653	TTAA	2	8	568260	568267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011653	GGGA	2	8	579627	579634	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011653	GGAA	2	8	587696	587703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011653	AAAG	2	8	589325	589332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011653	AATG	2	8	590391	590398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011653	CCCT	2	8	602908	602915	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_011653	ATTT	2	8	606880	606887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011653	AATT	2	8	606917	606924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011653	TTAG	2	8	608510	608517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011653	TACA	2	8	611153	611160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011653	ATTA	2	8	611274	611281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011653	ATGT	2	8	611793	611800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011653	AAAT	2	8	611867	611874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011653	AATT	2	8	612554	612561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011653	AAAT	2	8	612623	612630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011653	ATTT	2	8	614323	614330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011653	AAAG	2	8	617101	617108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011653	AATC	2	8	619246	619253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011653	TTAA	2	8	620162	620169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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