MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 5631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011653	AAT	2	6	259903	259908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011653	CAG	2	6	259950	259955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011653	T	6	6	259960	259965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011653	AGA	2	6	259978	259983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011653	AGT	2	6	259984	259989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011653	A	6	6	260004	260009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011653	AGA	2	6	260014	260019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011653	AGA	2	6	260035	260040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011653	AT	3	6	260041	260046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011653	GAA	2	6	260060	260065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011653	A	6	6	260083	260088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011653	TGT	2	6	260116	260121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011653	T	7	7	260140	260146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011653	AGG	2	6	260179	260184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011653	A	6	6	260191	260196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011653	CCG	2	6	260299	260304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_011653	CAA	2	6	260338	260343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011653	TAT	2	6	260344	260349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011653	ATC	2	6	260350	260355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011653	TAA	2	6	260357	260362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011653	A	7	7	262088	262094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011653	TA	3	6	262192	262197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011653	CCT	2	6	267098	267103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_011653	AAT	2	6	267151	267156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011653	A	6	6	267157	267162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011653	A	6	6	267173	267178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011653	A	7	7	267187	267193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011653	TGT	2	6	269171	269176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011653	ATT	2	6	269237	269242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011653	ATT	2	6	269247	269252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011653	AT	3	6	269283	269288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011653	A	6	6	269319	269324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011653	TGG	2	6	269353	269358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011653	AT	3	6	269434	269439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011653	TTA	2	6	269472	269477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011653	TC	3	6	274327	274332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_011653	T	6	6	274337	274342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011653	A	6	6	274349	274354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011653	T	6	6	275499	275504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011653	TATT	2	8	276660	276667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011653	TCC	2	6	277746	277751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_011653	A	6	6	277756	277761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011653	AT	3	6	278120	278125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011653	CCT	2	6	282683	282688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_011653	TAT	2	6	282711	282716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011653	TTATC	2	10	282729	282738	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_011653	TAAAT	2	10	282747	282756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011653	T	6	6	282821	282826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011653	AGG	2	6	282878	282883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011653	T	7	7	284155	284161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011653	AT	3	6	284169	284174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011653	TAA	2	6	284176	284181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011653	ATT	2	6	284216	284221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011653	ATA	2	6	284230	284235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011653	TGTA	2	8	284265	284272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011653	TGTTAT	2	12	284284	284295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_011653	AGG	2	6	285890	285895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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562	NC_011653	T	7	7	286652	286658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011653	T	6	6	286669	286674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011653	C	6	6	287679	287684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
565	NC_011653	TAA	2	6	287686	287691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011653	ATT	2	6	287767	287772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011653	AGG	2	6	287776	287781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_011653	GCA	2	6	290440	290445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011653	AAT	2	6	290451	290456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011653	GGA	2	6	290493	290498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011653	AAC	2	6	292517	292522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011653	GTT	2	6	292541	292546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_011653	A	6	6	307377	307382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011653	CAG	2	6	309200	309205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_011653	A	6	6	309251	309256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011653	ATT	2	6	309263	309268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_011653	T	7	7	309300	309306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011653	ATA	2	6	309323	309328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011653	TA	3	6	309327	309332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011653	TATTT	2	10	309386	309395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011653	T	6	6	309393	309398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011653	T	6	6	309430	309435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011653	ACT	2	6	309462	309467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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595	NC_011653	TAT	2	6	309507	309512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_011653	T	6	6	309591	309596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_011653	TAC	2	6	309702	309707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_011653	T	6	6	309818	309823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_011653	TTATAG	2	12	309970	309981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011653	TTCT	2	8	310031	310038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_011653	ATA	2	6	310044	310049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011653	TA	3	6	310116	310121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011653	TTTTC	2	10	310128	310137	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_011653	ATA	2	6	310173	310178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011653	TAA	2	6	310183	310188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011653	T	6	6	310254	310259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_011653	CAT	2	6	310385	310390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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615	NC_011653	TCT	2	6	310566	310571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011653	CTA	2	6	310572	310577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011653	TAT	2	6	310633	310638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011653	T	6	6	310653	310658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011653	AAT	2	6	310698	310703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011653	TGT	2	6	310705	310710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011653	TTC	2	6	310774	310779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011653	TA	3	6	311009	311014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011653	CTC	2	6	311083	311088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_011653	AAC	2	6	311116	311121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011653	TCA	2	6	311192	311197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011653	ATTATC	2	12	311212	311223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
627	NC_011653	AGA	2	6	311340	311345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_011653	CGT	2	6	311462	311467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011653	A	7	7	311468	311474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011653	TAC	2	6	311486	311491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011653	TTG	2	6	311761	311766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011653	TTG	2	6	311846	311851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011653	ATG	2	6	311886	311891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011653	ATA	2	6	311898	311903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011653	TCA	2	6	311908	311913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011653	TTA	2	6	311943	311948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011653	ATTT	2	8	311959	311966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_011653	A	7	7	312012	312018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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