MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 5631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011653	T	7	7	1996632	1996638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_011653	ATT	2	6	1996661	1996666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011653	AAAT	2	8	1996679	1996686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_011653	T	7	7	1996691	1996697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011653	TAT	2	6	1996715	1996720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_011653	AGTTGA	2	12	1996723	1996734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011653	TTA	2	6	1996743	1996748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011653	CTAT	2	8	1996755	1996762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_011653	A	6	6	1996773	1996778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011653	GAT	2	6	1996784	1996789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_011653	ATT	2	6	1996806	1996811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_011653	GAG	2	6	1996873	1996878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_011653	GA	3	6	2000318	2000323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_011653	TA	3	6	2003650	2003655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_011653	TTC	2	6	2003672	2003677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_011653	GTTT	2	8	2003696	2003703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011653	TAA	2	6	2003734	2003739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_011653	TTACAA	2	12	2003801	2003812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5519	NC_011653	ATT	2	6	2003858	2003863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011653	GTT	2	6	2003882	2003887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011653	AT	3	6	2003900	2003905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011653	CAATA	2	10	2003919	2003928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_011653	A	6	6	2003963	2003968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011653	T	6	6	2003976	2003981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011653	GAA	2	6	2003985	2003990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011653	T	6	6	2003995	2004000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011653	T	7	7	2004027	2004033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011653	AAT	2	6	2004042	2004047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011653	AAT	2	6	2004099	2004104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011653	ATA	2	6	2004110	2004115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011653	AATAG	2	10	2004227	2004236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_011653	A	7	7	2004255	2004261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_011653	A	6	6	2004263	2004268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011653	TA	3	6	2004273	2004278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011653	A	6	6	2004294	2004299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5537	NC_011653	AATA	2	8	2004751	2004758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_011653	TAA	2	6	2004812	2004817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011653	TAT	2	6	2004861	2004866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011653	ATTT	2	8	2004910	2004917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011653	TTTTA	2	10	2005065	2005074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_011653	ATA	2	6	2005086	2005091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_011653	TCTA	2	8	2005099	2005106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_011653	ACT	2	6	2005117	2005122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5547	NC_011653	TAT	2	6	2005171	2005176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011653	ATA	2	6	2005177	2005182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_011653	ATA	2	6	2005193	2005198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011653	GGT	2	6	2005209	2005214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5559	NC_011653	TTA	3	9	2006684	2006692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5562	NC_011653	AT	3	6	2006796	2006801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_011653	TA	4	8	2006807	2006814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_011653	A	6	6	2006822	2006827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5630	NC_011653	CTA	3	9	2011013	2011021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_011653	TAAAAA	2	12	2011057	2011068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.