MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	AT	3	6	12771	12776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011296	AT	3	6	22296	22301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011296	TA	3	6	38055	38060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011296	AT	3	6	49209	49214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011296	AT	3	6	55818	55823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011296	TA	3	6	55872	55877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011296	TC	3	6	62076	62081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011296	CT	3	6	62323	62328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011296	AG	3	6	62330	62335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011296	AT	3	6	62468	62473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011296	AG	3	6	62656	62661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011296	GA	3	6	81233	81238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011296	GA	3	6	81517	81522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011296	AT	3	6	81640	81645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011296	TC	3	6	86742	86747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011296	TA	3	6	91064	91069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011296	GA	3	6	91957	91962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011296	AT	4	8	91981	91988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011296	AT	4	8	92410	92417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011296	TC	3	6	131310	131315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011296	TA	3	6	131404	131409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011296	CA	3	6	131420	131425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011296	TA	3	6	177621	177626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011296	TA	3	6	177773	177778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011296	TA	3	6	178669	178674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011296	AT	3	6	178868	178873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011296	TA	3	6	185453	185458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011296	TA	3	6	191099	191104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011296	AG	3	6	197255	197260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011296	AT	3	6	198989	198994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011296	AT	4	8	205162	205169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011296	GA	3	6	212090	212095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011296	AT	3	6	213405	213410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011296	TC	3	6	244710	244715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011296	AT	3	6	246961	246966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011296	AG	3	6	247306	247311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011296	AT	3	6	247349	247354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011296	CT	3	6	262296	262301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011296	TA	3	6	281898	281903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011296	TA	3	6	283333	283338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011296	GT	3	6	283428	283433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011296	AG	4	8	284127	284134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011296	TA	3	6	287583	287588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011296	TA	4	8	287694	287701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011296	TA	3	6	287707	287712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011296	AT	3	6	287987	287992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011296	TA	4	8	296667	296674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011296	AT	4	8	303347	303354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011296	AT	3	6	307831	307836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011296	AT	3	6	325622	325627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011296	AT	3	6	325643	325648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011296	AT	3	6	327662	327667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011296	GA	3	6	339156	339161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011296	AT	3	6	339979	339984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011296	TA	3	6	348460	348465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011296	TA	3	6	361806	361811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011296	AG	3	6	408058	408063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011296	GA	3	6	408080	408085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011296	AT	3	6	417430	417435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011296	AT	3	6	421337	421342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011296	TA	3	6	421768	421773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011296	AT	3	6	421850	421855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011296	TA	3	6	425990	425995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011296	GA	3	6	426399	426404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011296	GA	3	6	428283	428288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011296	AG	3	6	432422	432427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011296	AT	3	6	444385	444390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011296	TA	3	6	488305	488310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011296	AG	3	6	488629	488634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011296	AG	3	6	488694	488699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011296	AT	3	6	488895	488900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011296	AG	3	6	488936	488941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011296	AG	3	6	489039	489044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011296	AG	3	6	489071	489076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011296	TC	3	6	509602	509607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011296	GA	3	6	518862	518867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011296	AT	3	6	584806	584811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011296	TG	3	6	591377	591382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011296	CA	3	6	592244	592249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011296	AG	3	6	592356	592361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011296	AT	3	6	631870	631875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011296	CA	3	6	633302	633307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011296	CA	3	6	633636	633641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011296	AT	3	6	634013	634018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011296	GA	3	6	634115	634120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011296	TG	3	6	643172	643177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011296	TA	3	6	648340	648345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011296	TA	3	6	657757	657762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011296	TA	3	6	676478	676483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011296	TA	3	6	686382	686387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011296	TA	3	6	691446	691451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011296	TA	3	6	700250	700255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011296	TC	3	6	705499	705504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011296	AT	3	6	719781	719786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011296	AT	3	6	719820	719825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011296	AT	3	6	727076	727081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011296	AT	3	6	737265	737270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011296	AG	3	6	750715	750720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011296	AT	3	6	767804	767809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011296	AT	3	6	773567	773572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011296	AT	3	6	795770	795775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011296	AT	3	6	796784	796789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011296	AT	4	8	813321	813328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011296	GA	3	6	818436	818441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011296	AT	3	6	834721	834726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011296	CT	3	6	878500	878505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011296	AG	3	6	878517	878522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011296	AT	3	6	903588	903593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011296	AC	3	6	917678	917683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011296	AC	3	6	917848	917853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011296	GA	3	6	919600	919605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011296	TC	3	6	919620	919625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011296	TG	3	6	920524	920529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011296	CT	3	6	931991	931996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011296	AG	3	6	936394	936399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011296	TC	3	6	942256	942261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011296	AG	3	6	942522	942527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011296	TA	3	6	948371	948376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011296	TA	4	8	963028	963035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011296	TA	3	6	965933	965938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011296	TA	3	6	965967	965972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011296	GA	3	6	966793	966798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011296	AT	3	6	974962	974967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011296	TA	4	8	980319	980326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011296	TA	3	6	983343	983348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011296	TA	3	6	989190	989195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011296	TA	3	6	993498	993503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011296	AG	3	6	993575	993580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011296	AT	3	6	1006107	1006112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_011296	AT	3	6	1022980	1022985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011296	AG	3	6	1024992	1024997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011296	CT	3	6	1025011	1025016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011296	GA	3	6	1025043	1025048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011296	TA	3	6	1025970	1025975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011296	AT	4	8	1029148	1029155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_011296	TC	3	6	1046795	1046800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011296	GT	3	6	1047328	1047333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011296	TA	3	6	1048441	1048446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011296	AT	3	6	1048484	1048489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011296	AC	3	6	1048602	1048607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_011296	CT	3	6	1076118	1076123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011296	CA	4	8	1076404	1076411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011296	TA	3	6	1119513	1119518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011296	AT	3	6	1128248	1128253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011296	GA	3	6	1130147	1130152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.