MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 3245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011296	G	6	6	295878	295883	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011296	CCA	2	6	295984	295989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_011296	CAC	2	6	295990	295995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_011296	TGA	2	6	296110	296115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011296	TAC	2	6	296129	296134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011296	ATTA	2	8	296206	296213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011296	TAG	2	6	296215	296220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011296	AGG	2	6	296234	296239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011296	TA	4	8	296667	296674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011296	ATTA	2	8	298794	298801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011296	TAG	2	6	298802	298807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011296	AGG	2	6	298840	298845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011296	TAA	2	6	299992	299997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011296	CAA	2	6	300031	300036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011296	AGG	2	6	300037	300042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011296	AGG	2	6	300402	300407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011296	AGGC	2	8	300717	300724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
518	NC_011296	GCCT	2	8	300731	300738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_011296	A	6	6	300752	300757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011296	C	6	6	303001	303006	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
521	NC_011296	T	6	6	303039	303044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011296	TAGT	2	8	303056	303063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011296	ACC	2	6	303091	303096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_011296	ACC	2	6	303099	303104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011296	CGCT	2	8	303108	303115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_011296	GATT	2	8	303154	303161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011296	CGCT	2	8	303181	303188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_011296	T	7	7	303285	303291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011296	ACAT	2	8	303307	303314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_011296	AT	4	8	303347	303354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011296	A	6	6	303372	303377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011296	AGG	2	6	303384	303389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011296	CAA	2	6	304017	304022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011296	AGG	3	9	304023	304031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011296	ACC	2	6	305184	305189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_011296	TAA	2	6	305220	305225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011296	GAG	2	6	305242	305247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011296	CTAT	2	8	306061	306068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_011296	AAACG	2	10	306075	306084	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_011296	ATGA	2	8	306114	306121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011296	TAC	2	6	306156	306161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011296	CCA	2	6	306200	306205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_011296	AAG	2	6	306246	306251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011296	TGA	2	6	306594	306599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011296	T	7	7	306600	306606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011296	CAAG	2	8	306634	306641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_011296	GAA	2	6	306655	306660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011296	TGG	2	6	307739	307744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011296	AT	3	6	307831	307836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011296	ATTT	2	8	307841	307848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011296	T	6	6	307874	307879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011296	A	6	6	307891	307896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011296	A	6	6	321453	321458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011296	T	8	8	322905	322912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011296	ATA	2	6	322922	322927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011296	AT	3	6	325622	325627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011296	AT	3	6	325643	325648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011296	CAA	2	6	325654	325659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011296	AAT	2	6	326076	326081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_011296	TCGCT	2	10	327414	327423	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
562	NC_011296	TTA	2	6	327442	327447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011296	GAG	2	6	327490	327495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011296	TCG	2	6	327501	327506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011296	AAG	2	6	327526	327531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011296	A	6	6	327622	327627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011296	AT	3	6	327662	327667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011296	A	6	6	327674	327679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011296	T	6	6	327680	327685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011296	A	7	7	335632	335638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011296	AGA	2	6	335663	335668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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574	NC_011296	GATA	2	8	338612	338619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011296	T	6	6	338628	338633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_011296	GAA	2	6	338686	338691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011296	GAT	2	6	338710	338715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_011296	AAAGG	2	10	339142	339151	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011296	GA	3	6	339156	339161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_011296	GGA	2	6	339172	339177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011296	TGG	2	6	339208	339213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_011296	TAA	2	6	339947	339952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011296	AT	3	6	339979	339984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011296	AGA	2	6	339986	339991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011296	GAG	2	6	339994	339999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011296	T	7	7	343350	343356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011296	TTTAA	2	10	343382	343391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011296	A	6	6	343447	343452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011296	GGA	2	6	343455	343460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011296	CTTA	2	8	343561	343568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_011296	ATA	2	6	343626	343631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011296	TAAT	2	8	345739	345746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011296	AGG	2	6	347859	347864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_011296	AGT	3	9	348384	348392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011296	TA	3	6	348460	348465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011296	TCT	2	6	349338	349343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011296	AAG	2	6	349388	349393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_011296	TGC	2	6	349457	349462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011296	CAGC	2	8	349464	349471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
608	NC_011296	TTA	2	6	349514	349519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011296	GGA	2	6	351697	351702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011296	CCT	2	6	361726	361731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_011296	TA	3	6	361806	361811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011296	ATT	2	6	361814	361819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011296	T	6	6	363748	363753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011296	TTAT	2	8	372333	372340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011296	TTC	2	6	372341	372346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011296	T	7	7	372359	372365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011296	T	7	7	372387	372393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011296	TTTC	2	8	372399	372406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_011296	CCT	2	6	372437	372442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_011296	CAA	2	6	372490	372495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011296	ATT	2	6	378120	378125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011296	TAT	2	6	378142	378147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011296	GGTT	3	12	378159	378170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011296	TGT	2	6	378177	378182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011296	A	6	6	378194	378199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011296	AAG	2	6	378202	378207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011296	ATC	2	6	378217	378222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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629	NC_011296	T	6	6	378290	378295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011296	AGG	2	6	378300	378305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011296	AAG	2	6	379738	379743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011296	TAT	2	6	382768	382773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011296	CTC	2	6	388699	388704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_011296	TCC	2	6	391401	391406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_011296	T	6	6	394712	394717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011296	GAA	2	6	394766	394771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011296	CTC	2	6	394788	394793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_011296	GGA	2	6	394866	394871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011296	CTT	2	6	394909	394914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_011296	AGA	2	6	395079	395084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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