MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010741	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010741	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010741	G	6	6	8818	8823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010741	T	6	6	9668	9673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010741	T	7	7	13926	13932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010741	T	6	6	21533	21538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010741	G	6	6	24736	24741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010741	A	6	6	24816	24821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010741	G	6	6	24863	24868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010741	A	6	6	25001	25006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010741	G	6	6	29048	29053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010741	C	9	9	34067	34075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_010741	T	9	9	38235	38243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010741	T	6	6	42884	42889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010741	A	6	6	55526	55531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010741	T	6	6	59469	59474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010741	T	10	10	64070	64079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010741	G	7	7	71765	71771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010741	C	6	6	73830	73835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_010741	T	6	6	78565	78570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010741	T	6	6	78586	78591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010741	A	6	6	93041	93046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010741	C	9	9	94705	94713	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_010741	A	6	6	111747	111752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010741	T	6	6	113730	113735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010741	G	6	6	121963	121968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010741	A	6	6	122133	122138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010741	A	6	6	122193	122198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010741	C	10	10	122213	122222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_010741	T	6	6	132816	132821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010741	C	10	10	136720	136729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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33	NC_010741	A	6	6	142958	142963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010741	C	9	9	154179	154187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_010741	A	6	6	169715	169720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010741	T	8	8	170138	170145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010741	T	6	6	170284	170289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010741	T	7	7	182507	182513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010741	G	6	6	192117	192122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010741	G	6	6	192655	192660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010741	A	6	6	219129	219134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010741	T	6	6	222637	222642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010741	A	6	6	222741	222746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010741	A	6	6	233925	233930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010741	T	6	6	244312	244317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47	NC_010741	G	6	6	246750	246755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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49	NC_010741	T	8	8	259045	259052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52	NC_010741	A	7	7	287239	287245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_010741	T	8	8	422963	422970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_010741	A	6	6	745323	745328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_010741	A	7	7	831949	831955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.