MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 2625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010483	ACCTC	2	10	1107969	1107978	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1502	NC_010483	ATA	2	6	1107992	1107997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010483	AAG	2	6	1108003	1108008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010483	AGG	2	6	1108060	1108065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010483	A	6	6	1108066	1108071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010483	T	6	6	1110074	1110079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010483	GAC	2	6	1110092	1110097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010483	ACC	2	6	1110114	1110119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_010483	CAC	2	6	1110151	1110156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_010483	GA	3	6	1116614	1116619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010483	GAA	2	6	1116621	1116626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010483	GAGG	2	8	1116659	1116666	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010483	AAC	2	6	1116737	1116742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010483	AGGA	2	8	1116758	1116765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010483	TCA	2	6	1116790	1116795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_010483	A	6	6	1116812	1116817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010483	AG	3	6	1116826	1116831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010483	GAA	2	6	1116837	1116842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010483	AGA	2	6	1116849	1116854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010483	ACC	2	6	1122720	1122725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_010483	ACA	2	6	1124704	1124709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_010483	CCT	2	6	1124713	1124718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_010483	TAA	2	6	1124731	1124736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010483	TAA	2	6	1124748	1124753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010483	TGT	2	6	1124762	1124767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010483	ATT	2	6	1124817	1124822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010483	AT	3	6	1124848	1124853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010483	ATTT	2	8	1124856	1124863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010483	ATT	2	6	1124867	1124872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010483	GTG	2	6	1124901	1124906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010483	A	7	7	1124922	1124928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010483	CCG	2	6	1124945	1124950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_010483	AG	3	6	1124963	1124968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010483	CCT	2	6	1125600	1125605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_010483	A	7	7	1125645	1125651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010483	T	6	6	1125659	1125664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010483	TTGA	2	8	1126723	1126730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010483	TAA	4	12	1126750	1126761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010483	AGG	2	6	1126776	1126781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010483	TTTTTC	2	12	1140036	1140047	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1541	NC_010483	A	6	6	1140051	1140056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010483	A	6	6	1140072	1140077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010483	TCT	2	6	1140097	1140102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_010483	CGT	2	6	1153391	1153396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_010483	CCT	2	6	1153401	1153406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_010483	CTT	2	6	1153446	1153451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010483	A	7	7	1153475	1153481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010483	AGG	2	6	1153486	1153491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010483	CCT	3	9	1157441	1157449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_010483	AGG	2	6	1163506	1163511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010483	G	6	6	1164983	1164988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010483	AG	3	6	1168258	1168263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010483	CAC	2	6	1168287	1168292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_010483	GA	3	6	1168297	1168302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010483	GAA	2	6	1168306	1168311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010483	TTG	2	6	1168322	1168327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010483	A	6	6	1168329	1168334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010483	A	6	6	1168371	1168376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010483	AGA	2	6	1168396	1168401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010483	AGA	2	6	1168460	1168465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010483	GAAAC	2	10	1168482	1168491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1562	NC_010483	GGA	2	6	1168511	1168516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010483	GAA	2	6	1168520	1168525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010483	TACG	2	8	1168542	1168549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_010483	AG	3	6	1168617	1168622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010483	AGG	2	6	1168624	1168629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010483	GAA	2	6	1168632	1168637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010483	GGT	2	6	1169115	1169120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010483	ATC	2	6	1175932	1175937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_010483	AGG	2	6	1175962	1175967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010483	CCT	2	6	1178217	1178222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_010483	TGA	2	6	1178231	1178236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010483	CCT	2	6	1182404	1182409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_010483	TCT	2	6	1182469	1182474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010483	A	6	6	1190317	1190322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010483	CTC	2	6	1190325	1190330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_010483	ATT	2	6	1190589	1190594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010483	GAAA	2	8	1190645	1190652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010483	CCT	2	6	1190896	1190901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_010483	ATCA	2	8	1190920	1190927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_010483	GTA	2	6	1191002	1191007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010483	TGA	2	6	1191027	1191032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_010483	AT	4	8	1192769	1192776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010483	AT	3	6	1192786	1192791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_010483	AGG	2	6	1192792	1192797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010483	GGT	2	6	1193101	1193106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010483	TGG	2	6	1193128	1193133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010483	ATGG	2	8	1193147	1193154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010483	AGA	2	6	1193155	1193160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010483	TGG	2	6	1193215	1193220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010483	TTC	2	6	1194096	1194101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_010483	TCT	2	6	1194117	1194122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_010483	CCGCTA	2	12	1194175	1194186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_010483	TC	3	6	1194208	1194213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_010483	CCAT	2	8	1194243	1194250	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_010483	T	6	6	1194335	1194340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010483	TTC	2	6	1194353	1194358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_010483	CCT	2	6	1194420	1194425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_010483	TGG	2	6	1194454	1194459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010483	CTC	2	6	1195681	1195686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_010483	ACA	2	6	1195712	1195717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010483	TTCT	2	8	1195803	1195810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_010483	TTTC	2	8	1195824	1195831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_010483	TCTT	2	8	1195885	1195892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_010483	ATG	2	6	1195972	1195977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010483	TCC	2	6	1195992	1195997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_010483	AGAA	2	8	1196009	1196016	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010483	TCT	2	6	1196069	1196074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_010483	TCC	2	6	1196076	1196081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_010483	CTGTC	2	10	1196147	1196156	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1611	NC_010483	TTC	2	6	1196166	1196171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_010483	GTA	2	6	1196232	1196237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010483	TTC	3	9	1196238	1196246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_010483	TG	3	6	1196285	1196290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010483	CTT	2	6	1196318	1196323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_010483	TTC	2	6	1196331	1196336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_010483	T	7	7	1196341	1196347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010483	CTT	2	6	1196354	1196359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_010483	TCT	2	6	1196453	1196458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_010483	CGA	2	6	1196504	1196509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_010483	ATC	2	6	1196546	1196551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010483	C	6	6	1196551	1196556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1623	NC_010483	GC	3	6	1199337	1199342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_010483	CCG	2	6	1199362	1199367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_010483	TGG	2	6	1199461	1199466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_010483	TTTC	2	8	1199498	1199505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_010483	CCG	2	6	1199556	1199561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_010483	TGTTTT	2	12	1199649	1199660	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010483	A	6	6	1199675	1199680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010483	CTA	2	6	1199750	1199755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_010483	ATCG	2	8	1199795	1199802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1633	NC_010483	AAC	2	6	1199853	1199858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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