MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 2625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010483	G	6	6	790275	790280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010483	TTC	2	6	790367	790372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010483	TAA	2	6	790416	790421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010483	CTT	2	6	793544	793549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010483	CCT	2	6	805239	805244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_010483	TAA	2	6	805264	805269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010483	CCT	2	6	813610	813615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_010483	AACC	2	8	813673	813680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_010483	C	6	6	815388	815393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1010	NC_010483	T	6	6	815412	815417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010483	G	6	6	815419	815424	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010483	T	6	6	815907	815912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010483	A	6	6	815934	815939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010483	CCT	2	6	818963	818968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_010483	TC	3	6	818979	818984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_010483	ACA	2	6	818995	819000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010483	ATC	2	6	819012	819017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_010483	CA	3	6	819080	819085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_010483	ATT	2	6	819088	819093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010483	ATG	2	6	819099	819104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010483	CCT	2	6	821703	821708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_010483	TG	3	6	821721	821726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010483	TTA	2	6	821743	821748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010483	TGG	2	6	821771	821776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010483	GTA	2	6	821796	821801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010483	AT	3	6	821863	821868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010483	GCAAA	2	10	821869	821878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_010483	ACC	2	6	821882	821887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_010483	GGT	2	6	821922	821927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010483	TCA	2	6	821943	821948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010483	ACAA	2	8	821968	821975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_010483	ACC	2	6	822035	822040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_010483	TACC	2	8	822083	822090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_010483	TACC	2	8	822094	822101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_010483	GGT	2	6	822107	822112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010483	ATT	2	6	822124	822129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010483	TCA	2	6	822137	822142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010483	ACC	2	6	822177	822182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_010483	TAT	2	6	822192	822197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010483	TAC	3	9	822199	822207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010483	TAA	2	6	822208	822213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010483	GGT	2	6	822239	822244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010483	GA	3	6	826123	826128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010483	CCT	2	6	828562	828567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_010483	AAT	2	6	828570	828575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010483	TCT	2	6	828582	828587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010483	A	7	7	828593	828599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010483	CCT	2	6	828630	828635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_010483	AGGC	2	8	828643	828650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_010483	GC	3	6	828649	828654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_010483	TCT	2	6	828727	828732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010483	ATA	2	6	828734	828739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010483	TAT	3	9	828740	828748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010483	AAAG	2	8	833174	833181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010483	C	6	6	840051	840056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1056	NC_010483	GGC	2	6	840182	840187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010483	CTC	2	6	841422	841427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_010483	TGCAAA	2	12	848076	848087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1059	NC_010483	TAC	2	6	848107	848112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010483	AC	3	6	848111	848116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_010483	TGA	2	6	848153	848158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010483	TAT	2	6	848198	848203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010483	ATGG	2	8	848216	848223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010483	TCG	2	6	848236	848241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010483	TTC	2	6	848250	848255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010483	T	6	6	848258	848263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010483	AGG	2	6	848308	848313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010483	CTCC	2	8	853350	853357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1069	NC_010483	T	6	6	853360	853365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010483	AAC	2	6	853366	853371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010483	T	6	6	853382	853387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010483	CTC	2	6	857298	857303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_010483	ACCC	2	8	859028	859035	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_010483	TCC	2	6	860001	860006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_010483	CCT	2	6	861178	861183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_010483	TCC	2	6	862328	862333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_010483	TCT	2	6	862352	862357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010483	ATTA	2	8	862359	862366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010483	AAT	2	6	862376	862381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010483	TGT	2	6	862403	862408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010483	TAA	2	6	865234	865239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010483	ATT	2	6	865278	865283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010483	GGA	2	6	869985	869990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010483	GGT	2	6	883035	883040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010483	CTT	2	6	889127	889132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010483	CCT	2	6	889133	889138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_010483	ATA	2	6	889165	889170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010483	AGG	2	6	889180	889185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010483	CCTC	2	8	893883	893890	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1090	NC_010483	GCC	2	6	893946	893951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_010483	GAT	2	6	894020	894025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010483	ACC	2	6	894061	894066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_010483	AGGG	2	8	894103	894110	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010483	CTC	2	6	900059	900064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010483	CTC	2	6	903935	903940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_010483	C	6	6	903966	903971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1097	NC_010483	T	6	6	905910	905915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010483	T	6	6	905964	905969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010483	ATT	2	6	906003	906008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010483	TCT	2	6	906027	906032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010483	T	6	6	906032	906037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010483	T	6	6	906041	906046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010483	AGG	2	6	906083	906088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010483	CCT	2	6	911509	911514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_010483	TAA	2	6	911528	911533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010483	A	6	6	911541	911546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010483	TCT	2	6	912332	912337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010483	CAAT	2	8	912345	912352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_010483	TAA	2	6	912355	912360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010483	G	6	6	913769	913774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010483	C	6	6	914234	914239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_010483	G	6	6	914248	914253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010483	CA	3	6	917447	917452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_010483	AACC	2	8	917470	917477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_010483	ATC	2	6	917495	917500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010483	T	6	6	917510	917515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010483	A	6	6	917522	917527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010483	CTT	2	6	917533	917538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_010483	A	6	6	917543	917548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010483	ATT	2	6	917556	917561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010483	AAT	2	6	917603	917608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010483	ATTC	2	8	917682	917689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_010483	AAG	2	6	917691	917696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010483	GAG	2	6	917745	917750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010483	GAG	2	6	919867	919872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010483	AGGG	2	8	923914	923921	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010483	T	7	7	930416	930422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010483	A	6	6	930436	930441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010483	ATC	3	9	930456	930464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_010483	AT	3	6	930480	930485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010483	AT	3	6	930495	930500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010483	GCTT	2	8	931320	931327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_010483	CCT	2	6	931405	931410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_010483	A	6	6	931458	931463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010483	AGA	2	6	931548	931553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010483	AGG	2	6	931561	931566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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