MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 2625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010483	CTT	2	6	500072	500077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010483	CAAA	2	8	500080	500087	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_010483	AAG	2	6	500133	500138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010483	CCT	2	6	505969	505974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_010483	CGAA	2	8	510114	510121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_010483	AAGG	2	8	510128	510135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010483	C	6	6	510145	510150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
508	NC_010483	TGA	2	6	512142	512147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010483	CGGG	2	8	512152	512159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
510	NC_010483	GA	3	6	512173	512178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010483	TCCC	2	8	513282	513289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
512	NC_010483	AC	4	8	513375	513382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_010483	AAT	2	6	513383	513388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010483	ATCG	2	8	513417	513424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_010483	TTC	2	6	513425	513430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010483	AGG	2	6	513515	513520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010483	C	6	6	514816	514821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
518	NC_010483	GAG	2	6	514848	514853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010483	GAG	2	6	516562	516567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010483	AGG	2	6	521856	521861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010483	CAA	2	6	521862	521867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010483	AGG	2	6	524069	524074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010483	AGG	2	6	524995	525000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010483	GCC	2	6	525052	525057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_010483	AGA	2	6	525158	525163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010483	TAA	2	6	525185	525190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010483	ATA	2	6	525233	525238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010483	AGG	2	6	525244	525249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010483	TCT	2	6	526357	526362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010483	T	7	7	526362	526368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010483	TTG	3	9	526373	526381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010483	CTG	2	6	526383	526388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010483	TCA	2	6	526433	526438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010483	CAAA	2	8	531159	531166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_010483	GTA	2	6	531196	531201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010483	CGT	2	6	531218	531223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010483	A	6	6	531238	531243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010483	GAG	2	6	531246	531251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010483	TCC	2	6	531257	531262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_010483	CCT	2	6	531624	531629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_010483	CCT	2	6	532945	532950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_010483	TGTT	2	8	532962	532969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010483	A	7	7	533030	533036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010483	TTGGA	2	10	533080	533089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010483	TATT	2	8	533090	533097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010483	GGA	2	6	533122	533127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010483	A	6	6	533155	533160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010483	TCG	2	6	533226	533231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010483	GGGA	2	8	533232	533239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010483	TCA	2	6	535655	535660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010483	A	7	7	535704	535710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010483	ACC	2	6	535719	535724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_010483	GTC	2	6	535774	535779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010483	CGG	2	6	535791	535796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010483	TGG	2	6	535810	535815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010483	TCC	2	6	535825	535830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_010483	CCAG	2	8	535835	535842	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
558	NC_010483	ATGCA	2	10	535850	535859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
559	NC_010483	AATT	2	8	535886	535893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010483	AAT	2	6	535910	535915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010483	ACTTTT	2	12	535937	535948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
562	NC_010483	GA	3	6	535984	535989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010483	AGG	2	6	536045	536050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010483	TCCC	2	8	543532	543539	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
565	NC_010483	T	6	6	543606	543611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010483	TG	3	6	543699	543704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010483	AAT	2	6	543801	543806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010483	GAT	2	6	543808	543813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010483	CTT	2	6	543913	543918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010483	TCT	2	6	544000	544005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010483	T	6	6	544007	544012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010483	TTCTT	2	10	544020	544029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
573	NC_010483	ATT	2	6	544043	544048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010483	CT	3	6	544077	544082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_010483	TG	3	6	544083	544088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010483	GGA	2	6	544109	544114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010483	A	7	7	544125	544131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010483	ATG	2	6	544221	544226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010483	AAT	2	6	544303	544308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010483	GTTT	2	8	544445	544452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010483	AAAC	2	8	544475	544482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_010483	ACA	2	6	544623	544628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_010483	ACA	2	6	544811	544816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010483	GTC	3	9	544822	544830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010483	TCA	2	6	544836	544841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010483	TCA	3	9	544893	544901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010483	ACC	2	6	545026	545031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_010483	CGG	2	6	545076	545081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_010483	CAA	2	6	545145	545150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010483	CTTG	2	8	545162	545169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_010483	ACC	2	6	545202	545207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_010483	GA	3	6	545224	545229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010483	T	6	6	545266	545271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010483	GAG	2	6	545300	545305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010483	AGT	2	6	546331	546336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010483	CCCT	2	8	548085	548092	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
597	NC_010483	AGG	2	6	548110	548115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010483	AACA	2	8	550649	550656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_010483	CCA	2	6	550677	550682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_010483	T	6	6	550687	550692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010483	AAAC	2	8	550704	550711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_010483	AT	3	6	550716	550721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010483	T	6	6	553262	553267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010483	ATT	3	9	553276	553284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010483	T	6	6	553301	553306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010483	TTG	2	6	557331	557336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010483	ATC	2	6	557349	557354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_010483	ACAAG	2	10	557358	557367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
609	NC_010483	TAT	2	6	557490	557495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010483	CGG	2	6	557689	557694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010483	CCCT	2	8	557802	557809	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
612	NC_010483	TTC	2	6	557887	557892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010483	CTTT	2	8	557897	557904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_010483	AAC	2	6	558016	558021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010483	TGA	2	6	558086	558091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010483	CAC	2	6	558155	558160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010483	GAA	2	6	558217	558222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010483	GAA	2	6	558271	558276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010483	AAG	2	6	558293	558298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010483	AAG	2	6	558302	558307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010483	GCAC	2	8	558367	558374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_010483	ACGA	2	8	558482	558489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_010483	GTT	2	6	558508	558513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010483	AG	3	6	558691	558696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010483	CCT	2	6	558947	558952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_010483	T	6	6	558952	558957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010483	AC	3	6	559037	559042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_010483	T	7	7	559058	559064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010483	TCC	2	6	559075	559080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_010483	AC	3	6	559100	559105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_010483	AG	3	6	559107	559112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010483	AAT	2	6	559141	559146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010483	AAGAA	2	10	559160	559169	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010483	A	6	6	559177	559182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010483	AGA	2	6	559184	559189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010483	AAG	2	6	559271	559276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010483	GT	3	6	559287	559292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010483	CAT	2	6	559334	559339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010483	ATC	2	6	559376	559381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_010483	ATT	2	6	559383	559388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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