MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	GGAGAA	2	12	23980	23991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010321	TAAAAA	2	12	30455	30466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010321	AAAAGC	2	12	38638	38649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010321	TCTTTT	2	12	43529	43540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010321	TTATTT	2	12	43615	43626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010321	TAAAAA	2	12	73726	73737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010321	AAAAAT	2	12	79161	79172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010321	ATTTTT	2	12	121524	121535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010321	GTTCTT	2	12	131768	131779	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010321	TTCAGC	2	12	134430	134441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010321	GTAAAC	2	12	150824	150835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010321	AATGAA	2	12	219735	219746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010321	AAGGAG	2	12	229348	229359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010321	ATAAAT	2	12	256262	256273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010321	GCTATG	2	12	273858	273869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010321	AGCAAA	2	12	277665	277676	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010321	TTTATA	2	12	279858	279869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010321	AGATAT	2	12	294709	294720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010321	TATTAA	2	12	357651	357662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010321	TTTTGC	2	12	376681	376692	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010321	TTTATT	2	12	380717	380728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010321	AAAAAT	2	12	406096	406107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010321	AAGCGA	2	12	441058	441069	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010321	TATTTT	2	12	445987	445998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010321	TATTTT	2	12	459279	459290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010321	TCTGCT	2	12	459388	459399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010321	AATATT	2	12	459571	459582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010321	TTATTT	2	12	466529	466540	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010321	ATAATT	2	12	514163	514174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010321	ATATTT	2	12	526382	526393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010321	TTTTAT	2	12	531506	531517	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010321	ATTTTA	2	12	557609	557620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010321	AATGAA	2	12	579971	579982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010321	AGAAAA	2	12	624412	624423	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010321	TTTTAT	2	12	636571	636582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010321	AATTTT	2	12	648711	648722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010321	TGAAAG	2	12	665149	665160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010321	GCAAGC	2	12	714967	714978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010321	TATTTT	2	12	723101	723112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010321	ATTTTT	2	12	725252	725263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010321	ATTTTT	2	12	739578	739589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010321	TAAAAA	2	12	750209	750220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010321	TAAAAT	2	12	760363	760374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010321	TTTTTA	2	12	789282	789293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010321	ATTTTA	2	12	800334	800345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010321	AAGATT	2	12	806263	806274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010321	AATTTA	2	12	809932	809943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010321	TAAAAT	2	12	815641	815652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010321	TAAAGA	2	12	830394	830405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010321	CTGTAA	2	12	846667	846678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010321	AGATAT	2	12	878876	878887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010321	TGCATT	2	12	906139	906150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010321	TAATAT	2	12	914940	914951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010321	ATAAGA	2	12	915023	915034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010321	ATTTTT	2	12	915243	915254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010321	GAGTTG	2	12	934888	934899	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010321	AAGAGG	2	12	951468	951479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010321	AGAAAC	2	12	953324	953335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010321	CTGTTA	2	12	963697	963708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010321	GAAAAA	2	12	966234	966245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010321	GAATTT	2	12	978270	978281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010321	TTTAAA	2	12	1014000	1014011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010321	GTTTTG	2	12	1014448	1014459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010321	AAAATA	2	12	1033223	1033234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010321	TAAATT	2	12	1034704	1034715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010321	CTTTTT	2	12	1046376	1046387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010321	AAAAAT	2	12	1071126	1071137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010321	TAAAAA	2	12	1102936	1102947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010321	TAAATT	2	12	1170839	1170850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010321	ACTTAT	2	12	1177654	1177665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010321	TATATT	2	12	1181687	1181698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010321	CTATAA	2	12	1188581	1188592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010321	TGCAAT	2	12	1203523	1203534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010321	TAAAAT	2	12	1217537	1217548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010321	ATTTGT	2	12	1339479	1339490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010321	ATTTAC	2	12	1344561	1344572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010321	TAAGAT	2	12	1350984	1350995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010321	TCGCTT	2	12	1372430	1372441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010321	CCTTCA	2	12	1386409	1386420	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010321	TAGATA	2	12	1391265	1391276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010321	AAATTA	2	12	1415918	1415929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010321	AATTAA	2	12	1417760	1417771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010321	TATTTT	2	12	1419203	1419214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010321	TGCAAA	2	12	1427667	1427678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010321	AGTCAA	2	12	1503537	1503548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010321	TCCCCT	2	12	1536293	1536304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010321	TTCTTT	2	12	1540709	1540720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010321	TTAATT	2	12	1610344	1610355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010321	ATAAAT	2	12	1614775	1614786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010321	TAAGGC	2	12	1620179	1620190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010321	TTATCT	2	12	1626700	1626711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010321	ATTTTA	2	12	1647165	1647176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010321	AAAAAT	2	12	1649590	1649601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010321	AAAATG	2	12	1651466	1651477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010321	CCCTTA	2	12	1653403	1653414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010321	TTTCTC	2	12	1667763	1667774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010321	TAAAAG	2	12	1676580	1676591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010321	GCCTTT	2	12	1699782	1699793	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010321	CTTAAC	2	12	1706972	1706983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010321	GCAGTA	2	12	1708313	1708324	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010321	TTTTAT	2	12	1741080	1741091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010321	CTAATC	2	12	1762909	1762920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010321	TAAAAA	2	12	1763067	1763078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010321	CATCCA	2	12	1764916	1764927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010321	ATAGTG	2	12	1774406	1774417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010321	AATAAA	2	12	1789948	1789959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010321	AAATTA	2	12	1829406	1829417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010321	TAAATG	2	12	1841560	1841571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010321	ATACAT	2	12	1846126	1846137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010321	TATTTT	2	12	1869236	1869247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010321	TTTAAA	2	12	1885862	1885873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010321	TGATTA	2	12	1889511	1889522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010321	AAAGGT	2	12	1908607	1908618	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010321	TTTAAT	2	12	1928478	1928489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010321	TATAAG	2	12	1932238	1932249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010321	AATAAA	2	12	2004977	2004988	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010321	TATCTC	2	12	2013795	2013806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010321	GATAAA	2	12	2072572	2072583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010321	AAAAAT	2	12	2105513	2105524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010321	ATTTTT	2	12	2114942	2114953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010321	TTTTAC	2	12	2124212	2124223	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010321	CCCTTT	2	12	2131046	2131057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010321	ATAAAA	2	12	2152531	2152542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010321	ATTTTA	2	12	2167220	2167231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010321	ATAATT	2	12	2175371	2175382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010321	TTTTAA	2	12	2194328	2194339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010321	TCGCTT	2	12	2222781	2222792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010321	TCAACA	2	12	2226092	2226103	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010321	TCAATA	2	12	2261559	2261570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010321	TCGCTT	2	12	2264856	2264867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010321	TTTTTA	2	12	2276861	2276872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010321	TTAATC	2	12	2321461	2321472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010321	ATCCAT	2	12	2343827	2343838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010321	TAAAAA	2	12	2356047	2356058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.