MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010320	CTTAT	2	10	1700	1709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010320	TATAT	2	10	9027	9036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010320	ATAAA	2	10	9154	9163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010320	ATTGT	2	10	34744	34753	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010320	AAAAG	2	10	35928	35937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010320	AAGTT	2	10	43854	43863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010320	ACCTT	2	10	45028	45037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010320	TCGTG	2	10	45081	45090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010320	GAAGC	2	10	45267	45276	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010320	GGGAG	2	10	46160	46169	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010320	TTTAA	2	10	50345	50354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010320	ATAAA	2	10	61838	61847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010320	ATTTG	2	10	64146	64155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010320	AATCC	2	10	64232	64241	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010320	AGGAA	2	10	66087	66096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010320	CAAAT	2	10	70639	70648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010320	TAAAT	2	10	70679	70688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010320	CAAAA	2	10	78158	78167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010320	CCCAA	2	10	103518	103527	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010320	AAACT	2	10	109285	109294	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010320	GTATC	2	10	118589	118598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010320	AGCTA	2	10	121578	121587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010320	ATTAT	2	10	130901	130910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010320	AAAAT	2	10	133295	133304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010320	TAAAT	2	10	135086	135095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010320	AAAAT	2	10	146337	146346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010320	ATTTA	2	10	147401	147410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010320	TTATT	2	10	149405	149414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010320	AATAA	2	10	156565	156574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010320	AATAA	2	10	169444	169453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010320	TAAAA	2	10	185725	185734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010320	TTGGC	2	10	197334	197343	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010320	TTTAA	2	10	199236	199245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010320	AAAAG	2	10	199577	199586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010320	CAAAG	2	10	203849	203858	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010320	AATTT	2	10	219600	219609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010320	TATAA	2	10	230416	230425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010320	TAAAA	2	10	236266	236275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010320	TTTTA	2	10	245935	245944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010320	TTTAT	2	10	249539	249548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010320	AATTA	2	10	254400	254409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010320	TTTTA	2	10	263521	263530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010320	GTTTT	2	10	263546	263555	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010320	ATATA	2	10	272871	272880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010320	CTTTT	2	10	293345	293354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010320	TATTT	2	10	294412	294421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010320	ATTTT	2	10	303562	303571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010320	TTACT	2	10	304598	304607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010320	TATAG	2	10	304752	304761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010320	TATTT	2	10	341686	341695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010320	TTATC	2	10	343212	343221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010320	AATTT	2	10	343645	343654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010320	ATCAA	2	10	346165	346174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010320	GAAAA	2	10	346757	346766	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010320	AAATA	2	10	349638	349647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010320	TAGAA	2	10	349729	349738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010320	CAAAA	2	10	350016	350025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010320	GTTCT	2	10	354550	354559	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010320	ACATT	2	10	354622	354631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010320	GAAAA	2	10	365212	365221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010320	GAAAA	2	10	367352	367361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010320	GAGCA	2	10	370884	370893	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010320	ATTTT	2	10	371002	371011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010320	CAAAA	2	10	371600	371609	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010320	ATTAA	2	10	380111	380120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010320	TACCA	2	10	396514	396523	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010320	GAGGT	2	10	397702	397711	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010320	AAAGA	2	10	411505	411514	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010320	AATAA	2	10	411547	411556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010320	ATTTA	2	10	429785	429794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010320	TCCCG	2	10	444212	444221	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_010320	TTATA	2	10	445146	445155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010320	TTAAT	2	10	463084	463093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010320	AAAAG	2	10	463112	463121	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010320	TATAA	2	10	480053	480062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010320	AGGAG	2	10	480633	480642	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010320	TAGCG	2	10	484324	484333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010320	TTATT	2	10	486873	486882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010320	CTTTG	2	10	487575	487584	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010320	TTTAG	2	10	487732	487741	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010320	ATATA	2	10	487911	487920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010320	TTTGT	2	10	495711	495720	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010320	TTATT	2	10	497198	497207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010320	AATAA	2	10	503281	503290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010320	TGAGG	2	10	510765	510774	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010320	GTGAA	2	10	514473	514482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010320	TTTTA	2	10	514714	514723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010320	GGTGG	2	10	517904	517913	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010320	AGTTT	2	10	522457	522466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010320	AAAAG	2	10	533340	533349	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010320	AAATC	2	10	545920	545929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010320	AATAA	2	10	549201	549210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010320	AATTA	2	10	554149	554158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010320	AAAGG	2	10	558718	558727	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010320	AAAAT	2	10	562358	562367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010320	ATGAA	2	10	572495	572504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010320	TTGTA	2	10	575469	575478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010320	ATCAA	2	10	577894	577903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010320	GAGAT	2	10	579984	579993	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010320	AAAAG	2	10	587414	587423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010320	TAAAA	2	10	587529	587538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010320	ATTTA	2	10	589310	589319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010320	TAACT	2	10	589591	589600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010320	CTCAC	2	10	589809	589818	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_010320	TTATT	2	10	589827	589836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010320	AAAGT	2	10	594126	594135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010320	AATTA	2	10	618514	618523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010320	CATAA	2	10	632504	632513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010320	TAAAA	2	10	632815	632824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010320	TAAAA	2	10	648858	648867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010320	ATATA	2	10	649568	649577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010320	TATAG	2	10	650923	650932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010320	ATTTT	2	10	655939	655948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010320	AAAAT	2	10	660779	660788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010320	GAAGT	2	10	668111	668120	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010320	TGAGG	2	10	670456	670465	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010320	ATAAA	2	10	672389	672398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010320	TAAAA	2	10	686271	686280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010320	TAAAT	2	10	686293	686302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010320	AAAGC	2	10	703089	703098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010320	AGAAA	2	10	703284	703293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010320	ATGGA	2	10	703355	703364	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010320	GGCTT	2	10	704366	704375	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010320	GATGG	2	10	704607	704616	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010320	TAATT	2	10	720403	720412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010320	ATATA	2	10	727180	727189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010320	TAGAA	2	10	734365	734374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010320	AAGTA	2	10	735332	735341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010320	ATAAA	2	10	736677	736686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010320	CAAAA	2	10	751971	751980	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010320	ATTAA	2	10	761487	761496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010320	TCGCC	2	10	761641	761650	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_010320	TAAAA	2	10	761781	761790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010320	GCAGG	2	10	761881	761890	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010320	CTGTT	2	10	761895	761904	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010320	ATTTT	2	10	764837	764846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010320	GTTTT	2	10	767448	767457	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010320	TATTT	2	10	772587	772596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010320	CTTTT	2	10	773315	773324	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010320	AATAA	2	10	776535	776544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010320	ATAAA	2	10	790583	790592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010320	CTGTT	2	10	804557	804566	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010320	TTTCT	2	10	815232	815241	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010320	ATAAA	2	10	820833	820842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010320	TTAAG	2	10	820932	820941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010320	GATAT	2	10	825547	825556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010320	TAAAA	2	10	833616	833625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010320	GACTT	2	10	841887	841896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.