MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009486	GT	3	6	10989	10994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009486	AC	3	6	40149	40154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009486	GA	3	6	40237	40242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009486	AC	3	6	50924	50929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009486	TA	3	6	50933	50938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009486	CT	3	6	68647	68652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009486	AT	4	8	68757	68764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009486	TG	3	6	68832	68837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009486	TG	3	6	94043	94048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009486	CT	3	6	106538	106543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009486	AG	3	6	106554	106559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009486	TC	5	10	111860	111869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009486	AC	3	6	111888	111893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009486	TC	3	6	116608	116613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009486	AT	3	6	131096	131101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009486	AC	3	6	138156	138161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009486	TG	3	6	138356	138361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009486	AG	3	6	158813	158818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009486	AT	3	6	163467	163472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009486	AT	3	6	169245	169250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009486	CT	3	6	195006	195011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009486	CA	3	6	195091	195096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009486	TG	3	6	222062	222067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009486	AG	3	6	282528	282533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009486	GA	3	6	282592	282597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009486	AC	3	6	294707	294712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009486	CT	3	6	302828	302833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009486	TC	3	6	345037	345042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009486	GT	3	6	345229	345234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009486	TG	3	6	366243	366248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009486	AC	3	6	366396	366401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009486	TC	3	6	366787	366792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009486	AG	3	6	367102	367107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009486	CT	3	6	391762	391767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009486	TC	3	6	391983	391988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009486	GA	3	6	392009	392014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009486	AG	3	6	392020	392025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009486	TC	3	6	403631	403636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009486	TC	3	6	436932	436937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009486	TC	3	6	457156	457161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009486	GA	3	6	515737	515742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009486	TG	3	6	523452	523457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009486	CT	3	6	523830	523835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009486	TG	3	6	523836	523841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009486	AT	3	6	529746	529751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009486	CT	3	6	533908	533913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009486	GT	3	6	536515	536520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009486	AC	3	6	537309	537314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009486	AG	3	6	537316	537321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009486	GT	3	6	537496	537501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009486	AT	3	6	537767	537772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009486	AT	3	6	541607	541612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009486	AT	3	6	541637	541642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009486	TA	5	10	545237	545246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009486	AT	3	6	557967	557972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009486	CA	3	6	568539	568544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009486	TG	3	6	568551	568556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009486	GA	3	6	568607	568612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009486	AC	3	6	568764	568769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009486	AC	3	6	568827	568832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009486	GT	3	6	569014	569019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009486	AT	3	6	569285	569290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009486	AC	3	6	589343	589348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009486	TC	3	6	593755	593760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009486	AC	3	6	601354	601359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009486	AC	3	6	605418	605423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009486	TC	3	6	610907	610912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009486	GA	4	8	611052	611059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009486	TC	3	6	611149	611154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009486	CT	4	8	611393	611400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009486	AC	3	6	614792	614797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009486	AG	3	6	615876	615881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009486	AT	3	6	627258	627263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009486	CA	3	6	630743	630748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009486	TA	3	6	640984	640989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009486	AT	3	6	640990	640995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009486	TC	3	6	656041	656046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009486	GA	4	8	703759	703766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009486	AT	3	6	728009	728014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009486	TC	3	6	732918	732923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009486	AG	3	6	737003	737008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009486	GC	3	6	737204	737209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009486	GC	3	6	737372	737377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009486	TC	3	6	741583	741588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009486	CA	3	6	741595	741600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009486	CT	3	6	741661	741666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009486	TC	3	6	741671	741676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009486	GA	4	8	742213	742220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009486	CA	3	6	742368	742373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009486	AG	3	6	748614	748619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009486	GC	3	6	749853	749858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009486	TG	3	6	752441	752446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009486	GT	3	6	753829	753834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009486	GT	3	6	753998	754003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009486	AC	3	6	754640	754645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009486	TC	3	6	783971	783976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009486	CA	3	6	784072	784077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009486	TG	3	6	786713	786718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009486	AT	3	6	786855	786860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009486	GC	3	6	793641	793646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009486	AC	3	6	813103	813108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009486	CA	3	6	883010	883015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009486	TA	3	6	883118	883123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009486	AT	3	6	896043	896048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009486	AT	3	6	896058	896063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009486	AC	3	6	899364	899369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009486	AG	3	6	909072	909077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009486	CT	3	6	909088	909093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009486	AT	3	6	911830	911835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009486	GA	3	6	921734	921739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009486	GA	3	6	940195	940200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009486	AC	3	6	941292	941297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009486	AC	3	6	941355	941360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009486	AG	3	6	941362	941367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009486	GT	3	6	941542	941547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009486	AT	3	6	946461	946466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009486	AT	3	6	975367	975372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009486	AG	3	6	975641	975646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009486	AG	3	6	978157	978162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009486	TG	3	6	994964	994969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009486	TA	3	6	1005037	1005042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009486	AT	3	6	1010554	1010559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009486	AT	4	8	1010569	1010576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009486	AG	3	6	1049893	1049898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009486	CT	3	6	1068957	1068962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009486	CT	3	6	1069006	1069011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009486	GT	3	6	1071071	1071076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009486	GA	3	6	1071709	1071714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009486	AG	3	6	1071841	1071846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009486	GA	3	6	1072130	1072135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009486	GA	3	6	1102032	1102037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009486	AT	3	6	1102880	1102885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009486	AG	3	6	1105890	1105895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009486	AG	3	6	1106102	1106107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009486	CT	3	6	1107362	1107367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009486	CA	3	6	1108980	1108985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009486	TA	3	6	1117325	1117330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009486	CT	4	8	1117388	1117395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009486	AT	3	6	1117616	1117621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009486	AC	3	6	1118678	1118683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009486	AC	3	6	1118741	1118746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009486	AG	3	6	1118748	1118753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009486	GT	3	6	1118928	1118933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009486	AC	3	6	1119125	1119130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009486	AT	3	6	1129406	1129411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009486	TA	3	6	1129420	1129425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009486	CT	3	6	1142152	1142157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009486	TG	3	6	1147455	1147460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009486	GC	3	6	1147508	1147513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009486	GT	3	6	1147951	1147956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009486	TA	3	6	1150384	1150389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009486	TG	3	6	1171306	1171311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.