MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008698	GCCT	2	8	1310508	1310515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_008698	CCT	2	6	1310535	1310540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_008698	CGACGC	2	12	1310568	1310579	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_008698	GGGAGC	2	12	1310615	1310626	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3005	NC_008698	A	6	6	1310666	1310671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008698	CGGG	2	8	1313006	1313013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_008698	AG	4	8	1313022	1313029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008698	TGA	2	6	1313034	1313039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008698	GGCG	2	8	1313064	1313071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_008698	CTC	2	6	1313087	1313092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_008698	TCG	2	6	1313126	1313131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_008698	GAA	2	6	1313165	1313170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008698	CGT	2	6	1313179	1313184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008698	TGT	2	6	1313215	1313220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008698	CAC	2	6	1313977	1313982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_008698	GCGG	2	8	1314937	1314944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_008698	CCG	2	6	1314992	1314997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_008698	GAA	2	6	1315055	1315060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008698	TCG	2	6	1315269	1315274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008698	CG	4	8	1315273	1315280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_008698	GA	3	6	1315282	1315287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008698	AAG	2	6	1315292	1315297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008698	GCC	2	6	1315332	1315337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_008698	CGT	2	6	1315344	1315349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008698	GAG	2	6	1315488	1315493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3028	NC_008698	CTC	2	6	1323514	1323519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_008698	GCC	2	6	1323532	1323537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_008698	GCCGAC	2	12	1323556	1323567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_008698	GC	3	6	1323900	1323905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_008698	CG	3	6	1323913	1323918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_008698	GCC	2	6	1323980	1323985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3035	NC_008698	A	6	6	1324054	1324059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3040	NC_008698	TCG	2	6	1324698	1324703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_008698	GCG	2	6	1324754	1324759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_008698	GCGCCG	2	12	1331877	1331888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_008698	GCG	2	6	1333559	1333564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_008698	GGC	2	6	1333574	1333579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3047	NC_008698	GGA	2	6	1337298	1337303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_008698	GAG	2	6	1337341	1337346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3052	NC_008698	TGTA	2	8	1337714	1337721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008698	CCG	2	6	1340898	1340903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3055	NC_008698	CG	3	6	1340946	1340951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3060	NC_008698	CCCT	2	8	1342887	1342894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3061	NC_008698	CT	4	8	1342893	1342900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_008698	T	6	6	1344315	1344320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3065	NC_008698	TTA	2	6	1344414	1344419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_008698	CG	3	6	1346573	1346578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_008698	GCC	2	6	1349528	1349533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_008698	AT	3	6	1350450	1350455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_008698	CT	3	6	1354429	1354434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_008698	ATAG	2	8	1358734	1358741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008698	A	6	6	1358751	1358756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008698	TATT	2	8	1359261	1359268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_008698	TTA	2	6	1359444	1359449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_008698	G	6	6	1367886	1367891	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008698	AGCG	2	8	1367945	1367952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3093	NC_008698	CG	4	8	1369588	1369595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_008698	TAC	2	6	1369607	1369612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3096	NC_008698	T	6	6	1369683	1369688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008698	ATT	2	6	1369746	1369751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008698	TA	3	6	1369790	1369795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008698	GC	3	6	1371031	1371036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_008698	GTT	2	6	1371044	1371049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008698	TTC	2	6	1371760	1371765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_008698	GGT	2	6	1374100	1374105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008698	TTC	2	6	1375233	1375238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_008698	TA	3	6	1375260	1375265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008698	TGT	2	6	1375282	1375287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008698	CGG	2	6	1381363	1381368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_008698	AAGTAT	2	12	1382737	1382748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_008698	TGA	2	6	1382816	1382821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008698	TA	3	6	1382874	1382879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008698	GAG	2	6	1383017	1383022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008698	GGA	2	6	1383040	1383045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008698	AGG	2	6	1383059	1383064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008698	CGC	2	6	1383466	1383471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_008698	TGA	2	6	1383485	1383490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008698	GTG	2	6	1383516	1383521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008698	GC	3	6	1385423	1385428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_008698	AT	3	6	1385436	1385441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_008698	AAC	2	6	1385464	1385469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_008698	GAA	2	6	1385478	1385483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008698	GC	4	8	1385505	1385512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_008698	ATT	2	6	1385628	1385633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008698	CGG	2	6	1385707	1385712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_008698	GAA	2	6	1385728	1385733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008698	CG	3	6	1385739	1385744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_008698	GC	4	8	1385747	1385754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_008698	TAA	2	6	1385788	1385793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008698	GAT	2	6	1385882	1385887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008698	GA	3	6	1385891	1385896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008698	ACG	2	6	1385904	1385909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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