MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008698	CCA	2	6	612479	612484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_008698	ATA	2	6	612492	612497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008698	TTC	2	6	612517	612522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008698	ATC	2	6	612548	612553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_008698	GA	3	6	612558	612563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008698	CTTAA	2	10	612601	612610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_008698	AAAG	2	8	612616	612623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008698	CG	3	6	612631	612636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_008698	ATA	2	6	612960	612965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008698	A	6	6	612965	612970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008698	GC	3	6	613038	613043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_008698	CA	4	8	613099	613106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_008698	ACT	2	6	613140	613145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008698	TATG	2	8	613964	613971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008698	TCTCT	2	10	613978	613987	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1516	NC_008698	CGT	2	6	613991	613996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_008698	TAA	2	6	616103	616108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008698	CG	3	6	616114	616119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_008698	AATG	2	8	616126	616133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008698	GC	3	6	616149	616154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_008698	GTG	2	6	616202	616207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008698	TCG	2	6	616212	616217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_008698	TTTTC	2	10	616321	616330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1524	NC_008698	ATTT	2	8	616348	616355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008698	GGTA	2	8	616378	616385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008698	ACG	2	6	619445	619450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_008698	GCC	2	6	619507	619512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_008698	G	6	6	619644	619649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008698	GAT	2	6	619661	619666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008698	CCA	2	6	619680	619685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_008698	CTT	2	6	621206	621211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_008698	CTT	2	6	621216	621221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_008698	TC	3	6	621231	621236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_008698	ATT	2	6	627730	627735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008698	ACC	2	6	627756	627761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_008698	A	7	7	627771	627777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008698	TCA	2	6	630101	630106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_008698	CTA	2	6	630125	630130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008698	GC	3	6	631081	631086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_008698	GGA	2	6	631129	631134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008698	GGA	2	6	632474	632479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008698	TCC	2	6	633392	633397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_008698	CTT	2	6	633440	633445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_008698	CG	3	6	634789	634794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_008698	GC	3	6	634801	634806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_008698	TG	3	6	638393	638398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008698	CG	3	6	638422	638427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_008698	TCT	2	6	639930	639935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_008698	TCT	2	6	639977	639982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008698	CAA	2	6	639985	639990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_008698	GAA	2	6	640014	640019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008698	TACG	2	8	641111	641118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_008698	CG	3	6	641117	641122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_008698	GC	3	6	641536	641541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_008698	T	6	6	641640	641645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008698	GCA	2	6	641730	641735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_008698	GC	3	6	641740	641745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_008698	TCC	2	6	641754	641759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_008698	AGA	2	6	641812	641817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008698	AAG	2	6	641825	641830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008698	TAA	2	6	641878	641883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008698	CG	3	6	641913	641918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_008698	TAA	2	6	641922	641927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008698	T	6	6	641958	641963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008698	TAAT	2	8	642001	642008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1567	NC_008698	TTC	2	6	643449	643454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008698	CCT	2	6	643482	643487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_008698	GAA	2	6	643497	643502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008698	A	7	7	643522	643528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008698	CCT	2	6	643578	643583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_008698	C	6	6	643585	643590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1573	NC_008698	CCT	2	6	643593	643598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_008698	GCACG	2	10	643605	643614	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_008698	AGCC	2	8	643705	643712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_008698	GACCG	2	10	643729	643738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1577	NC_008698	GC	3	6	643744	643749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_008698	CGC	2	6	643754	643759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1582	NC_008698	A	7	7	643854	643860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008698	CAC	2	6	643979	643984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1589	NC_008698	TCT	2	6	645785	645790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_008698	T	6	6	645806	645811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008698	TC	3	6	645826	645831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_008698	TG	3	6	647852	647857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008698	TAC	2	6	647878	647883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_008698	CCA	2	6	648271	648276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_008698	AAGG	2	8	648280	648287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_008698	GCGT	2	8	649807	649814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1601	NC_008698	GGC	2	6	649834	649839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_008698	CG	3	6	652107	652112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_008698	GCC	2	6	652137	652142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_008698	CAG	2	6	652175	652180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_008698	GC	3	6	652224	652229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_008698	CCT	2	6	654119	654124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_008698	AAT	2	6	654199	654204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008698	TCG	2	6	656627	656632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008698	A	6	6	656642	656647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008698	TGG	2	6	656709	656714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008698	TCTT	3	12	657081	657092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_008698	ACGCG	2	10	657692	657701	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1613	NC_008698	TCG	2	6	657703	657708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008698	AG	3	6	657785	657790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008698	CG	4	8	660587	660594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_008698	TGG	2	6	660634	660639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008698	CCTT	2	8	660691	660698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_008698	CGG	2	6	660726	660731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008698	GC	4	8	660732	660739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_008698	GTA	2	6	660830	660835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008698	CTC	2	6	663965	663970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_008698	GT	3	6	667331	667336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008698	CGC	2	6	667375	667380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_008698	AGA	2	6	667404	667409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008698	CAC	2	6	667415	667420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_008698	GGGCG	2	10	667516	667525	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_008698	A	6	6	667575	667580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_008698	CT	3	6	675286	675291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_008698	G	6	6	675363	675368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008698	CGT	2	6	679042	679047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_008698	GAG	2	6	680739	680744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008698	A	6	6	680795	680800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_008698	TAC	2	6	680867	680872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_008698	GC	3	6	680882	680887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_008698	AAG	2	6	680957	680962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008698	G	6	6	680962	680967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_008698	GTCGC	2	10	681005	681014	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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