MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008698	CTT	2	6	441754	441759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008698	CG	3	6	441790	441795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_008698	AAC	2	6	441798	441803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008698	TCT	2	6	441826	441831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008698	CTC	2	6	441842	441847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_008698	TAC	2	6	441899	441904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008698	TTCA	2	8	441905	441912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_008698	TACC	2	8	441913	441920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_008698	TACGCG	2	12	441951	441962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008698	AGT	2	6	441993	441998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008698	CG	4	8	442007	442014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_008698	GC	3	6	442017	442022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_008698	CGT	2	6	443211	443216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008698	TCC	2	6	443222	443227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_008698	AG	3	6	443628	443633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008698	TAAA	2	8	443717	443724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008698	TTC	2	6	443829	443834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008698	TCC	2	6	443911	443916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_008698	TG	3	6	443919	443924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008698	AG	3	6	443932	443937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008698	GTA	2	6	443951	443956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008698	CCTGA	2	10	443967	443976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1023	NC_008698	CTC	2	6	443996	444001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_008698	GC	3	6	444028	444033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_008698	CAA	2	6	444094	444099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008698	CAA	2	6	444105	444110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_008698	CCT	2	6	444165	444170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_008698	CCG	2	6	444179	444184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_008698	CTTC	2	8	444324	444331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_008698	TC	4	8	444330	444337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_008698	CAGA	2	8	444355	444362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_008698	GCCCC	2	10	444391	444400	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1033	NC_008698	CCT	2	6	444401	444406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_008698	TAG	2	6	444409	444414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008698	GCAC	2	8	445647	445654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_008698	TCA	2	6	446078	446083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008698	T	6	6	446114	446119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008698	CG	3	6	446158	446163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_008698	CTT	2	6	446172	446177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008698	GT	3	6	446200	446205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008698	GAAA	2	8	447395	447402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008698	TA	3	6	447706	447711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008698	CG	3	6	450468	450473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_008698	AGG	2	6	452755	452760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008698	TCA	2	6	452767	452772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008698	TATC	2	8	454819	454826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_008698	CG	3	6	454843	454848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_008698	CG	3	6	454872	454877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_008698	TGA	2	6	454903	454908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008698	A	6	6	454911	454916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008698	CGA	2	6	454934	454939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_008698	GAA	2	6	455016	455021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008698	GTG	2	6	455054	455059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008698	CGA	2	6	455090	455095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008698	AGA	2	6	455117	455122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008698	TC	3	6	455145	455150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_008698	GC	3	6	455161	455166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_008698	T	6	6	455178	455183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008698	TGCT	2	8	455187	455194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_008698	GAC	2	6	455241	455246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008698	AC	3	6	456617	456622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_008698	AC	3	6	456647	456652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_008698	GCC	2	6	456669	456674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_008698	CGG	2	6	456700	456705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_008698	CT	3	6	456729	456734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_008698	GGC	2	6	456738	456743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008698	GC	3	6	456748	456753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_008698	AAG	2	6	456772	456777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008698	CAA	2	6	456830	456835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008698	GAA	2	6	458208	458213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008698	CTT	2	6	458222	458227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008698	GTT	2	6	458230	458235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008698	TC	3	6	458251	458256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_008698	CTG	2	6	458291	458296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008698	CG	3	6	458301	458306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_008698	ATG	2	6	460033	460038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008698	A	6	6	460051	460056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008698	TAA	2	6	460500	460505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008698	GGT	2	6	460517	460522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008698	CCG	2	6	460575	460580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_008698	TC	3	6	460616	460621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_008698	CG	3	6	460643	460648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_008698	GC	3	6	460660	460665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_008698	GGA	2	6	460697	460702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008698	CCCT	2	8	462164	462171	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1086	NC_008698	T	6	6	462430	462435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008698	C	6	6	462438	462443	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1088	NC_008698	TCTT	2	8	462446	462453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_008698	GAG	3	9	462499	462507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008698	CCG	3	9	462606	462614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_008698	TTA	2	6	462636	462641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008698	GTGCAC	2	12	462700	462711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008698	GCC	2	6	462721	462726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_008698	GCG	2	6	462761	462766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008698	CGG	2	6	462787	462792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008698	CCA	2	6	462795	462800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_008698	GC	3	6	462808	462813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_008698	CG	4	8	463801	463808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_008698	TTA	2	6	463813	463818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008698	TA	3	6	464019	464024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008698	TGA	2	6	464053	464058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008698	GC	3	6	464101	464106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_008698	TTA	2	6	465015	465020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008698	CAG	2	6	465030	465035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008698	CG	3	6	465044	465049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_008698	CG	3	6	465054	465059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_008698	CGG	2	6	465236	465241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008698	ATT	2	6	465247	465252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008698	AC	3	6	465862	465867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_008698	CG	4	8	468546	468553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_008698	GTG	2	6	469818	469823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008698	CTC	2	6	471399	471404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_008698	CTTCG	2	10	471438	471447	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_008698	CG	3	6	471446	471451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_008698	GTG	2	6	471550	471555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008698	AT	4	8	473479	473486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008698	GC	3	6	473489	473494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008698	GC	3	6	474090	474095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_008698	TTAATT	2	12	475596	475607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008698	TAT	2	6	475610	475615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008698	CTC	2	6	475627	475632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_008698	TTG	2	6	475645	475650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008698	GTG	2	6	476765	476770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008698	TA	3	6	476773	476778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008698	GC	3	6	476790	476795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_008698	GAG	2	6	476805	476810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008698	CCCT	2	8	476817	476824	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1128	NC_008698	ACT	2	6	477764	477769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_008698	CG	3	6	477800	477805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_008698	ATGG	2	8	477825	477832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008698	GCG	2	6	477874	477879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_008698	CGG	2	6	477933	477938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008698	TAA	2	6	477956	477961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008698	AT	3	6	477966	477971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008698	GAT	2	6	477995	478000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008698	GAA	2	6	478007	478012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008698	TGAT	2	8	478017	478024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_008698	ATAA	2	8	478061	478068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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