MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008698	CGA	2	6	288234	288239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008698	TA	3	6	288316	288321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008698	GA	3	6	288393	288398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008698	CCCG	2	8	288419	288426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
505	NC_008698	TGG	2	6	289964	289969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008698	GTG	2	6	290006	290011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008698	CTA	2	6	293387	293392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008698	ATCC	2	8	293396	293403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_008698	TGT	2	6	294271	294276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008698	CACG	2	8	295030	295037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
511	NC_008698	TTA	2	6	295055	295060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008698	ACGCG	2	10	295066	295075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
513	NC_008698	GAA	2	6	295147	295152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008698	TCCA	2	8	297671	297678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_008698	TCG	2	6	300963	300968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008698	CTAG	2	8	300975	300982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_008698	GAT	2	6	300985	300990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008698	A	6	6	301666	301671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008698	CG	3	6	304852	304857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_008698	AT	3	6	304968	304973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008698	TAA	3	9	305059	305067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008698	AGT	2	6	306638	306643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008698	TAC	2	6	309516	309521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008698	GTC	2	6	309925	309930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008698	ACA	2	6	309953	309958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008698	ATG	2	6	310001	310006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008698	ATA	2	6	310030	310035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008698	TAT	2	6	314841	314846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008698	ACT	2	6	314904	314909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_008698	TTA	2	6	314948	314953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008698	CCT	2	6	317012	317017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_008698	TAC	2	6	317098	317103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008698	CGC	2	6	318474	318479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008698	TCT	2	6	320502	320507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008698	GCC	2	6	320561	320566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_008698	CG	3	6	320574	320579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_008698	A	6	6	320593	320598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008698	GC	4	8	320618	320625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_008698	CCGGG	2	10	320650	320659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
540	NC_008698	CG	3	6	320741	320746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_008698	CCCGGC	2	12	320768	320779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_008698	CTC	2	6	320784	320789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_008698	A	6	6	320907	320912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008698	TCGC	2	8	321225	321232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_008698	A	6	6	321236	321241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008698	G	6	6	321268	321273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008698	GAA	2	6	321576	321581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008698	GCA	2	6	321647	321652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008698	CAC	2	6	321782	321787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_008698	TAA	2	6	322587	322592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008698	AGGG	2	8	322969	322976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008698	CG	3	6	325347	325352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_008698	GA	3	6	327755	327760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008698	CG	5	10	327786	327795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_008698	TAC	2	6	327867	327872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008698	TAAA	2	8	331861	331868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008698	GGA	2	6	331880	331885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008698	TTCT	2	8	331897	331904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_008698	T	6	6	331908	331913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008698	GC	3	6	331928	331933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_008698	CG	3	6	331962	331967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_008698	CT	3	6	331992	331997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_008698	GAA	2	6	332545	332550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008698	AAG	2	6	332928	332933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008698	CACG	2	8	333482	333489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_008698	GAA	2	6	333540	333545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008698	GCC	2	6	333549	333554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_008698	TA	3	6	333571	333576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008698	CATT	2	8	333587	333594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_008698	CG	3	6	337187	337192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_008698	AAAGT	2	10	338746	338755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008698	GTT	2	6	338761	338766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008698	CG	3	6	338776	338781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_008698	CG	4	8	339819	339826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_008698	CTTGC	2	10	339888	339897	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
576	NC_008698	GAT	2	6	339932	339937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008698	AGG	2	6	339983	339988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008698	TTC	2	6	339989	339994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008698	GAT	2	6	341144	341149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008698	CGCGC	2	10	341158	341167	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
581	NC_008698	GGC	2	6	341168	341173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008698	CTT	2	6	343171	343176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_008698	TAA	2	6	345837	345842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008698	TTC	2	6	345911	345916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008698	A	6	6	345943	345948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008698	ATT	2	6	346590	346595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008698	GAA	2	6	347238	347243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008698	TC	3	6	347254	347259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_008698	GAA	2	6	347314	347319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008698	CG	3	6	347939	347944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_008698	CG	3	6	350816	350821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_008698	CTAG	2	8	350828	350835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_008698	AAC	2	6	350870	350875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008698	TCT	2	6	350898	350903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008698	CTT	2	6	350943	350948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008698	C	10	10	351324	351333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
597	NC_008698	CTT	2	6	352193	352198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008698	GT	3	6	353267	353272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008698	AGG	2	6	353290	353295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008698	GC	3	6	354375	354380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_008698	GTA	2	6	354392	354397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008698	TA	3	6	354436	354441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008698	AGT	2	6	354456	354461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008698	TTC	2	6	355125	355130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008698	AGG	2	6	355193	355198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008698	AGA	2	6	357621	357626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008698	TTA	2	6	358650	358655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008698	TTC	2	6	358718	358723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008698	CTA	2	6	358732	358737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_008698	GA	3	6	358742	358747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008698	AGA	2	6	360024	360029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008698	AGG	2	6	360065	360070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008698	CGG	2	6	360639	360644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008698	CTTC	2	8	360708	360715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_008698	GGC	2	6	360752	360757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_008698	CGG	2	6	360807	360812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008698	CAC	2	6	360816	360821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_008698	TCT	2	6	360828	360833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008698	AGA	2	6	360835	360840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008698	TC	3	6	360859	360864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008698	TTC	2	6	361605	361610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_008698	GTT	2	6	361687	361692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008698	CCA	2	6	361704	361709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_008698	GTG	2	6	361738	361743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008698	TAA	2	6	361851	361856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008698	CGG	2	6	361877	361882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008698	AGA	2	6	361887	361892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008698	A	6	6	361892	361897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008698	GAG	2	6	361958	361963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008698	TACG	2	8	361986	361993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_008698	CTC	2	6	362914	362919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_008698	AG	3	6	362983	362988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008698	TCT	2	6	363093	363098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008698	GCC	2	6	363157	363162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_008698	GGGT	2	8	363171	363178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008698	GCG	2	6	363212	363217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_008698	GGC	2	6	363306	363311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_008698	AGC	2	6	363387	363392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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