MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	AATTAA	2	12	49172	49183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007520	TAAAAA	2	12	99697	99708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007520	TTATTT	2	12	122130	122141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007520	CTTGCA	2	12	189433	189444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007520	AAACAA	2	12	267878	267889	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007520	ATAAAG	2	12	282317	282328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007520	TAAAAG	2	12	313295	313306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007520	ACTGAA	2	12	330100	330111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007520	ATGGTG	2	12	368302	368313	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007520	TATTGA	2	12	388430	388441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007520	GTTTGT	2	12	399389	399400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007520	TTTATT	2	12	507113	507124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007520	TTGTTA	2	12	625971	625982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007520	TTTGAT	2	12	626578	626589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007520	TTAATT	2	12	628459	628470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007520	TATGAA	2	12	705900	705911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007520	TAAAAA	2	12	771814	771825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007520	GGAAAG	2	12	793908	793919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007520	AGCGAA	2	12	794267	794278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007520	TATCTA	2	12	830509	830520	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007520	TCAATA	2	12	841873	841884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007520	AGGAGT	2	12	861569	861580	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007520	AGCCTG	2	12	905504	905515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007520	AGGATC	2	12	907573	907584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007520	GGTTTT	2	12	916108	916119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007520	TTTAAA	2	12	922920	922931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007520	AGTTAA	2	12	948992	949003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007520	TAAATG	2	12	1086129	1086140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007520	ACGTTA	2	12	1089498	1089509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007520	ATCAGA	2	12	1091776	1091787	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007520	GATTTT	2	12	1188425	1188436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007520	TAAAAT	2	12	1298777	1298788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007520	TTGTTT	2	12	1407850	1407861	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007520	AATTTA	2	12	1438655	1438666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007520	ACTTTA	2	12	1469923	1469934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007520	GAAAAA	2	12	1537808	1537819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007520	CAAACA	2	12	1731131	1731142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007520	TCTAAA	2	12	1742198	1742209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007520	TGTCTC	2	12	1782344	1782355	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007520	TAAAAA	2	12	1818098	1818109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007520	ATTAGA	2	12	1944943	1944954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007520	AAATAA	2	12	1945108	1945119	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007520	AAGAGA	2	12	1957075	1957086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007520	TATTAA	2	12	1981527	1981538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007520	TCTGGT	2	12	2035833	2035844	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007520	GCAGTC	2	12	2038179	2038190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007520	ATTTTT	2	12	2038447	2038458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007520	AAAGCC	2	12	2225139	2225150	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007520	CAAATT	2	12	2288251	2288262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007520	TCAAGC	2	12	2324608	2324619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007520	TAAAAT	2	12	2329729	2329740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007520	TAAAGT	2	12	2392512	2392523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007520	AAAAAT	2	12	2411101	2411112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.