MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	GTTC	2	8	1415	1422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007520	ATTT	2	8	1471	1478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007520	TCAA	2	8	6079	6086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007520	ATTT	2	8	13742	13749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007520	ATTT	2	8	16413	16420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007520	TTTA	2	8	21817	21824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007520	TTAA	2	8	24638	24645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007520	AATT	2	8	24994	25001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007520	GAAT	2	8	25046	25053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007520	TTCC	2	8	31153	31160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007520	CTGG	2	8	31208	31215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007520	TCAT	2	8	35222	35229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007520	ATTT	2	8	38014	38021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007520	TTTG	2	8	38047	38054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007520	GATT	2	8	38114	38121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007520	ATGG	2	8	38136	38143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007520	AACA	2	8	39526	39533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007520	TAAA	2	8	39629	39636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007520	GTTG	2	8	42747	42754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007520	CATT	2	8	46002	46009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007520	TAAT	2	8	49453	49460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007520	CATT	2	8	62348	62355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007520	ACAA	2	8	65199	65206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007520	TTAA	2	8	77248	77255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007520	AGTT	2	8	77277	77284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007520	CCAA	2	8	79222	79229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007520	TCAA	2	8	79407	79414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007520	ATTA	2	8	80089	80096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007520	AATT	2	8	96704	96711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007520	AAAG	2	8	96731	96738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007520	TGCG	2	8	103763	103770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007520	AATA	2	8	104328	104335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007520	AGTA	2	8	108527	108534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007520	AAAC	2	8	109402	109409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007520	ATTC	2	8	109459	109466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007520	AAAT	2	8	109475	109482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007520	AAAG	2	8	109996	110003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007520	ATTT	2	8	110264	110271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007520	ATAG	2	8	110293	110300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007520	TACA	2	8	110302	110309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007520	ATTA	2	8	116153	116160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007520	CTTT	2	8	116215	116222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007520	AAAT	2	8	116865	116872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007520	AATC	3	12	120726	120737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007520	GTTT	2	8	131206	131213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007520	TAAT	2	8	131372	131379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007520	TAAA	2	8	136214	136221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007520	TTTG	2	8	136246	136253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007520	GGTT	2	8	136296	136303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007520	ATAA	2	8	138154	138161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007520	GAAT	2	8	141668	141675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007520	ATTC	2	8	142447	142454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007520	GTTA	2	8	148236	148243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007520	AATA	2	8	148494	148501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007520	TTCC	2	8	154387	154394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007520	AATT	2	8	158478	158485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007520	TCGG	2	8	160549	160556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007520	TCTG	2	8	160564	160571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007520	ATTT	2	8	168191	168198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007520	AATT	2	8	172017	172024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007520	TTAT	2	8	172029	172036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007520	TCCT	2	8	178234	178241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007520	GTAA	2	8	182903	182910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007520	TAAT	2	8	194203	194210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007520	TCAT	2	8	201630	201637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007520	ATTT	2	8	202682	202689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007520	AATA	2	8	202782	202789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007520	ATTG	2	8	220698	220705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007520	TGAA	2	8	227843	227850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007520	GTAA	2	8	234300	234307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007520	AATG	2	8	234354	234361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007520	TCAG	2	8	234470	234477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007520	TAGA	2	8	238237	238244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007520	TTAG	2	8	246502	246509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007520	CAAG	2	8	254250	254257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007520	AAAC	2	8	255802	255809	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007520	TTGT	2	8	258756	258763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007520	AACA	2	8	258773	258780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007520	TTAA	2	8	258885	258892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007520	GAAT	2	8	274628	274635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007520	AGTT	2	8	278370	278377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007520	ACTT	2	8	279123	279130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007520	TGGT	2	8	279161	279168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007520	AGTT	2	8	282378	282385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007520	TGGA	2	8	287045	287052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007520	TCAT	2	8	287055	287062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007520	TTTG	2	8	291541	291548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007520	TAAA	3	12	291759	291770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007520	AATT	2	8	295021	295028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007520	ATTT	2	8	298035	298042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007520	TAAA	2	8	299323	299330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007520	TTGG	2	8	313309	313316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007520	CAAG	2	8	314034	314041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007520	GTCA	2	8	317408	317415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007520	ATTG	3	12	317419	317430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007520	TTTG	2	8	320012	320019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007520	TCAT	2	8	320034	320041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007520	ATTG	2	8	323139	323146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007520	AAAG	2	8	324347	324354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007520	TTTC	2	8	326104	326111	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007520	TGGC	2	8	326719	326726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007520	GTAG	2	8	328721	328728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007520	GGCG	2	8	328801	328808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007520	TGGC	2	8	333497	333504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007520	GAAA	2	8	333605	333612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007520	TCTT	2	8	333617	333624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007520	TTAA	2	8	343033	343040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007520	ATGG	2	8	351606	351613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007520	TAAT	2	8	357009	357016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007520	AACA	2	8	366007	366014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007520	AGTA	2	8	368276	368283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007520	TTAT	2	8	379993	380000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007520	CAAA	2	8	385630	385637	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007520	ATGT	2	8	386108	386115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007520	TAAT	2	8	386343	386350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007520	TTAT	2	8	386533	386540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007520	AAAT	2	8	388069	388076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007520	ATAA	2	8	388155	388162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007520	ATTA	2	8	390755	390762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007520	TTTC	2	8	393465	393472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007520	AAAT	2	8	393481	393488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007520	CATT	2	8	393916	393923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007520	TTGT	2	8	398100	398107	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007520	CAAA	2	8	402324	402331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007520	AATA	2	8	414465	414472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007520	GAAG	2	8	416060	416067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007520	CAAT	2	8	418337	418344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007520	AAGT	2	8	421508	421515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007520	GATT	2	8	423442	423449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007520	AAAG	2	8	431314	431321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007520	TCAA	2	8	432380	432387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007520	GACA	2	8	444238	444245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007520	AGTA	2	8	444268	444275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007520	CAAG	2	8	445485	445492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007520	CAAA	2	8	445500	445507	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007520	GTTT	2	8	447366	447373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007520	GAAT	2	8	447467	447474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007520	AATG	2	8	456230	456237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007520	TTTA	2	8	459451	459458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007520	CAAT	2	8	460465	460472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007520	GATG	2	8	461626	461633	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007520	ATAA	2	8	468992	468999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007520	TGTT	2	8	469018	469025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007520	TTTG	2	8	469224	469231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007520	TATT	2	8	470668	470675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007520	TTGA	2	8	474158	474165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007520	GGTA	2	8	475054	475061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007520	TAAA	2	8	475250	475257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007520	CATT	2	8	475258	475265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_007520	AACT	2	8	480921	480928	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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