MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 5646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_007520	ACTT	2	8	279123	279130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_007520	TAT	2	6	279144	279149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007520	TGGT	2	8	279161	279168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007520	A	6	6	279191	279196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007520	A	6	6	279884	279889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007520	T	6	6	279906	279911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007520	CTTAT	2	10	282298	282307	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
509	NC_007520	ATAAAG	2	12	282317	282328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007520	AGTT	2	8	282378	282385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007520	A	6	6	282398	282403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007520	AATTG	2	10	283072	283081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007520	ACG	2	6	283102	283107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_007520	AAT	2	6	283128	283133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007520	T	6	6	284640	284645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007520	ATG	2	6	284651	284656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007520	GAA	2	6	286922	286927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007520	GTT	2	6	287039	287044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007520	TGGA	2	8	287045	287052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007520	TCAT	2	8	287055	287062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_007520	T	6	6	291534	291539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007520	TTTG	2	8	291541	291548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007520	T	6	6	291630	291635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007520	A	7	7	291663	291669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007520	TAAA	3	12	291759	291770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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527	NC_007520	TGA	2	6	291795	291800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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530	NC_007520	AATT	2	8	295021	295028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007520	AGAAA	2	10	295056	295065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007520	ATT	2	6	295071	295076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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535	NC_007520	ATTT	2	8	298035	298042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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537	NC_007520	T	9	9	299179	299187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_007520	T	6	6	299286	299291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007520	TC	3	6	299298	299303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_007520	TAAA	2	8	299323	299330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007520	TTA	2	6	299366	299371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007520	AAT	2	6	303746	303751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007520	T	6	6	312252	312257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007520	GA	3	6	312358	312363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007520	TTG	2	6	312383	312388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007520	GCG	2	6	312404	312409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_007520	CAA	2	6	312428	312433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_007520	ATG	2	6	312443	312448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007520	A	7	7	312459	312465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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553	NC_007520	TAA	2	6	313257	313262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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556	NC_007520	TTA	2	6	313324	313329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_007520	T	6	6	317391	317396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007520	GTCA	2	8	317408	317415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_007520	ATTG	3	12	317419	317430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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565	NC_007520	ATT	2	6	319830	319835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007520	A	6	6	319866	319871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007520	A	7	7	319887	319893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_007520	A	6	6	319909	319914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_007520	AAT	2	6	319919	319924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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574	NC_007520	TCAT	2	8	320034	320041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_007520	T	7	7	320055	320061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007520	AAC	2	6	320593	320598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_007520	AGT	2	6	328512	328517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_007520	GGCG	2	8	328801	328808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
608	NC_007520	T	8	8	330087	330094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007520	ACTGAA	2	12	330100	330111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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611	NC_007520	TTAAG	2	10	332419	332428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007520	GA	3	6	332442	332447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007520	GGA	2	6	332514	332519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_007520	TCTT	2	8	333617	333624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_007520	T	6	6	342014	342019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007520	AAT	2	6	342472	342477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007520	TAT	2	6	343007	343012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007520	AATTA	2	10	343018	343027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007520	TTAA	2	8	343033	343040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007520	T	6	6	345170	345175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007520	TAAAT	2	10	346388	346397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007520	CTTTT	2	10	346468	346477	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
630	NC_007520	T	7	7	346474	346480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007520	ATT	2	6	346497	346502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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633	NC_007520	ATA	2	6	346858	346863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007520	GA	3	6	349564	349569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007520	TAA	2	6	351544	351549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007520	ATGG	2	8	351606	351613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007520	AAG	2	6	354510	354515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_007520	TAC	2	6	357000	357005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_007520	TAAT	2	8	357009	357016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_007520	AAG	2	6	359901	359906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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