MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007404	GTCG	2	8	6631	6638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007404	TTGA	2	8	7176	7183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007404	CCGC	2	8	24134	24141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_007404	CGAA	2	8	26245	26252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007404	GCGG	2	8	30605	30612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007404	CCGG	2	8	30953	30960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007404	TTGC	2	8	38233	38240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007404	GGAA	2	8	40231	40238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007404	GGAC	2	8	50468	50475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007404	CGCA	2	8	59532	59539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007404	GCTC	2	8	59579	59586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007404	GCGG	2	8	69754	69761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007404	GGCG	2	8	72163	72170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007404	CTGC	2	8	86356	86363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007404	GTCG	2	8	91524	91531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007404	TTTG	2	8	93707	93714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007404	GCCG	2	8	96486	96493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007404	TGCG	2	8	98189	98196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007404	TGGC	2	8	100810	100817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007404	TCGG	2	8	111039	111046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007404	CCCA	2	8	117083	117090	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_007404	CAGC	2	8	143846	143853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007404	GTGC	2	8	156632	156639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007404	ACCC	2	8	157581	157588	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_007404	GGCA	2	8	165871	165878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007404	GCCC	2	8	173523	173530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_007404	CTTA	2	8	173647	173654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007404	TCCC	2	8	174909	174916	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_007404	GCAA	2	8	179264	179271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007404	AGCA	2	8	179283	179290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007404	CGGG	2	8	179422	179429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007404	CGGG	2	8	179476	179483	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007404	GGCG	2	8	185340	185347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007404	CGGC	3	12	185397	185408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007404	CCGG	2	8	185421	185428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007404	CAGC	2	8	191694	191701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007404	GCGG	2	8	196818	196825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007404	AAGC	2	8	200078	200085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007404	AGGG	2	8	201479	201486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007404	GCAG	2	8	204648	204655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007404	CGCT	2	8	205380	205387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007404	AAAG	2	8	206511	206518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007404	GCGG	2	8	220198	220205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007404	ACCC	2	8	226318	226325	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_007404	GGCC	2	8	232309	232316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007404	CAAA	2	8	239256	239263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007404	AGGC	2	8	247075	247082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007404	CAAC	2	8	248130	248137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007404	CAGT	2	8	253941	253948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007404	GCAG	2	8	253988	253995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007404	TGCT	2	8	259656	259663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007404	TTCT	2	8	265309	265316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007404	TTAT	2	8	266170	266177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007404	CGGC	2	8	267927	267934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007404	TGCG	2	8	283728	283735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007404	CGCC	2	8	283742	283749	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_007404	TCGA	2	8	294987	294994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007404	GGCC	2	8	339190	339197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007404	CGGG	2	8	341691	341698	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007404	ACCA	2	8	351680	351687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007404	CGGC	2	8	357303	357310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007404	AGCC	2	8	365361	365368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007404	GCAA	2	8	365496	365503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007404	TAAT	2	8	365537	365544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007404	AACG	2	8	367688	367695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007404	ATAA	2	8	367770	367777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007404	TTCG	2	8	369784	369791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007404	TGTC	2	8	387705	387712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007404	TGCG	2	8	395505	395512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007404	TGCG	2	8	396180	396187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007404	CTCC	2	8	398977	398984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_007404	GACG	2	8	398994	399001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007404	TTCG	2	8	400755	400762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007404	TTGC	2	8	401953	401960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007404	TATT	2	8	401967	401974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007404	CATC	2	8	405158	405165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007404	GCGG	2	8	409159	409166	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007404	GGCG	2	8	412013	412020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007404	GTCG	2	8	412098	412105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007404	CTTG	2	8	412141	412148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007404	CCAG	2	8	415451	415458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007404	TGGG	2	8	418979	418986	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007404	GCGG	2	8	419090	419097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007404	CATG	2	8	420710	420717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007404	CGGC	2	8	423043	423050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007404	GCCG	2	8	424409	424416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007404	GCCC	3	12	424427	424438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_007404	TAGA	2	8	433369	433376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007404	ATTG	2	8	433868	433875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007404	GCGG	2	8	437524	437531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007404	CGTA	2	8	437532	437539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007404	GTGA	2	8	448048	448055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007404	CTGG	2	8	452077	452084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007404	GCGT	2	8	461897	461904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007404	TGCC	2	8	469414	469421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007404	CATC	2	8	472349	472356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007404	GTGA	2	8	478469	478476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007404	GAAA	2	8	478511	478518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007404	TACC	2	8	479048	479055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007404	GTAG	2	8	479497	479504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007404	GATG	2	8	479661	479668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007404	CCAG	2	8	479743	479750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007404	GGGT	2	8	480455	480462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007404	GCGA	2	8	480536	480543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007404	GCAT	2	8	480807	480814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007404	AGCG	2	8	480872	480879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007404	TCAC	2	8	481267	481274	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007404	GACA	2	8	481363	481370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007404	AAAG	2	8	481505	481512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007404	ACCG	2	8	503761	503768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007404	GCGG	2	8	518851	518858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007404	AGGC	2	8	518864	518871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007404	CGCC	2	8	530835	530842	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_007404	CCCA	2	8	531739	531746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_007404	CCCG	2	8	531832	531839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_007404	TTCC	2	8	531868	531875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007404	AACG	2	8	543440	543447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007404	GGAA	2	8	544605	544612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007404	TGTT	2	8	552132	552139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007404	CTCG	2	8	557764	557771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007404	CACC	2	8	562867	562874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_007404	GTGG	2	8	574840	574847	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007404	CCGG	2	8	579496	579503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007404	TGGA	2	8	590852	590859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007404	ATGA	2	8	594782	594789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007404	TGGC	2	8	604389	604396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007404	GCCG	2	8	611086	611093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007404	CACG	2	8	616815	616822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007404	GCCC	2	8	623702	623709	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_007404	GCCG	2	8	626798	626805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007404	CGGC	2	8	628531	628538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007404	GCAG	2	8	647243	647250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007404	TCGG	2	8	647378	647385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007404	GGCA	2	8	653109	653116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007404	CGGG	2	8	661547	661554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007404	GGGC	3	12	673594	673605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007404	CCGC	2	8	675081	675088	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_007404	GGTC	2	8	681031	681038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007404	TGAT	2	8	682479	682486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007404	GTGG	2	8	682776	682783	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007404	CGGG	2	8	682917	682924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007404	GGCC	2	8	682944	682951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007404	GGCG	2	8	684166	684173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007404	GTGG	2	8	689961	689968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007404	AGGC	2	8	714459	714466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007404	AGCG	2	8	714488	714495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007404	GGGC	2	8	714502	714509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007404	CTAT	2	8	720816	720823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007404	AGAT	2	8	720907	720914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007404	GCAA	2	8	745367	745374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007404	TAAA	2	8	745655	745662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_007404	CGAG	2	8	1301039	1301046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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293	NC_007404	CGGT	2	8	1317802	1317809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_007404	GCAC	2	8	2050243	2050250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_007404	TCAA	2	8	2052492	2052499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_007404	CTCC	2	8	2053945	2053952	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_007404	AACG	2	8	2053979	2053986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_007404	CGGC	2	8	2054090	2054097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_007404	ATGG	2	8	2055503	2055510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_007404	TGCT	2	8	2056483	2056490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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