MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 2474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006461	TGGGA	2	10	349094	349103	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006461	GGT	2	6	349193	349198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006461	GGGC	2	8	349245	349252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
504	NC_006461	C	6	6	349374	349379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
505	NC_006461	CCT	2	6	349385	349390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_006461	ACG	2	6	349423	349428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_006461	CTT	2	6	349484	349489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_006461	CGA	2	6	349503	349508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_006461	CGC	2	6	349535	349540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_006461	ACC	2	6	349618	349623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_006461	CGG	2	6	349701	349706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_006461	AGG	2	6	349754	349759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_006461	C	6	6	349795	349800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
514	NC_006461	GGT	2	6	349831	349836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006461	C	7	7	349852	349858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
516	NC_006461	GCC	2	6	350101	350106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_006461	TTCGG	2	10	350119	350128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
518	NC_006461	CCCCT	2	10	350137	350146	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
519	NC_006461	CCT	2	6	350183	350188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_006461	AG	3	6	350202	350207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006461	TCA	2	6	350261	350266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_006461	CG	3	6	350335	350340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_006461	G	6	6	350433	350438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006461	CAC	2	6	350461	350466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_006461	TTG	2	6	350474	350479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006461	CCTAG	2	10	350544	350553	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
527	NC_006461	C	6	6	350559	350564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
528	NC_006461	GAC	2	6	350655	350660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_006461	GCC	2	6	350752	350757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_006461	CATCGG	2	12	350774	350785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006461	CGGCG	2	10	350860	350869	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
532	NC_006461	GCT	2	6	350910	350915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_006461	CCT	2	6	350926	350931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_006461	GTT	2	6	351000	351005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_006461	CGGACG	2	12	351014	351025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_006461	TCGC	2	8	351029	351036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
537	NC_006461	TGG	2	6	351094	351099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006461	CGCCTC	2	12	351381	351392	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_006461	CTCCC	2	10	351508	351517	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
540	NC_006461	GGT	2	6	351587	351592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006461	C	6	6	351651	351656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
542	NC_006461	CT	3	6	351682	351687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_006461	GCT	2	6	351691	351696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_006461	CCCG	2	8	351748	351755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
545	NC_006461	TCGC	2	8	351787	351794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_006461	TCCTC	2	10	351821	351830	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
547	NC_006461	C	6	6	351862	351867	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
548	NC_006461	GCCG	2	8	351896	351903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_006461	C	6	6	352086	352091	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_006461	AGG	2	6	352120	352125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_006461	GTA	2	6	353552	353557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006461	GAA	2	6	357817	357822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006461	GCC	2	6	357833	357838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_006461	CCT	2	6	358430	358435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_006461	CTC	2	6	358496	358501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_006461	GCG	2	6	358547	358552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_006461	CCCTCG	2	12	358623	358634	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_006461	GCC	2	6	358685	358690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_006461	GCC	2	6	358727	358732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_006461	GCCC	2	8	358756	358763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
561	NC_006461	CCT	2	6	358768	358773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_006461	TCC	2	6	358881	358886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_006461	GC	3	6	358906	358911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_006461	CTC	3	9	358958	358966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_006461	TCC	2	6	358983	358988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_006461	CTT	2	6	359029	359034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_006461	CCG	2	6	359058	359063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_006461	GCC	2	6	359066	359071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_006461	ACC	2	6	359088	359093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_006461	CTC	2	6	359117	359122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_006461	GGT	2	6	359278	359283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_006461	TCC	2	6	359286	359291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_006461	TAC	2	6	359321	359326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_006461	GCC	2	6	359330	359335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_006461	CTT	2	6	359353	359358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006461	TCA	2	6	359373	359378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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578	NC_006461	CAC	2	6	359398	359403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_006461	CTT	2	6	359404	359409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_006461	CGGG	2	8	359475	359482	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
581	NC_006461	TGC	2	6	359484	359489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_006461	ACCCTG	2	12	359495	359506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
583	NC_006461	ACA	2	6	359520	359525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_006461	GCG	2	6	359611	359616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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586	NC_006461	TCT	2	6	359660	359665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_006461	CGGG	2	8	362182	362189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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592	NC_006461	TGG	2	6	364687	364692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_006461	GGGC	3	12	368731	368742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
595	NC_006461	GTG	3	9	370813	370821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_006461	GTG	2	6	370843	370848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006461	TCC	2	6	370880	370885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_006461	CGG	2	6	370908	370913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_006461	TGG	2	6	370946	370951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_006461	CGC	2	6	371085	371090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_006461	CCT	2	6	371114	371119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_006461	CTT	2	6	371130	371135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_006461	GGT	2	6	371139	371144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006461	GCGGG	2	10	371157	371166	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
609	NC_006461	AAG	2	6	371273	371278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006461	GTG	2	6	371339	371344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006461	CCT	2	6	371353	371358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_006461	CTT	2	6	371383	371388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_006461	CCGGGA	2	12	371503	371514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006461	CCG	2	6	371566	371571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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616	NC_006461	GGA	2	6	371678	371683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006461	AAGGG	2	10	371699	371708	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006461	CGC	2	6	371746	371751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_006461	GGC	2	6	371758	371763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_006461	GGGGC	2	10	371772	371781	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
621	NC_006461	G	7	7	371818	371824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006461	GGC	2	6	371845	371850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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624	NC_006461	G	6	6	378811	378816	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
625	NC_006461	TCCCT	2	10	379243	379252	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
626	NC_006461	CGC	2	6	379304	379309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_006461	AAG	2	6	379394	379399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006461	CCT	2	6	380833	380838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_006461	CTC	2	6	386590	386595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_006461	CTTCC	2	10	391112	391121	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
631	NC_006461	CCG	2	6	391124	391129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_006461	G	6	6	391175	391180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_006461	GTA	2	6	393551	393556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006461	G	6	6	393658	393663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
635	NC_006461	G	6	6	393921	393926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
636	NC_006461	GC	3	6	396610	396615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_006461	CCA	2	6	396635	396640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_006461	CCT	2	6	396667	396672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_006461	GTA	2	6	396946	396951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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