MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005838	GC	3	6	5199	5204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005838	GA	3	6	22618	22623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005838	AG	3	6	27352	27357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005838	GA	3	6	27448	27453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005838	CG	3	6	33935	33940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005838	TC	4	8	72626	72633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005838	AG	3	6	75923	75928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005838	TC	4	8	85714	85721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005838	AG	3	6	89002	89007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005838	TC	3	6	90332	90337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005838	CG	3	6	90836	90841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005838	GC	3	6	131921	131926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005838	GC	3	6	149817	149822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005838	CG	3	6	149837	149842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005838	GC	3	6	154807	154812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005838	GA	3	6	155539	155544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005838	TC	4	8	159995	160002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_005838	TC	4	8	181304	181311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005838	CG	3	6	181466	181471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005838	CG	3	6	181562	181567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005838	GC	3	6	182376	182381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005838	AG	3	6	182989	182994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005838	AG	4	8	183558	183565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005838	TC	3	6	184788	184793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005838	GA	3	6	187172	187177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005838	GC	3	6	200760	200765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005838	TC	3	6	203125	203130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005838	AG	3	6	205385	205390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005838	AC	3	6	209700	209705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_005838	CA	3	6	213603	213608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005838	AG	3	6	214167	214172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.