MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005835	CCGGGC	2	12	78087	78098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005835	CCCTTT	2	12	95326	95337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005835	ACGCCC	2	12	143124	143135	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_005835	GCCCCC	2	12	197513	197524	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
5	NC_005835	GTGGGC	2	12	211304	211315	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005835	CGCGGG	2	12	228071	228082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005835	CCTCGC	2	12	287840	287851	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_005835	CGGGCG	2	12	302178	302189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005835	GCCTTT	2	12	379908	379919	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005835	CGCCCC	2	12	387193	387204	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_005835	GGGGCG	2	12	540749	540760	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_005835	CCCCGC	2	12	605925	605936	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_005835	CCCAGG	2	12	611079	611090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005835	GCGCGT	2	12	646357	646368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005835	ACGCGC	2	12	646525	646536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005835	CGCCCA	2	12	647893	647904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_005835	CGGGCG	2	12	686966	686977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005835	GGCCTG	2	12	701006	701017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005835	ACCTGG	2	12	724887	724898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_005835	AGCCTA	2	12	732198	732209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005835	AAGGGC	2	12	774897	774908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005835	GGCCCT	2	12	811794	811805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005835	CCGAGC	2	12	822896	822907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_005835	CTTAAA	2	12	830145	830156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005835	TCCTAG	2	12	841061	841072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_005835	GAAGCC	2	12	917189	917200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_005835	TCCACC	2	12	917687	917698	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_005835	AAGGGT	2	12	932920	932931	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005835	GATGAA	2	12	988459	988470	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005835	CCCCTT	2	12	1028181	1028192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_005835	TGGCCT	2	12	1059888	1059899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_005835	TCCACC	2	12	1070910	1070921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_005835	AGGGCC	2	12	1071154	1071165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005835	ACCTCC	2	12	1172245	1172256	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_005835	CTCTCC	2	12	1254578	1254589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_005835	CCACCC	2	12	1310030	1310041	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
37	NC_005835	CTTCGC	2	12	1333362	1333373	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005835	AGGCCC	2	12	1481837	1481848	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005835	CCGCGG	2	12	1486937	1486948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005835	CGCCCC	2	12	1516625	1516636	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_005835	GAGGCG	2	12	1535128	1535139	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005835	CGTCCG	2	12	1535473	1535484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005835	CCGATG	2	12	1535713	1535724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005835	CGAAGG	2	12	1594487	1594498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005835	CCCGCC	2	12	1703694	1703705	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
46	NC_005835	GCCCCC	2	12	1776495	1776506	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_005835	AGAAGG	2	12	1829128	1829139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005835	CGGGCC	2	12	1871841	1871852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005835	CCAGGG	2	12	1872265	1872276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005835	CATCGG	2	12	1893582	1893593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005835	CGGACG	2	12	1893822	1893833	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005835	CGCCTC	2	12	1894167	1894178	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.