MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 1094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005835	AGG	2	6	30	35	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005835	TCT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005835	TGA	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005835	GTA	2	6	2647	2652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005835	GAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005835	GCC	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_005835	TCC	3	9	16825	16833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_005835	CGC	2	6	28456	28461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_005835	CCT	2	6	28892	28897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_005835	CGC	2	6	28955	28960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_005835	AAG	2	6	29045	29050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005835	CCT	2	6	30485	30490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_005835	GTG	2	6	37099	37104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005835	GGA	2	6	39022	39027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005835	GAC	2	6	39227	39232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005835	GGT	2	6	39274	39279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005835	CCG	2	6	40805	40810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_005835	GTA	2	6	43232	43237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005835	CCA	2	6	46316	46321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_005835	CCT	2	6	46348	46353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_005835	GTA	2	6	46627	46632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005835	CGC	2	6	47241	47246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_005835	CCT	2	6	53159	53164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_005835	GAT	2	6	55225	55230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005835	CCT	2	6	56742	56747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_005835	GGA	2	6	56808	56813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005835	CCG	2	6	56850	56855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_005835	CCA	2	6	58592	58597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_005835	GCT	2	6	59551	59556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005835	GCC	2	6	68055	68060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_005835	GAG	2	6	68095	68100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005835	GGC	2	6	74898	74903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005835	GGC	2	6	76956	76961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005835	GTG	2	6	81930	81935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005835	GCT	2	6	81979	81984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_005835	TAG	2	6	82021	82026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005835	AGG	2	6	82063	82068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005835	GAG	2	6	82859	82864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005835	GCG	2	6	82865	82870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005835	AGG	2	6	82911	82916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005835	GAA	2	6	82922	82927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005835	GTC	2	6	82940	82945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005835	GTA	2	6	83000	83005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005835	TCC	2	6	83034	83039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_005835	GAG	2	6	83051	83056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005835	GGC	2	6	83077	83082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005835	AGG	2	6	83094	83099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005835	TCC	2	6	83211	83216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_005835	TCC	2	6	83523	83528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_005835	GAG	2	6	83582	83587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005835	GCC	2	6	83604	83609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_005835	AGG	2	6	83622	83627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005835	TTG	2	6	83640	83645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005835	CCA	2	6	83659	83664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_005835	GAG	2	6	83693	83698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005835	GAG	2	6	83750	83755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005835	GCG	2	6	83760	83765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005835	AGA	2	6	83769	83774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005835	CGG	2	6	83800	83805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005835	GCC	2	6	83822	83827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_005835	GCC	2	6	87792	87797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_005835	GGA	2	6	90218	90223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005835	TCG	2	6	92274	92279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005835	GCC	2	6	95220	95225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_005835	GGT	2	6	95351	95356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005835	CAG	2	6	98500	98505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005835	GGT	2	6	107555	107560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005835	CCA	2	6	107577	107582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_005835	CCT	2	6	114687	114692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_005835	GAG	2	6	117202	117207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005835	CGG	2	6	119280	119285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_005835	CGC	2	6	119633	119638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_005835	TCC	2	6	123526	123531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_005835	CAC	2	6	126089	126094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_005835	GGT	2	6	126105	126110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005835	CCT	2	6	135760	135765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_005835	CCT	2	6	139935	139940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_005835	CTT	2	6	139963	139968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005835	GAA	2	6	140030	140035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005835	GCC	2	6	143039	143044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_005835	CCT	3	9	143049	143057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_005835	TCC	2	6	147159	147164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_005835	CCT	2	6	150062	150067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_005835	GGC	2	6	157716	157721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005835	GGA	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005835	GGA	2	6	159333	159338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005835	AGG	2	6	159389	159394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005835	TAT	2	6	161438	161443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005835	CGT	2	6	164836	164841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_005835	AGC	2	6	164856	164861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005835	GGA	2	6	165386	165391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005835	AGG	2	6	169471	169476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005835	ATG	2	6	170962	170967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005835	TCC	2	6	207259	207264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_005835	CCT	2	6	208474	208479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_005835	GCT	2	6	208556	208561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_005835	TGG	2	6	208595	208600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005835	AGG	2	6	208639	208644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005835	ACC	2	6	209635	209640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_005835	GGC	2	6	209679	209684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005835	TCT	2	6	209699	209704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_005835	AGG	2	6	209710	209715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005835	CGG	2	6	209771	209776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_005835	GCG	2	6	209839	209844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_005835	CCT	2	6	210560	210565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_005835	CGG	2	6	210600	210605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005835	GCC	2	6	210624	210629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_005835	GGT	2	6	211246	211251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005835	GGC	2	6	211371	211376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005835	CGG	2	6	211414	211419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005835	GGA	2	6	211423	211428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005835	GCA	2	6	211528	211533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005835	GCA	2	6	211633	211638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_005835	CTC	2	6	211673	211678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_005835	TCC	2	6	211704	211709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_005835	CCG	2	6	211753	211758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_005835	GGA	2	6	211774	211779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005835	CGG	2	6	211813	211818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005835	GCC	2	6	216002	216007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_005835	GCG	2	6	216012	216017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_005835	ACC	2	6	229525	229530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_005835	GGC	2	6	229612	229617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_005835	GGA	2	6	229634	229639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005835	CCT	2	6	231963	231968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_005835	GCC	2	6	236821	236826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_005835	GGT	2	6	236838	236843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005835	CTC	2	6	236943	236948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_005835	GAG	2	6	248170	248175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005835	GTC	2	6	249519	249524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_005835	CCT	2	6	249527	249532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_005835	GCG	2	6	249536	249541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005835	CTG	2	6	252908	252913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_005835	GCT	2	6	252937	252942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005835	TCT	2	6	252979	252984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005835	GGC	2	6	253465	253470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_005835	GGC	2	6	253617	253622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005835	GCC	2	6	253695	253700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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139	NC_005835	GAG	2	6	261199	261204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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