MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 1957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005835	CCTC	2	8	1058727	1058734	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1002	NC_005835	C	6	6	1059868	1059873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1003	NC_005835	TGGCCT	2	12	1059888	1059899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_005835	CCA	2	6	1059936	1059941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_005835	ATG	2	6	1059965	1059970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_005835	TGT	2	6	1060005	1060010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_005835	CTG	2	6	1060021	1060026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_005835	CGG	2	6	1060062	1060067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_005835	GCC	2	6	1060073	1060078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_005835	C	6	6	1060114	1060119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1011	NC_005835	GCG	2	6	1060123	1060128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_005835	CGG	2	6	1060221	1060226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_005835	C	8	8	1060248	1060255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1014	NC_005835	TCC	3	9	1060289	1060297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_005835	GGC	2	6	1060309	1060314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_005835	C	7	7	1060321	1060327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1017	NC_005835	GCC	2	6	1060331	1060336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_005835	ACC	2	6	1060370	1060375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_005835	CCTT	2	8	1060388	1060395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_005835	GGC	2	6	1060408	1060413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_005835	GCCC	2	8	1060420	1060427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1022	NC_005835	CACC	2	8	1060434	1060441	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_005835	CAT	2	6	1061240	1061245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_005835	TCC	2	6	1061273	1061278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_005835	C	7	7	1061290	1061296	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1026	NC_005835	AGG	2	6	1061303	1061308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_005835	G	6	6	1061307	1061312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_005835	GAA	2	6	1061334	1061339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_005835	C	6	6	1061377	1061382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1030	NC_005835	C	6	6	1061389	1061394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1031	NC_005835	G	8	8	1061438	1061445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_005835	G	8	8	1061447	1061454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_005835	GCC	2	6	1061952	1061957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_005835	CTC	2	6	1061958	1061963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_005835	C	6	6	1061976	1061981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1036	NC_005835	GAG	2	6	1062021	1062026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_005835	AGG	2	6	1066129	1066134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_005835	CCT	2	6	1068696	1068701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_005835	TCCACC	2	12	1070910	1070921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_005835	GGA	2	6	1070941	1070946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_005835	GGC	2	6	1070954	1070959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_005835	AGG	2	6	1070991	1070996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_005835	GGGC	2	8	1071004	1071011	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_005835	CCG	2	6	1071083	1071088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_005835	GC	3	6	1071102	1071107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_005835	AGGGCC	2	12	1071154	1071165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_005835	CCA	2	6	1071184	1071189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_005835	GAA	2	6	1071208	1071213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_005835	TCC	2	6	1071231	1071236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_005835	G	7	7	1071244	1071250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_005835	GCC	2	6	1071479	1071484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_005835	C	6	6	1071492	1071497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1053	NC_005835	C	6	6	1071508	1071513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1054	NC_005835	G	6	6	1071522	1071527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_005835	TGG	2	6	1071533	1071538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_005835	AGA	2	6	1071618	1071623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_005835	CCCCT	2	10	1071630	1071639	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1058	NC_005835	CCGGG	2	10	1071695	1071704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_005835	AAC	2	6	1071726	1071731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_005835	CACC	2	8	1071749	1071756	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1061	NC_005835	ACC	2	6	1076259	1076264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_005835	CAG	2	6	1076334	1076339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_005835	TCA	2	6	1076406	1076411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_005835	CCTC	2	8	1078400	1078407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1065	NC_005835	AGGGG	2	10	1078461	1078470	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_005835	CAG	2	6	1085721	1085726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_005835	CGGGG	2	10	1087140	1087149	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_005835	CACCT	2	10	1088271	1088280	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1069	NC_005835	CCT	2	6	1092434	1092439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_005835	CG	3	6	1092514	1092519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_005835	GGA	2	6	1092524	1092529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_005835	GC	3	6	1092533	1092538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_005835	GAA	2	6	1092570	1092575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_005835	G	6	6	1094194	1094199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_005835	GGGGC	2	10	1094214	1094223	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_005835	GGC	2	6	1096173	1096178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_005835	TCCC	2	8	1096189	1096196	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1078	NC_005835	C	6	6	1096194	1096199	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1079	NC_005835	GAAG	2	8	1096210	1096217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_005835	CGC	2	6	1100646	1100651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_005835	CCTT	2	8	1100662	1100669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_005835	AGGG	2	8	1100690	1100697	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_005835	GGCC	2	8	1100700	1100707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_005835	AGTA	2	8	1107988	1107995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_005835	AGCCT	2	10	1108687	1108696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_005835	CTTC	2	8	1115493	1115500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_005835	CCCG	2	8	1116851	1116858	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1089	NC_005835	CGC	2	6	1116866	1116871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1091	NC_005835	GAG	2	6	1117576	1117581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_005835	C	6	6	1131015	1131020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1093	NC_005835	G	6	6	1131035	1131040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_005835	GAA	2	6	1131058	1131063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_005835	C	6	6	1135440	1135445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1096	NC_005835	GAGG	2	8	1135498	1135505	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_005835	CCA	2	6	1135528	1135533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_005835	CCAC	2	8	1135556	1135563	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1099	NC_005835	CGC	2	6	1135575	1135580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_005835	GTC	2	6	1135592	1135597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_005835	CCTC	2	8	1135641	1135648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1102	NC_005835	AAC	2	6	1135665	1135670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_005835	GAG	2	6	1136674	1136679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_005835	TGG	2	6	1136693	1136698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_005835	CTT	2	6	1136701	1136706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_005835	CAA	2	6	1136890	1136895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_005835	CAGTC	2	10	1136934	1136943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_005835	GCC	2	6	1136997	1137002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_005835	C	6	6	1137123	1137128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_005835	G	7	7	1137160	1137166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_005835	GAAAA	2	10	1137263	1137272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005835	A	6	6	1137298	1137303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_005835	CA	3	6	1137351	1137356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_005835	GAA	2	6	1137388	1137393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_005835	AAAG	2	8	1137429	1137436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_005835	C	6	6	1141109	1141114	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1117	NC_005835	TACAC	2	10	1141117	1141126	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_005835	CCT	2	6	1143493	1143498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_005835	TGG	2	6	1143646	1143651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_005835	CTA	2	6	1143654	1143659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_005835	GGT	2	6	1144011	1144016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_005835	GTG	2	6	1144038	1144043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_005835	CCA	2	6	1144068	1144073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_005835	C	6	6	1144079	1144084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1128	NC_005835	G	6	6	1144093	1144098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_005835	CAT	2	6	1144105	1144110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_005835	GGC	2	6	1145725	1145730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_005835	GCC	2	6	1145736	1145741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_005835	TCC	2	6	1147167	1147172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_005835	G	7	7	1147206	1147212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_005835	GAG	2	6	1147214	1147219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_005835	CCT	2	6	1417640	1417645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1402	NC_005835	CCA	2	6	1419134	1419139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1403	NC_005835	ACA	2	6	1424357	1424362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_005835	AGG	2	6	1424370	1424375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_005835	CCG	2	6	1457604	1457609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1449	NC_005835	CGGCT	2	10	1477347	1477356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1492	NC_005835	AGGTG	2	10	1534143	1534152	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1497	NC_005835	CCT	2	6	1534278	1534283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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