MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 2525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004572	AGT	2	6	304575	304580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_004572	CAC	2	6	304592	304597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_004572	CA	3	6	304605	304610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_004572	TGT	3	9	304650	304658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_004572	GTA	2	6	304781	304786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_004572	GGA	2	6	304791	304796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004572	TTTA	2	8	304806	304813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_004572	TGA	2	6	306734	306739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_004572	TGA	2	6	306749	306754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_004572	TTG	2	6	306798	306803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_004572	TAT	2	6	306810	306815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_004572	TG	4	8	318481	318488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_004572	GAG	2	6	320895	320900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_004572	TCT	2	6	322916	322921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_004572	TTTA	2	8	322937	322944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_004572	T	6	6	323445	323450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_004572	AATA	2	8	324013	324020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_004572	TAT	2	6	324074	324079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_004572	GTGA	2	8	325854	325861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_004572	TA	3	6	333042	333047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004572	GAA	2	6	333582	333587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_004572	GTT	2	6	333633	333638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_004572	GAA	2	6	333654	333659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004572	CT	3	6	335160	335165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_004572	AAAAC	2	10	335171	335180	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1526	NC_004572	ATC	2	6	335213	335218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_004572	TTG	2	6	340046	340051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004572	CCT	2	6	340582	340587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_004572	GTG	2	6	340607	340612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_004572	GCGG	2	8	342284	342291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_004572	CCG	2	6	342395	342400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_004572	GGT	2	6	342419	342424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_004572	ACC	2	6	342432	342437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_004572	CTG	2	6	342458	342463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_004572	GCT	2	6	342504	342509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_004572	CAA	2	6	342546	342551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_004572	GATG	2	8	342560	342567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_004572	GCC	2	6	342568	342573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_004572	AT	3	6	342700	342705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_004572	TAGT	2	8	342711	342718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004572	TTA	2	6	357065	357070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_004572	TCT	2	6	357084	357089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_004572	GCGTAA	2	12	357113	357124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1544	NC_004572	CAGGC	2	10	357125	357134	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1545	NC_004572	T	7	7	359513	359519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_004572	CAA	2	6	360067	360072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_004572	T	7	7	360086	360092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_004572	TTG	2	6	362539	362544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_004572	TG	3	6	362728	362733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_004572	AGG	2	6	362772	362777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_004572	TAT	2	6	362813	362818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_004572	GAA	2	6	362835	362840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_004572	A	6	6	364018	364023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004572	TAT	2	6	364766	364771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_004572	GT	3	6	366518	366523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_004572	ATTA	2	8	371381	371388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_004572	AGC	2	6	371458	371463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_004572	CGT	2	6	372568	372573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_004572	TAAAC	2	10	374084	374093	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_004572	CGG	2	6	374143	374148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_004572	CGG	2	6	374152	374157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_004572	TGC	2	6	376057	376062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_004572	TCAT	2	8	376105	376112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_004572	T	7	7	376112	376118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_004572	GTAAT	2	10	390860	390869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_004572	TTG	2	6	395320	395325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_004572	GTA	2	6	395359	395364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_004572	TG	3	6	395371	395376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_004572	T	6	6	395377	395382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_004572	GTCC	2	8	397326	397333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_004572	TGT	2	6	397428	397433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_004572	CGTG	2	8	397831	397838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_004572	GAT	2	6	397866	397871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_004572	AAT	2	6	397879	397884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_004572	AAT	2	6	401021	401026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_004572	CAT	2	6	403083	403088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_004572	GTT	2	6	405019	405024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_004572	TTG	2	6	405035	405040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_004572	GGT	2	6	407143	407148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_004572	CTT	2	6	407165	407170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_004572	TTC	2	6	407191	407196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_004572	CGCC	2	8	408303	408310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1583	NC_004572	GGCG	2	8	408321	408328	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_004572	AGA	2	6	408338	408343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_004572	AGC	2	6	409348	409353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_004572	CCG	2	6	409365	409370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_004572	CGA	2	6	414196	414201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_004572	TTA	2	6	414331	414336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_004572	ATA	2	6	414344	414349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_004572	TA	3	6	414348	414353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_004572	CG	3	6	414417	414422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_004572	GGA	2	6	414459	414464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_004572	TTA	2	6	414530	414535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_004572	T	6	6	414538	414543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_004572	ACA	3	9	416670	416678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_004572	AATTG	2	10	416700	416709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_004572	CAA	2	6	419673	419678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_004572	AT	3	6	419687	419692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_004572	ATTA	2	8	419714	419721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_004572	ATT	2	6	419778	419783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_004572	AT	3	6	421719	421724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_004572	AAAT	2	8	421737	421744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004572	CA	3	6	421757	421762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_004572	TCT	3	9	428159	428167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_004572	GAA	2	6	428216	428221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_004572	CA	3	6	428281	428286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_004572	TGC	2	6	428298	428303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_004572	AGAT	2	8	428934	428941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_004572	CA	3	6	429031	429036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_004572	TTC	2	6	429963	429968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_004572	ACC	2	6	434090	434095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_004572	GCA	2	6	434122	434127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_004572	TAA	2	6	434159	434164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_004572	TATT	2	8	436347	436354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_004572	AGT	2	6	436466	436471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_004572	ATC	2	6	436547	436552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_004572	AT	3	6	438291	438296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_004572	A	6	6	439210	439215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_004572	AC	3	6	439235	439240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_004572	AC	3	6	440396	440401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_004572	AAG	2	6	440467	440472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004572	CTT	2	6	440503	440508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_004572	GTG	2	6	440512	440517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_004572	AAT	2	6	442362	442367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_004572	GAC	2	6	442401	442406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_004572	CTA	2	6	442504	442509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_004572	AC	3	6	442523	442528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_004572	TGT	2	6	442639	442644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_004572	ACA	2	6	448267	448272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_004572	AGA	2	6	454617	454622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_004572	ACCT	2	8	458207	458214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_004572	ACA	2	6	458224	458229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_004572	AAT	2	6	467506	467511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_004572	TTC	2	6	468670	468675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_004572	CAG	2	6	468771	468776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_004572	GCA	2	6	472790	472795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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