MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 2525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004572	ATG	2	6	243560	243565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004572	TG	3	6	243564	243569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004572	GAA	3	9	243630	243638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004572	TGTTA	2	10	243694	243703	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004572	TGT	2	6	243738	243743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004572	GCG	2	6	243877	243882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_004572	AC	3	6	243949	243954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_004572	AT	3	6	243955	243960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004572	CCA	2	6	243985	243990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_004572	CA	3	6	244040	244045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_004572	CTG	2	6	244096	244101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_004572	TAT	2	6	244106	244111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004572	TAT	2	6	244120	244125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004572	CCTG	2	8	244163	244170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_004572	ATA	2	6	244260	244265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_004572	CTG	2	6	244339	244344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_004572	GGC	2	6	244402	244407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_004572	TAC	2	6	244527	244532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_004572	TA	3	6	244609	244614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004572	CTT	2	6	244616	244621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_004572	ACA	2	6	244636	244641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_004572	ACT	2	6	244654	244659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_004572	GGT	2	6	244660	244665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004572	TAC	2	6	244731	244736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_004572	ACTGCA	2	12	244759	244770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_004572	TTC	2	6	244779	244784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_004572	TA	3	6	244823	244828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004572	TAC	2	6	244845	244850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004572	CTA	2	6	244951	244956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_004572	CCA	2	6	245177	245182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_004572	CCA	2	6	245194	245199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_004572	ATG	2	6	245215	245220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004572	TG	3	6	245219	245224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004572	TACCC	2	10	245297	245306	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_004572	CA	3	6	245348	245353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_004572	CG	3	6	245482	245487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_004572	TAA	2	6	245505	245510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004572	AC	3	6	245515	245520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_004572	AC	3	6	245551	245556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_004572	TAG	2	6	245623	245628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004572	ACA	2	6	245631	245636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_004572	ATA	2	6	245812	245817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_004572	ATA	2	6	245969	245974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004572	CA	3	6	246008	246013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_004572	CA	4	8	246024	246031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_004572	CA	3	6	246056	246061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_004572	TGC	2	6	246165	246170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_004572	CATTT	2	10	246174	246183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_004572	AC	3	6	249295	249300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_004572	AT	3	6	249302	249307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_004572	GTA	2	6	251112	251117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_004572	TAA	2	6	251141	251146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004572	GTA	2	6	251161	251166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004572	TAC	2	6	251204	251209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_004572	ACCTGC	2	12	251280	251291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_004572	GT	3	6	251359	251364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004572	AGC	2	6	251409	251414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_004572	GT	3	6	251428	251433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004572	GTTGT	2	10	251466	251475	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004572	TTG	2	6	251536	251541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004572	TA	3	6	251634	251639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_004572	TGG	2	6	251659	251664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004572	AAC	2	6	251728	251733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_004572	AC	4	8	251836	251843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_004572	TTGTG	2	10	251910	251919	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004572	TGT	2	6	251948	251953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004572	CG	3	6	251971	251976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_004572	CAA	2	6	252000	252005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_004572	ACA	2	6	252008	252013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_004572	CTGTG	2	10	252163	252172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_004572	GCTGTG	2	12	252242	252253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1072	NC_004572	CATATA	2	12	252265	252276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1073	NC_004572	CCG	2	6	252352	252357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_004572	ACC	2	6	252371	252376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_004572	TC	3	6	252380	252385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_004572	ATC	2	6	252396	252401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_004572	CT	3	6	252402	252407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_004572	CCA	2	6	252414	252419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_004572	CAA	2	6	252437	252442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_004572	CCA	2	6	252473	252478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_004572	ATCA	2	8	252493	252500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_004572	ATCT	2	8	252533	252540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_004572	CAA	2	6	252638	252643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_004572	AT	3	6	252646	252651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_004572	CAA	2	6	252784	252789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_004572	TGG	2	6	252818	252823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004572	CCAA	2	8	252870	252877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_004572	CAA	2	6	252916	252921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_004572	TA	3	6	252938	252943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004572	CTGC	2	8	253019	253026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_004572	CTG	2	6	253041	253046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_004572	CAA	2	6	253100	253105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_004572	AT	3	6	253108	253113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_004572	ATCA	2	8	253150	253157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_004572	GTG	2	6	253230	253235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004572	CAT	2	6	253293	253298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_004572	ACA	2	6	253301	253306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_004572	ACA	2	6	253325	253330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_004572	ACT	2	6	253343	253348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_004572	GGT	2	6	253349	253354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004572	AGT	2	6	253505	253510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004572	CA	3	6	253533	253538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_004572	GAA	3	9	253564	253572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004572	TGT	2	6	253631	253636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004572	ACC	2	6	253662	253667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_004572	GCAC	2	8	253691	253698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_004572	CAA	2	6	253709	253714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_004572	CAGG	2	8	253724	253731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_004572	GGT	2	6	253824	253829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004572	CCA	2	6	253876	253881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_004572	ACA	2	6	253920	253925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_004572	AAG	2	6	253965	253970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004572	CAC	2	6	254048	254053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_004572	AACA	2	8	254054	254061	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_004572	ATCA	2	8	254102	254109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_004572	CAT	2	6	254236	254241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004572	ACA	2	6	254244	254249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_004572	AT	3	6	254301	254306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004572	AC	3	6	254307	254312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_004572	GT	3	6	254353	254358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004572	GT	3	6	254401	254406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004572	ACA	3	9	254452	254460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_004572	CA	3	6	254491	254496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_004572	GCT	2	6	254497	254502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_004572	ACT	2	6	254840	254845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_004572	TCA	2	6	254967	254972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_004572	CA	3	6	255078	255083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_004572	ACC	2	6	255204	255209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_004572	ACC	2	6	255270	255275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_004572	AT	3	6	255282	255287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004572	CTT	2	6	255354	255359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_004572	TA	3	6	255370	255375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004572	CAA	2	6	255422	255427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_004572	TGG	2	6	255489	255494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004572	AAC	2	6	255588	255593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_004572	ACC	2	6	255616	255621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_004572	ACT	2	6	255713	255718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_004572	GCT	2	6	255781	255786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_004572	TCA	2	6	255892	255897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_004572	TA	4	8	256561	256568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1170	NC_004572	TAG	2	6	257299	257304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_004572	CTT	2	6	257348	257353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_004572	TAG	3	9	262955	262963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_004572	TATC	2	8	263422	263429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1271	NC_004572	GT	3	6	263897	263902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_004572	C	6	6	263934	263939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1274	NC_004572	TTAC	2	8	265166	265173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1414	NC_004572	GCC	2	6	281824	281829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1415	NC_004572	GTG	2	6	281833	281838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_004572	GGT	2	6	281913	281918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_004572	ACA	2	6	281922	281927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_004572	ACAGC	2	10	282037	282046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1419	NC_004572	ACCAC	2	10	282148	282157	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1420	NC_004572	TGT	2	6	282237	282242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_004572	TA	3	6	282443	282448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_004572	TGT	2	6	282941	282946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_004572	TA	3	6	283339	283344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_004572	TGA	2	6	283421	283426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_004572	GA	3	6	283507	283512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_004572	CAA	2	6	283602	283607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1449	NC_004572	TA	3	6	283625	283630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_004572	TA	3	6	283648	283653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_004572	TGG	2	6	283670	283675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_004572	TAG	2	6	283793	283798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1454	NC_004572	ACA	2	6	283904	283909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1459	NC_004572	GGT	2	6	284167	284172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_004572	GGT	2	6	284218	284223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1461	NC_004572	AG	3	6	284300	284305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_004572	TA	3	6	284473	284478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_004572	AT	3	6	284682	284687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_004572	TCG	2	6	284734	284739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1466	NC_004572	TC	3	6	284991	284996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1469	NC_004572	T	7	7	288845	288851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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