MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 2525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004572	TAG	2	6	174500	174505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004572	ATC	2	6	174521	174526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004572	CAG	2	6	174577	174582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_004572	TCTA	2	8	174587	174594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_004572	TA	3	6	174612	174617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004572	TC	3	6	174626	174631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_004572	CCA	2	6	174648	174653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_004572	CA	3	6	174652	174657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_004572	TTG	2	6	174680	174685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004572	AAC	2	6	174711	174716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_004572	CAA	2	6	174723	174728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_004572	ATC	2	6	174755	174760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_004572	CTT	2	6	174848	174853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_004572	CCT	2	6	174889	174894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_004572	CAA	2	6	174903	174908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_004572	TTG	2	6	174927	174932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004572	CTG	2	6	174977	174982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_004572	CA	3	6	175019	175024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_004572	TTC	2	6	175139	175144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004572	TGC	2	6	175178	175183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_004572	CAA	2	6	175195	175200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_004572	AG	3	6	175216	175221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004572	TGG	2	6	175286	175291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004572	TCTA	2	8	175316	175323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_004572	TA	4	8	175409	175416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004572	AGT	3	9	175418	175426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004572	CTT	2	6	175473	175478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004572	TAC	2	6	175487	175492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_004572	AT	3	6	175627	175632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004572	AC	3	6	175669	175674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_004572	CA	3	6	175676	175681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_004572	CTG	2	6	175704	175709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_004572	GTG	2	6	175716	175721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004572	CA	3	6	175761	175766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_004572	AG	3	6	175773	175778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004572	CCA	2	6	175782	175787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_004572	ATC	2	6	175792	175797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_004572	GCA	2	6	175800	175805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_004572	TC	3	6	175920	175925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_004572	CA	3	6	175968	175973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_004572	TTGTG	2	10	175996	176005	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004572	AT	3	6	176145	176150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004572	AC	4	8	176173	176180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_004572	CA	3	6	176196	176201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_004572	AG	3	6	176235	176240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004572	AGG	2	6	176261	176266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004572	GCA	2	6	176275	176280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_004572	CCTA	2	8	176369	176376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_004572	ATC	2	6	176415	176420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_004572	GCA	2	6	176423	176428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004572	TGG	2	6	176520	176525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004572	CCA	2	6	176570	176575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_004572	CA	3	6	176574	176579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_004572	CCTA	2	8	176618	176625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_004572	CAA	2	6	176645	176650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_004572	CA	3	6	176671	176676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_004572	ATC	2	6	176677	176682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_004572	TCTA	2	8	176737	176744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_004572	AACCAT	2	12	176829	176840	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_004572	ACA	3	9	176845	176853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_004572	ACC	2	6	176905	176910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_004572	AC	3	6	177136	177141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_004572	ACC	2	6	177160	177165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_004572	A	6	6	177185	177190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004572	ACTGCA	2	12	177280	177291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_004572	TGC	2	6	177339	177344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_004572	CTG	2	6	177407	177412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_004572	ACC	2	6	177522	177527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_004572	CA	3	6	177530	177535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_004572	CTT	2	6	177548	177553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_004572	TAGCC	2	10	177557	177566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
572	NC_004572	TG	3	6	177820	177825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004572	GT	3	6	177863	177868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_004572	TGTTAC	2	12	177891	177902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_004572	TTA	2	6	177911	177916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004572	CGC	2	6	177960	177965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_004572	AAC	2	6	177969	177974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_004572	CGC	2	6	178033	178038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_004572	CCT	2	6	178187	178192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_004572	CGC	2	6	178196	178201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_004572	AAC	2	6	178205	178210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_004572	C	6	6	178226	178231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
583	NC_004572	ATC	2	6	178237	178242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_004572	CTCC	2	8	178303	178310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
585	NC_004572	TCTA	2	8	178328	178335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_004572	CCTG	2	8	178416	178423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_004572	GC	3	6	178469	178474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_004572	CCT	2	6	178600	178605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_004572	AAC	2	6	178618	178623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_004572	AC	3	6	178688	178693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_004572	AC	3	6	178704	178709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_004572	AGC	2	6	178774	178779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_004572	TTA	2	6	181841	181846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004572	TC	4	8	181857	181864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_004572	GT	3	6	181873	181878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004572	AACA	2	8	181917	181924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_004572	GTA	2	6	181940	181945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004572	TGT	2	6	181967	181972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004572	ACAT	2	8	181973	181980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_004572	TACA	2	8	181990	181997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_004572	ACAT	2	8	182026	182033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_004572	ACATAA	2	12	182037	182048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_004572	GTT	2	6	182083	182088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004572	AAC	2	6	182105	182110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004572	AAC	2	6	182227	182232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004572	GTA	2	6	182266	182271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004572	AG	4	8	182290	182297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004572	A	6	6	182317	182322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_004572	CT	4	8	182336	182343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_004572	TCC	2	6	182381	182386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_004572	ATC	2	6	182388	182393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004572	CAGA	2	8	182418	182425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_004572	CCT	2	6	182428	182433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_004572	ATC	2	6	182448	182453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_004572	AGTA	2	8	182496	182503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004572	AAG	2	6	182516	182521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004572	AAC	2	6	182529	182534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_004572	TC	3	6	182548	182553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_004572	ACAAA	2	10	182578	182587	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
620	NC_004572	TC	3	6	182605	182610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_004572	AT	4	8	182630	182637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004572	AT	3	6	182676	182681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004572	AC	3	6	182687	182692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_004572	AT	3	6	182693	182698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004572	CT	3	6	182699	182704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_004572	CAT	2	6	182729	182734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_004572	ACA	2	6	182806	182811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_004572	AAC	2	6	182832	182837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_004572	TCT	3	9	182846	182854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_004572	ACAT	2	8	182858	182865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_004572	AGAT	2	8	182906	182913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004572	TC	3	6	182922	182927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_004572	TC	3	6	182963	182968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_004572	AC	3	6	182971	182976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_004572	CAAA	2	8	182978	182985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
636	NC_004572	ATAG	2	8	182995	183002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_004572	TC	3	6	183021	183026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_004572	AGCCAT	2	12	183051	183062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_004572	ACC	2	6	183076	183081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_004572	TGA	2	6	183102	183107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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949	NC_004572	ATT	2	6	240617	240622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_004572	CACT	2	8	240802	240809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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981	NC_004572	TA	3	6	242528	242533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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