MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004113	TC	3	6	1389116	1389121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_004113	GAAG	2	8	1389123	1389130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_004113	TATC	2	8	1389136	1389143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_004113	GCG	2	6	1389235	1389240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_004113	ATTGCC	2	12	1389276	1389287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_004113	AGG	2	6	1389293	1389298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_004113	AAGG	2	8	1389301	1389308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_004113	GCT	2	6	1389318	1389323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_004113	TTGAG	2	10	1389335	1389344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_004113	CGG	3	9	1395410	1395418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_004113	ATT	2	6	1395431	1395436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_004113	A	6	6	1395441	1395446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_004113	A	7	7	1395452	1395458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_004113	CAGT	2	8	1398600	1398607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_004113	CTC	2	6	1398704	1398709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_004113	A	6	6	1398781	1398786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_004113	AGCA	2	8	1398868	1398875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_004113	CGA	2	6	1400122	1400127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_004113	ATG	2	6	1400185	1400190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_004113	CTAT	2	8	1400234	1400241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_004113	AGC	3	9	1400263	1400271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_004113	TC	3	6	1400296	1400301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_004113	CGGTA	2	10	1400348	1400357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_004113	CAT	2	6	1400654	1400659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_004113	AGG	2	6	1400706	1400711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_004113	GAAG	2	8	1400743	1400750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_004113	CG	3	6	1400762	1400767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_004113	AGA	2	6	1402356	1402361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_004113	TATT	2	8	1402376	1402383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_004113	GTC	2	6	1402407	1402412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_004113	CAT	2	6	1402450	1402455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_004113	T	6	6	1402484	1402489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_004113	AAT	2	6	1402577	1402582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_004113	TTC	2	6	1402814	1402819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_004113	ATT	2	6	1402896	1402901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_004113	GGC	2	6	1403947	1403952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_004113	GGC	2	6	1403977	1403982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_004113	GT	3	6	1404027	1404032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_004113	TGG	2	6	1404042	1404047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_004113	CTG	2	6	1404053	1404058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_004113	CAC	2	6	1405406	1405411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2542	NC_004113	CCAT	2	8	1405745	1405752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_004113	GAGAA	2	10	1405770	1405779	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_004113	AATA	2	8	1406056	1406063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_004113	A	6	6	1406107	1406112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_004113	CAA	2	6	1406186	1406191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_004113	ATTG	2	8	1407797	1407804	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_004113	CA	3	6	1410015	1410020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_004113	TCA	2	6	1410035	1410040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_004113	T	7	7	1410042	1410048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_004113	GTT	2	6	1413159	1413164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_004113	GA	3	6	1413165	1413170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_004113	AAT	2	6	1416243	1416248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_004113	CTG	2	6	1419830	1419835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_004113	TTC	2	6	1419838	1419843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_004113	TTG	2	6	1419858	1419863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_004113	GT	3	6	1419930	1419935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_004113	TGAT	2	8	1419936	1419943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_004113	T	6	6	1420039	1420044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_004113	GA	4	8	1420110	1420117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_004113	CTG	2	6	1420252	1420257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_004113	CCT	2	6	1420271	1420276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2563	NC_004113	GAT	2	6	1420316	1420321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_004113	C	6	6	1428561	1428566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2565	NC_004113	T	7	7	1428571	1428577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_004113	GCTA	2	8	1428584	1428591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2567	NC_004113	GA	3	6	1433353	1433358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_004113	TAT	2	6	1433394	1433399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_004113	GGC	2	6	1433484	1433489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_004113	GGC	2	6	1433530	1433535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_004113	AAC	2	6	1433569	1433574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_004113	CAGG	2	8	1433620	1433627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_004113	GGA	2	6	1433628	1433633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_004113	CAA	2	6	1433728	1433733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_004113	GGC	2	6	1433738	1433743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_004113	CTGT	2	8	1433810	1433817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_004113	ACC	2	6	1436469	1436474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_004113	GAG	2	6	1437468	1437473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_004113	AGG	2	6	1438659	1438664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_004113	GGA	2	6	1438693	1438698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_004113	CCT	2	6	1440908	1440913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_004113	CGC	2	6	1440923	1440928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_004113	GCT	2	6	1440949	1440954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_004113	ACA	2	6	1440980	1440985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_004113	TCC	2	6	1440994	1440999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_004113	C	6	6	1440998	1441003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2587	NC_004113	TCCC	2	8	1442270	1442277	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2588	NC_004113	TC	3	6	1442295	1442300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_004113	GAA	2	6	1444204	1444209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_004113	A	6	6	1444208	1444213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_004113	GT	3	6	1444293	1444298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_004113	CGT	3	9	1444305	1444313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_004113	GCC	2	6	1444330	1444335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2594	NC_004113	TGC	2	6	1444426	1444431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_004113	C	6	6	1448948	1448953	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2596	NC_004113	TCA	2	6	1448982	1448987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_004113	GCC	3	9	1449032	1449040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_004113	CAT	2	6	1450548	1450553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_004113	ACC	2	6	1450560	1450565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_004113	ACC	2	6	1450587	1450592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_004113	CGT	2	6	1451936	1451941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_004113	T	6	6	1453014	1453019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_004113	TAG	2	6	1453081	1453086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_004113	GCTAG	2	10	1453904	1453913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2605	NC_004113	ACT	2	6	1453915	1453920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_004113	ATACA	2	10	1453983	1453992	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2607	NC_004113	GGA	2	6	1456668	1456673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_004113	GGT	2	6	1456720	1456725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_004113	GCC	2	6	1456757	1456762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_004113	ATGG	2	8	1456972	1456979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_004113	AGT	2	6	1457005	1457010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_004113	ATAGTT	2	12	1457030	1457041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_004113	GCT	2	6	1457084	1457089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_004113	CAA	2	6	1457171	1457176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_004113	GGAG	2	8	1457177	1457184	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_004113	GCCC	2	8	1457232	1457239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2617	NC_004113	TGA	2	6	1457250	1457255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_004113	GA	3	6	1458541	1458546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_004113	CAC	2	6	1460248	1460253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2620	NC_004113	CGC	2	6	1460286	1460291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_004113	TAT	2	6	1460362	1460367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_004113	CTC	2	6	1460384	1460389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_004113	AGC	2	6	1460463	1460468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_004113	AAT	2	6	1460469	1460474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_004113	ATT	2	6	1464835	1464840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_004113	CGG	2	6	1464883	1464888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_004113	TGGA	2	8	1464906	1464913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_004113	GCT	2	6	1466078	1466083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_004113	TACCC	2	10	1469675	1469684	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2630	NC_004113	A	6	6	1469768	1469773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_004113	AGC	2	6	1471589	1471594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_004113	TCGC	2	8	1475100	1475107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2633	NC_004113	TC	3	6	1476459	1476464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_004113	AAGA	2	8	1477019	1477026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2636	NC_004113	TTGA	2	8	1477047	1477054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2644	NC_004113	CT	3	6	1480028	1480033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2645	NC_004113	G	6	6	1480038	1480043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2647	NC_004113	ACTTT	2	10	1487416	1487425	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2654	NC_004113	CTAGC	2	10	1491348	1491357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2752	NC_004113	GTC	2	6	1541929	1541934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2754	NC_004113	CGA	2	6	1542032	1542037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2756	NC_004113	GA	3	6	1542127	1542132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2757	NC_004113	GC	3	6	1542200	1542205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2758	NC_004113	CCTT	2	8	1542224	1542231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2759	NC_004113	AG	3	6	1542654	1542659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2760	NC_004113	GCT	2	6	1542683	1542688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_004113	AGT	2	6	1542721	1542726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2762	NC_004113	CGGCA	2	10	1542741	1542750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2897	NC_004113	T	6	6	1597686	1597691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2898	NC_004113	CGC	2	6	1597752	1597757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2900	NC_004113	CTT	2	6	1601971	1601976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2902	NC_004113	GGT	2	6	1602635	1602640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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