MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004113	CTT	2	6	823137	823142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_004113	A	6	6	825672	825677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_004113	AGCC	2	8	826239	826246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_004113	AGC	2	6	826347	826352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_004113	CGG	2	6	827062	827067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_004113	GATT	2	8	827121	827128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004113	GATG	2	8	828227	828234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_004113	GAG	2	6	828293	828298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_004113	CAG	2	6	828338	828343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_004113	AG	3	6	828362	828367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_004113	AAGA	2	8	828436	828443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_004113	T	6	6	828461	828466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_004113	CCA	2	6	828580	828585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_004113	ATT	2	6	829148	829153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_004113	CTG	2	6	829169	829174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_004113	AAT	2	6	829221	829226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_004113	CAG	2	6	830781	830786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_004113	TCC	2	6	832796	832801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_004113	GT	3	6	832826	832831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_004113	T	6	6	833488	833493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004113	TAT	2	6	833497	833502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_004113	CTC	2	6	835614	835619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_004113	A	6	6	836601	836606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004113	CAGC	2	8	836640	836647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_004113	GAT	2	6	836697	836702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_004113	GCAA	2	8	836705	836712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_004113	T	7	7	840218	840224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004113	ATA	2	6	840315	840320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_004113	CTG	2	6	840937	840942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_004113	GTC	2	6	840981	840986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_004113	TTTGT	2	10	841426	841435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_004113	GTT	2	6	841439	841444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_004113	AGC	2	6	843598	843603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_004113	GT	3	6	843712	843717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_004113	CAC	2	6	843719	843724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_004113	AAC	2	6	843747	843752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_004113	TGC	2	6	843788	843793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_004113	GAAA	2	8	846762	846769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_004113	GA	3	6	847977	847982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_004113	TAT	2	6	848476	848481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004113	TGC	2	6	848551	848556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_004113	GTG	2	6	848567	848572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_004113	TGC	2	6	850225	850230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_004113	ACC	2	6	850244	850249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_004113	CAG	2	6	850582	850587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_004113	TGT	2	6	850666	850671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_004113	AGAT	2	8	852752	852759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_004113	TTA	2	6	852770	852775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_004113	GAC	2	6	852788	852793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_004113	GGTG	2	8	856497	856504	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_004113	TCA	2	6	856532	856537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_004113	AGC	2	6	856539	856544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_004113	GAC	2	6	856613	856618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_004113	TAA	2	6	856625	856630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_004113	G	6	6	857447	857452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_004113	GAT	2	6	857471	857476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_004113	CTTT	2	8	858821	858828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_004113	AT	3	6	859607	859612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_004113	A	6	6	859623	859628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_004113	CT	3	6	859694	859699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_004113	GA	3	6	859900	859905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_004113	G	6	6	859908	859913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_004113	AAT	2	6	861290	861295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_004113	AGC	2	6	861337	861342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_004113	CCG	2	6	861422	861427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_004113	TCC	2	6	861434	861439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_004113	TCA	2	6	861445	861450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_004113	TC	3	6	861464	861469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_004113	G	6	6	861473	861478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_004113	GGT	2	6	861542	861547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_004113	TAT	2	6	861549	861554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_004113	T	6	6	861569	861574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_004113	TCCG	2	8	861580	861587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_004113	TTG	2	6	862775	862780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_004113	GTT	2	6	864710	864715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_004113	GCT	2	6	865281	865286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_004113	GCC	2	6	865387	865392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_004113	CCAT	2	8	865405	865412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_004113	AGG	2	6	868874	868879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_004113	GGC	2	6	869153	869158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_004113	GCTA	2	8	869185	869192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_004113	TAT	2	6	869195	869200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_004113	CTG	2	6	873867	873872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1593	NC_004113	A	7	7	881047	881053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_004113	ATT	2	6	881092	881097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_004113	AAG	2	6	881171	881176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_004113	CTA	2	6	882075	882080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_004113	CGT	2	6	882108	882113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_004113	C	6	6	882171	882176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1602	NC_004113	TGA	2	6	882181	882186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004113	GC	3	6	883470	883475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_004113	TCC	2	6	883540	883545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_004113	T	6	6	883586	883591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_004113	AGGC	2	8	883634	883641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_004113	CGC	2	6	883665	883670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_004113	C	6	6	885511	885516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1609	NC_004113	AAT	2	6	885529	885534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_004113	C	6	6	885604	885609	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1611	NC_004113	A	7	7	886689	886695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004113	A	6	6	886701	886706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004113	AG	3	6	889282	889287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_004113	GTT	2	6	889389	889394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_004113	TC	3	6	889403	889408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_004113	CTAAAA	2	12	889431	889442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1618	NC_004113	AAT	2	6	889941	889946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_004113	T	7	7	889970	889976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_004113	A	6	6	889996	890001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_004113	ATTT	2	8	890634	890641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004113	TCA	2	6	893846	893851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_004113	CTG	2	6	897141	897146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_004113	TC	3	6	899006	899011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_004113	AGG	2	6	899021	899026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_004113	ACG	2	6	900268	900273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_004113	TA	3	6	900277	900282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_004113	GCA	2	6	902927	902932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_004113	GAA	2	6	903927	903932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_004113	AGG	2	6	903962	903967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_004113	GTT	2	6	904016	904021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_004113	GCT	2	6	904046	904051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_004113	GCT	2	6	905562	905567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_004113	GCT	2	6	905626	905631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_004113	T	6	6	907450	907455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1803	NC_004113	TCA	2	6	1016453	1016458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1898	NC_004113	CAT	2	6	1079620	1079625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1899	NC_004113	T	6	6	1079639	1079644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1900	NC_004113	TCGG	2	8	1079691	1079698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1901	NC_004113	AAAG	2	8	1079846	1079853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1902	NC_004113	AAT	2	6	1079963	1079968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1903	NC_004113	TGT	2	6	1080052	1080057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1904	NC_004113	GTC	2	6	1080102	1080107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1905	NC_004113	GTT	2	6	1080216	1080221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1906	NC_004113	TCG	2	6	1080233	1080238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1907	NC_004113	CTT	2	6	1080246	1080251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_004113	TGC	2	6	1080260	1080265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1909	NC_004113	T	6	6	1080289	1080294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_004113	ATT	2	6	1081553	1081558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_004113	CTG	2	6	1082491	1082496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1912	NC_004113	TAGAA	2	10	1083993	1084002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1917	NC_004113	TAG	2	6	1089089	1089094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1923	NC_004113	CGAA	2	8	1091295	1091302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1926	NC_004113	CT	3	6	1091540	1091545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1927	NC_004113	GCA	2	6	1091584	1091589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1929	NC_004113	TTCTG	2	10	1091731	1091740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1930	NC_004113	AAC	2	6	1091865	1091870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1931	NC_004113	AGC	2	6	1091871	1091876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1932	NC_004113	GATG	2	8	1091935	1091942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_004113	AGC	2	6	1091971	1091976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1934	NC_004113	GAG	2	6	1092084	1092089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_004113	CAAA	2	8	1092097	1092104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1936	NC_004113	TGA	2	6	1092727	1092732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_004113	ACA	2	6	1092872	1092877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1938	NC_004113	TCC	2	6	1092887	1092892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1939	NC_004113	ATG	2	6	1092920	1092925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1941	NC_004113	ACT	2	6	1099382	1099387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1942	NC_004113	CAT	2	6	1099388	1099393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_004113	CAGC	2	8	1099430	1099437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1944	NC_004113	GCA	2	6	1100432	1100437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1947	NC_004113	TTG	2	6	1102339	1102344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1953	NC_004113	TTTCC	2	10	1106442	1106451	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1958	NC_004113	ACA	2	6	1109708	1109713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1962	NC_004113	ACTT	2	8	1109983	1109990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1968	NC_004113	CATAG	2	10	1120554	1120563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1984	NC_004113	TTAG	2	8	1123903	1123910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1985	NC_004113	AG	3	6	1126345	1126350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1986	NC_004113	GTG	2	6	1127169	1127174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1990	NC_004113	GATC	2	8	1130707	1130714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1994	NC_004113	CAA	2	6	1130954	1130959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1995	NC_004113	AAC	2	6	1130962	1130967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1996	NC_004113	TGG	2	6	1130979	1130984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_004113	TCC	2	6	1131147	1131152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1998	NC_004113	TA	3	6	1134025	1134030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_004113	T	7	7	1134038	1134044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_004113	GTA	2	6	1142143	1142148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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