MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004113	C	6	6	508193	508198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1002	NC_004113	ATT	2	6	509412	509417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004113	TCCC	2	8	509465	509472	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1004	NC_004113	AGG	2	6	509481	509486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004113	TC	3	6	509490	509495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_004113	TC	3	6	510611	510616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_004113	GAA	2	6	510630	510635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004113	AG	3	6	510648	510653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004113	AAT	2	6	510675	510680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004113	CAG	2	6	511056	511061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_004113	CT	3	6	511446	511451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_004113	GTA	2	6	511494	511499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004113	CGG	2	6	511549	511554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_004113	AGAT	2	8	511565	511572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004113	AAG	2	6	511584	511589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_004113	GAT	2	6	511712	511717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004113	GAG	2	6	511795	511800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004113	CTG	2	6	514586	514591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_004113	TGG	2	6	518869	518874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004113	TA	3	6	519469	519474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_004113	GAT	2	6	519504	519509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004113	CAA	2	6	519523	519528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_004113	GTT	2	6	519544	519549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004113	CCGAA	2	10	519622	519631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_004113	GAG	2	6	519651	519656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004113	AAGTG	2	10	519715	519724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004113	CTG	2	6	519803	519808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_004113	CAC	2	6	519851	519856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_004113	AGGC	2	8	519918	519925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_004113	TGA	2	6	519942	519947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004113	CCCG	2	8	520031	520038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1032	NC_004113	CTG	2	6	520055	520060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_004113	GAT	2	6	520132	520137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004113	CAA	2	6	520151	520156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_004113	GTT	2	6	520172	520177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_004113	AGG	2	6	520195	520200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004113	GAG	2	6	520279	520284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004113	AAGTG	2	10	520343	520352	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_004113	GGATT	2	10	520420	520429	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004113	TGCT	2	8	520433	520440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_004113	CCG	2	6	520465	520470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_004113	CAC	2	6	520480	520485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_004113	AGGC	2	8	520547	520554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_004113	AGG	2	6	520589	520594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004113	CAT	2	6	520662	520667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_004113	C	6	6	520700	520705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_004113	AG	3	6	520799	520804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_004113	TGCA	2	8	520829	520836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_004113	G	6	6	520866	520871	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004113	C	6	6	522690	522695	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1051	NC_004113	CCTGC	2	10	524082	524091	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1052	NC_004113	GA	3	6	524153	524158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004113	ACTTT	2	10	524213	524222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_004113	CCT	2	6	524240	524245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_004113	T	6	6	526249	526254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004113	TGA	2	6	526261	526266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004113	CTG	2	6	526285	526290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_004113	T	6	6	526300	526305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004113	T	6	6	527192	527197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004113	GCTG	2	8	527210	527217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_004113	GTT	2	6	527240	527245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_004113	GCG	2	6	527293	527298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_004113	A	8	8	529506	529513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004113	AT	3	6	529664	529669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004113	TTAA	2	8	532921	532928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004113	CA	3	6	532962	532967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_004113	GC	3	6	532969	532974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_004113	TCA	2	6	533106	533111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_004113	C	6	6	533809	533814	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1070	NC_004113	A	6	6	533829	533834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004113	AGC	2	6	533842	533847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_004113	CGC	2	6	534729	534734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_004113	AGG	2	6	534760	534765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004113	GCT	2	6	534788	534793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_004113	TCTAG	2	10	534891	534900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_004113	ACT	2	6	534913	534918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_004113	GCT	2	6	534926	534931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_004113	CTG	2	6	535279	535284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_004113	GCC	2	6	542504	542509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_004113	ATG	2	6	542519	542524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_004113	CCT	2	6	545117	545122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_004113	TC	3	6	545157	545162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_004113	GTG	2	6	545170	545175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004113	GCC	2	6	545699	545704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1086	NC_004113	GCA	2	6	545852	545857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_004113	TAAA	2	8	545946	545953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004113	AC	3	6	546800	546805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_004113	CAAT	2	8	547139	547146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_004113	CAA	2	6	547151	547156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_004113	C	6	6	550455	550460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1092	NC_004113	CGT	2	6	553892	553897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_004113	TCA	2	6	554910	554915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_004113	GCC	2	6	555339	555344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_004113	GTT	2	6	555371	555376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004113	GTT	2	6	555385	555390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004113	CAG	2	6	555649	555654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_004113	GCT	2	6	555684	555689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_004113	GGC	2	6	555720	555725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_004113	CTG	2	6	557906	557911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_004113	AC	3	6	557971	557976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_004113	AGCTA	2	10	558006	558015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_004113	GCC	2	6	558117	558122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_004113	T	6	6	558163	558168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004113	GT	3	6	558198	558203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004113	TCA	2	6	558282	558287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_004113	CATTT	2	10	558327	558336	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_004113	AGG	2	6	562385	562390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004113	CT	3	6	562477	562482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_004113	CGA	2	6	562490	562495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_004113	CGA	2	6	563272	563277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_004113	ATG	2	6	564376	564381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004113	CTG	3	9	564443	564451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_004113	CAT	2	6	564567	564572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_004113	GGTA	2	8	564884	564891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004113	GTA	2	6	564988	564993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_004113	GGC	2	6	565026	565031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_004113	ACTC	2	8	565074	565081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_004113	CTA	2	6	565226	565231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004113	TGA	2	6	573677	573682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004113	A	7	7	573788	573794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004113	AGAGG	2	10	573806	573815	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004113	AGC	2	6	573820	573825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_004113	AAAT	2	8	573827	573834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004113	CAG	2	6	575652	575657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_004113	CTTGC	2	10	575757	575766	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1127	NC_004113	TTG	2	6	575792	575797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004113	AGGC	2	8	576712	576719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_004113	TATT	2	8	576750	576757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004113	CCT	2	6	576779	576784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_004113	TGG	2	6	577866	577871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004113	AGGC	2	8	579346	579353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_004113	C	6	6	579374	579379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1134	NC_004113	AGC	2	6	585395	585400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_004113	TGA	3	9	586158	586166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_004113	GTT	2	6	586178	586183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_004113	G	6	6	588381	588386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_004113	CGA	2	6	590487	590492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_004113	CCTA	2	8	590494	590501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_004113	GTAT	2	8	592781	592788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_004113	CTT	2	6	592839	592844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_004113	CAG	2	6	596090	596095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1144	NC_004113	GGC	2	6	596981	596986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_004113	GCA	2	6	597002	597007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1148	NC_004113	GCGA	2	8	598388	598395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1149	NC_004113	GT	3	6	599898	599903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_004113	GAG	2	6	599904	599909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_004113	GTC	2	6	599946	599951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1155	NC_004113	T	6	6	604097	604102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_004113	CAC	2	6	604109	604114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1159	NC_004113	TCC	2	6	611382	611387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1163	NC_004113	TC	3	6	612683	612688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1164	NC_004113	CAG	2	6	615139	615144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1167	NC_004113	CTG	2	6	615241	615246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1172	NC_004113	CGC	2	6	615431	615436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1225	NC_004113	GTT	2	6	632164	632169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_004113	GCC	2	6	659674	659679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_004113	CTAAA	2	10	659751	659760	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1256	NC_004113	GT	3	6	668033	668038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_004113	ACT	2	6	670278	670283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_004113	ACA	2	6	670427	670432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_004113	ATA	2	6	670434	670439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_004113	TGC	2	6	670480	670485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_004113	AG	3	6	670551	670556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_004113	CTAA	2	8	673653	673660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1268	NC_004113	TTA	2	6	673673	673678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_004113	GCA	2	6	772230	772235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_004113	CAG	3	9	772248	772256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_004113	GTG	2	6	772304	772309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_004113	TTC	2	6	772470	772475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_004113	CCT	2	6	772492	772497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_004113	GGCG	2	8	772502	772509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1413	NC_004113	TGT	2	6	773963	773968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_004113	T	7	7	777764	777770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_004113	GAT	2	6	777773	777778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_004113	TAT	2	6	778493	778498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_004113	ACA	2	6	779299	779304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_004113	ATG	3	9	781159	781167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1426	NC_004113	G	6	6	782277	782282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_004113	CTG	2	6	782318	782323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_004113	TAG	2	6	786550	786555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_004113	ATAG	2	8	786627	786634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_004113	GA	3	6	786712	786717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_004113	TCA	2	6	786754	786759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_004113	T	6	6	791096	791101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_004113	GCAAT	2	10	791115	791124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1445	NC_004113	GAT	2	6	792704	792709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_004113	CTG	2	6	792801	792806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1454	NC_004113	GGT	2	6	797452	797457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_004113	CGCC	2	8	804951	804958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1482	NC_004113	GCT	2	6	804993	804998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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