MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002578	CT	3	6	16740	16745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002578	AT	4	8	16876	16883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002578	CT	3	6	16961	16966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002578	TA	3	6	25483	25488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002578	TA	3	6	25492	25497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002578	AT	3	6	30296	30301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002578	CG	3	6	35838	35843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002578	GA	3	6	38834	38839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002578	TG	3	6	40400	40405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002578	AT	4	8	42726	42733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002578	AT	3	6	42809	42814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002578	AT	4	8	46632	46639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002578	TA	3	6	46641	46646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002578	CG	3	6	54779	54784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002578	AT	3	6	58663	58668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002578	AT	3	6	58720	58725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002578	TC	3	6	64035	64040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002578	AT	4	8	66154	66161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002578	AT	3	6	68429	68434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002578	TC	3	6	69658	69663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002578	TC	3	6	69673	69678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002578	AT	3	6	69680	69685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002578	CT	3	6	69690	69695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002578	AT	3	6	70190	70195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002578	TA	4	8	70555	70562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002578	TG	3	6	82044	82049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002578	AT	3	6	82079	82084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002578	GT	3	6	83154	83159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002578	GA	3	6	84567	84572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002578	AT	3	6	85435	85440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002578	AT	3	6	85468	85473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002578	TA	3	6	88337	88342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002578	CT	3	6	89454	89459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002578	AT	3	6	89470	89475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002578	AT	3	6	92068	92073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002578	TG	3	6	92085	92090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002578	TG	3	6	92092	92097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002578	TA	3	6	92109	92114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002578	AT	3	6	95024	95029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002578	AG	3	6	101959	101964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002578	TA	4	8	102518	102525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002578	AT	4	8	102549	102556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002578	TA	3	6	119102	119107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002578	AG	3	6	119178	119183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002578	TA	3	6	119184	119189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002578	TA	4	8	132364	132371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002578	AT	4	8	132400	132407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002578	AT	4	8	140685	140692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002578	AT	3	6	140912	140917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002578	TA	3	6	141910	141915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002578	GA	3	6	146760	146765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002578	AG	4	8	147693	147700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002578	AG	3	6	147858	147863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002578	AT	3	6	148135	148140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002578	TA	3	6	153490	153495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_002578	AT	3	6	155578	155583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002578	AT	3	6	155589	155594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002578	AC	3	6	164024	164029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002578	AT	3	6	166959	166964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002578	TA	3	6	167558	167563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002578	AT	3	6	168745	168750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002578	AT	3	6	169488	169493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002578	AT	3	6	173276	173281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002578	AT	3	6	174479	174484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002578	TA	3	6	174487	174492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002578	AT	3	6	176916	176921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_002578	TA	3	6	190034	190039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002578	AT	3	6	190391	190396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002578	TA	3	6	192503	192508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002578	GT	3	6	194400	194405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002578	AT	3	6	202356	202361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002578	TG	3	6	210560	210565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002578	TA	3	6	212707	212712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002578	TA	3	6	214443	214448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_002578	GT	3	6	229670	229675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002578	AT	4	8	232189	232196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002578	AT	4	8	235368	235375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002578	TA	4	8	236616	236623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002578	GA	3	6	237276	237281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002578	AT	3	6	237708	237713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_002578	AT	4	8	259062	259069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_002578	TA	3	6	264513	264518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002578	AT	3	6	266664	266669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002578	TA	3	6	269376	269381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002578	TA	3	6	269443	269448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002578	AT	4	8	272172	272179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_002578	TA	3	6	306830	306835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_002578	AT	4	8	317677	317684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002578	TA	3	6	325643	325648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_002578	TA	3	6	336953	336958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002578	CA	3	6	341202	341207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002578	TA	4	8	346211	346218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002578	TA	3	6	346243	346248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002578	TC	3	6	346250	346255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002578	AT	3	6	346266	346271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002578	AT	4	8	356638	356645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002578	TC	3	6	363716	363721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002578	AT	3	6	367895	367900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002578	AT	3	6	375463	375468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002578	TA	3	6	378246	378251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002578	CA	3	6	382202	382207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002578	TC	3	6	386051	386056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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126	NC_002578	GA	3	6	389926	389931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002578	AC	3	6	389976	389981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_002578	TA	3	6	390730	390735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002578	AT	3	6	390736	390741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002578	AT	4	8	390758	390765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002578	TA	3	6	391033	391038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002578	CA	3	6	391362	391367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002578	GT	3	6	391641	391646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_002578	TA	3	6	396821	396826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002578	AT	4	8	396938	396945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002578	AT	3	6	397255	397260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002578	TA	4	8	397991	397998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002578	AT	3	6	398224	398229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002578	AG	3	6	405510	405515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002578	TG	3	6	405609	405614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002578	AT	3	6	405791	405796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002578	TC	3	6	407091	407096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002578	AT	3	6	408101	408106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002578	TA	3	6	408121	408126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_002578	TC	3	6	409985	409990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_002578	TA	3	6	411473	411478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_002578	AT	3	6	448683	448688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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