MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 4125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002578	TCT	2	6	1388986	1388991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_002578	CGT	2	6	1389006	1389011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_002578	CT	3	6	1389031	1389036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_002578	ATT	2	6	1389110	1389115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_002578	AT	3	6	1392401	1392406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_002578	A	7	7	1392419	1392425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_002578	CCTTA	2	10	1392427	1392436	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3508	NC_002578	AAG	2	6	1393009	1393014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_002578	ACG	2	6	1393054	1393059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_002578	TAGA	2	8	1393081	1393088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_002578	A	6	6	1393088	1393093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_002578	GTG	2	6	1393100	1393105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_002578	T	7	7	1393116	1393122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_002578	TCT	2	6	1393132	1393137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_002578	ATC	2	6	1393164	1393169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_002578	TA	3	6	1394290	1394295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_002578	GGCAA	2	10	1394421	1394430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3518	NC_002578	CGT	3	9	1394443	1394451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_002578	GAT	2	6	1394476	1394481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_002578	GAA	2	6	1395724	1395729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_002578	AGCG	2	8	1398458	1398465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_002578	TCT	2	6	1398512	1398517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_002578	CCTA	2	8	1398531	1398538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_002578	ATA	2	6	1398583	1398588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_002578	TCA	2	6	1398607	1398612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_002578	CAATA	2	10	1398641	1398650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_002578	A	6	6	1398666	1398671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_002578	A	7	7	1398687	1398693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_002578	CTG	2	6	1398721	1398726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_002578	GCT	2	6	1398738	1398743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_002578	TAT	2	6	1398792	1398797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_002578	T	6	6	1398797	1398802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_002578	TGG	2	6	1400120	1400125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_002578	AT	3	6	1400140	1400145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_002578	TA	3	6	1400180	1400185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_002578	CA	3	6	1402293	1402298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_002578	CGG	2	6	1402911	1402916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_002578	ATC	2	6	1402950	1402955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_002578	TAA	2	6	1404309	1404314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_002578	TGTA	2	8	1404322	1404329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_002578	A	6	6	1404337	1404342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_002578	TATAT	2	10	1404427	1404436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_002578	ATG	2	6	1404455	1404460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_002578	CCT	2	6	1404562	1404567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_002578	TTAAA	2	10	1404623	1404632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_002578	TTAA	2	8	1405676	1405683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_002578	TAT	2	6	1405743	1405748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_002578	GTG	2	6	1405775	1405780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_002578	ATG	2	6	1408521	1408526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_002578	ATTT	2	8	1408527	1408534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_002578	AGG	2	6	1409218	1409223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_002578	TAT	2	6	1409253	1409258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_002578	GCG	2	6	1409271	1409276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_002578	TTA	2	6	1409301	1409306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_002578	GTG	2	6	1409330	1409335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_002578	TTA	2	6	1409359	1409364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_002578	ACA	2	6	1409395	1409400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_002578	AGGTG	2	10	1409495	1409504	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_002578	AGA	2	6	1409512	1409517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_002578	GGT	2	6	1409574	1409579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_002578	CAA	2	6	1409909	1409914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_002578	ATTT	2	8	1409918	1409925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_002578	A	6	6	1410885	1410890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_002578	TCT	2	6	1410898	1410903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_002578	AGATA	2	10	1411438	1411447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_002578	TAAT	2	8	1411473	1411480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_002578	ATA	2	6	1411489	1411494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_002578	ATT	2	6	1411509	1411514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_002578	CAT	2	6	1411528	1411533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_002578	CTCA	2	8	1411538	1411545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_002578	AATG	2	8	1411552	1411559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_002578	TAA	2	6	1411570	1411575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_002578	ATA	2	6	1411631	1411636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_002578	T	7	7	1414226	1414232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_002578	TC	3	6	1414310	1414315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_002578	CGTAA	2	10	1415730	1415739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3577	NC_002578	TCT	2	6	1416263	1416268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_002578	T	6	6	1416299	1416304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_002578	GATAA	2	10	1416359	1416368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_002578	TCTT	2	8	1416376	1416383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_002578	TAT	3	9	1416389	1416397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_002578	TCA	2	6	1416432	1416437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_002578	AAG	2	6	1416515	1416520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_002578	ATC	2	6	1416524	1416529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_002578	AGCA	2	8	1416566	1416573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_002578	A	9	9	1417036	1417044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_002578	CTT	2	6	1417153	1417158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_002578	ATT	2	6	1418133	1418138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_002578	AGC	2	6	1418141	1418146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_002578	CTG	2	6	1418149	1418154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_002578	AAT	2	6	1418201	1418206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_002578	TAAT	2	8	1418213	1418220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_002578	ATA	2	6	1418233	1418238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_002578	TA	3	6	1418266	1418271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_002578	TTC	2	6	1420049	1420054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_002578	AAAT	2	8	1420061	1420068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_002578	TTTAAA	2	12	1420446	1420457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_002578	ATG	2	6	1420482	1420487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_002578	ATG	2	6	1420492	1420497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_002578	GGAC	2	8	1420513	1420520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_002578	GAT	2	6	1422746	1422751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_002578	A	6	6	1422752	1422757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_002578	TAA	2	6	1422758	1422763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_002578	A	6	6	1422762	1422767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_002578	TTC	2	6	1422831	1422836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_002578	T	6	6	1422992	1422997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_002578	TA	3	6	1423009	1423014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_002578	TA	3	6	1423020	1423025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_002578	AAAT	2	8	1424437	1424444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_002578	TA	3	6	1424455	1424460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_002578	AT	3	6	1425934	1425939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_002578	TA	3	6	1425950	1425955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_002578	TA	3	6	1425957	1425962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_002578	TAT	2	6	1425982	1425987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_002578	AT	4	8	1425986	1425993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_002578	ATG	2	6	1428681	1428686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_002578	CAAG	2	8	1428747	1428754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_002578	GAG	2	6	1428785	1428790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_002578	AGGA	2	8	1428794	1428801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_002578	GAA	2	6	1428824	1428829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_002578	AAT	2	6	1429400	1429405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_002578	GAAAT	2	10	1429445	1429454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_002578	A	6	6	1429459	1429464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_002578	AAT	2	6	1429500	1429505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_002578	GAAA	2	8	1429512	1429519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_002578	A	6	6	1429532	1429537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_002578	GT	3	6	1429551	1429556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_002578	A	6	6	1429559	1429564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_002578	A	6	6	1429587	1429592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_002578	TAA	2	6	1429596	1429601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_002578	AT	3	6	1429602	1429607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_002578	TAA	2	6	1431538	1431543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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