MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 4125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002578	ATTT	2	8	211469	211476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_002578	ATG	2	6	211488	211493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002578	TA	3	6	212707	212712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002578	TA	3	6	214443	214448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_002578	ATC	2	6	214460	214465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_002578	TAT	2	6	217077	217082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_002578	AGAT	2	8	217117	217124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_002578	T	6	6	218257	218262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_002578	TTA	2	6	218268	218273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_002578	TC	3	6	219931	219936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_002578	ATGG	2	8	219952	219959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_002578	ACA	2	6	219973	219978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_002578	TTG	2	6	220028	220033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002578	CTT	2	6	220098	220103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_002578	TTTAAA	2	12	222027	222038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_002578	ATTT	2	8	222049	222056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_002578	CAT	3	9	227435	227443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_002578	TCT	2	6	227512	227517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_002578	ACC	2	6	227619	227624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_002578	AT	3	6	227625	227630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_002578	TTA	2	6	227636	227641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_002578	A	6	6	227708	227713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_002578	TCA	2	6	227846	227851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002578	GGA	2	6	227863	227868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_002578	TCA	2	6	227885	227890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_002578	TCTATC	2	12	227891	227902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_002578	TTA	2	6	228017	228022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002578	CAGC	2	8	229573	229580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_002578	GCCCT	2	10	229615	229624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
530	NC_002578	GT	3	6	229670	229675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002578	T	6	6	229746	229751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002578	AT	4	8	232189	232196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002578	CGG	2	6	232270	232275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002578	GAT	2	6	232320	232325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_002578	TGA	3	9	232347	232355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002578	CAG	2	6	232451	232456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_002578	CCA	2	6	232488	232493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_002578	ATTC	2	8	232572	232579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_002578	AT	4	8	235368	235375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_002578	ATAA	2	8	235406	235413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002578	TA	4	8	236616	236623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_002578	TTA	2	6	236626	236631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_002578	ATG	2	6	236636	236641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002578	TATC	2	8	237237	237244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_002578	AATA	2	8	237246	237253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_002578	GA	3	6	237276	237281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_002578	ACG	2	6	237359	237364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_002578	TTA	2	6	237456	237461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_002578	CTT	2	6	237488	237493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002578	GAT	2	6	237514	237519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002578	ATT	2	6	237581	237586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_002578	AT	3	6	237708	237713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_002578	AAT	2	6	237729	237734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002578	TGT	2	6	237764	237769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_002578	ATA	2	6	237773	237778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_002578	ATT	2	6	237821	237826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_002578	AAGA	2	8	237857	237864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_002578	AAG	2	6	237915	237920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_002578	AG	3	6	238054	238059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_002578	GAAAG	2	10	238166	238175	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
561	NC_002578	A	6	6	238211	238216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002578	TAA	2	6	238426	238431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002578	TGCTC	2	10	238441	238450	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
564	NC_002578	TTC	2	6	238455	238460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_002578	CGT	2	6	238592	238597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_002578	TTC	2	6	238646	238651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_002578	T	8	8	238697	238704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_002578	T	6	6	238756	238761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_002578	TAT	2	6	238778	238783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002578	ATAA	2	8	240942	240949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002578	GTG	2	6	240996	241001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002578	GGCCT	2	10	241023	241032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
573	NC_002578	AT	4	8	241157	241164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_002578	TGA	2	6	241234	241239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002578	TTCTC	2	10	241529	241538	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
576	NC_002578	GCAT	3	12	243666	243677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_002578	ATG	2	6	243717	243722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_002578	GATT	2	8	243792	243799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002578	TTTA	2	8	248111	248118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_002578	ATT	2	6	248130	248135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002578	TA	3	6	248143	248148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_002578	AT	3	6	248185	248190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_002578	GCG	2	6	250131	250136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_002578	CTGC	2	8	250157	250164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_002578	GAT	2	6	250169	250174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_002578	T	7	7	251739	251745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_002578	T	7	7	251758	251764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_002578	T	6	6	251835	251840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_002578	CGG	3	9	251846	251854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002578	ATA	2	6	252110	252115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_002578	TTAT	2	8	252562	252569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_002578	ATTT	2	8	252573	252580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_002578	GAT	2	6	253783	253788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_002578	GAT	2	6	253800	253805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002578	AGG	2	6	253808	253813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_002578	A	6	6	253820	253825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002578	T	6	6	255811	255816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_002578	GAA	2	6	255858	255863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002578	ATT	2	6	255882	255887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_002578	TTTA	2	8	257991	257998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_002578	ATA	2	6	258902	258907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_002578	TAA	2	6	258939	258944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002578	AT	4	8	259062	259069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_002578	A	6	6	259080	259085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002578	CAT	2	6	259086	259091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_002578	A	6	6	259096	259101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_002578	T	6	6	260601	260606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_002578	TAA	2	6	260620	260625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_002578	T	6	6	260634	260639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_002578	A	6	6	261180	261185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_002578	TAA	2	6	261188	261193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_002578	CAG	2	6	261212	261217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_002578	ATT	2	6	264190	264195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002578	T	6	6	264194	264199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002578	ATCCA	2	10	264302	264311	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
616	NC_002578	TCTT	2	8	264336	264343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_002578	CGAT	2	8	264363	264370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_002578	TA	3	6	264428	264433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002578	AAT	2	6	264446	264451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_002578	A	6	6	264460	264465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002578	TA	3	6	264513	264518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_002578	TGA	2	6	265086	265091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_002578	TGCA	2	8	266647	266654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_002578	AT	3	6	266664	266669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002578	A	6	6	266689	266694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002578	ATC	2	6	266704	266709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_002578	TA	3	6	269376	269381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_002578	CCA	2	6	269407	269412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_002578	TA	3	6	269443	269448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_002578	T	6	6	271745	271750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_002578	T	6	6	271791	271796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_002578	GAA	3	9	271803	271811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002578	AAT	2	6	271836	271841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_002578	GAAA	2	8	271848	271855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_002578	A	6	6	271853	271858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_002578	TGAT	2	8	272166	272173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_002578	AT	4	8	272172	272179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_002578	A	6	6	272235	272240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_002578	TTA	2	6	272277	272282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_002578	A	6	6	273371	273376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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