MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	AC	3	6	126	131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000853	CT	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_000853	TG	3	6	312	317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000853	AT	5	10	1652	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000853	GA	4	8	2056	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000853	TC	3	6	2939	2944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000853	TC	3	6	21405	21410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_000853	TG	3	6	32693	32698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000853	AG	3	6	34052	34057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000853	CT	3	6	34068	34073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000853	AT	3	6	47085	47090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000853	TA	3	6	47099	47104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000853	CA	3	6	58824	58829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000853	GT	3	6	60132	60137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000853	CA	3	6	97475	97480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_000853	CA	3	6	124809	124814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000853	AT	3	6	130029	130034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000853	TG	3	6	130075	130080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000853	TA	3	6	141769	141774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000853	CG	3	6	142802	142807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_000853	TC	3	6	153083	153088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000853	GA	3	6	157267	157272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000853	AT	3	6	157343	157348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000853	AT	3	6	157383	157388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000853	CA	3	6	157485	157490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_000853	TG	3	6	160126	160131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000853	GA	3	6	160227	160232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000853	GA	3	6	160830	160835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000853	TC	3	6	185651	185656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_000853	GT	3	6	189562	189567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000853	AC	3	6	190204	190209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000853	AC	3	6	190373	190378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_000853	CA	3	6	191761	191766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000853	GC	3	6	193653	193658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000853	GC	3	6	206151	206156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_000853	GC	3	6	206320	206325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000853	AT	3	6	208130	208135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000853	GA	3	6	210607	210612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000853	AT	3	6	215513	215518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000853	TC	4	8	239760	239767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_000853	AG	4	8	241543	241550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000853	AG	3	6	254005	254010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000853	GA	4	8	265279	265286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000853	CA	3	6	292079	292084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000853	CT	3	6	292706	292711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000853	AT	3	6	302684	302689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000853	TC	3	6	314065	314070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_000853	GT	3	6	315150	315155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000853	CT	3	6	341792	341797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000853	GA	3	6	343978	343983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000853	TG	3	6	344279	344284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000853	GT	3	6	348379	348384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000853	AT	3	6	368613	368618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000853	CT	3	6	369064	369069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000853	TG	3	6	369070	369075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000853	GT	3	6	369134	369139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000853	CT	3	6	369430	369435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000853	TC	3	6	369759	369764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000853	AT	3	6	378647	378652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000853	TA	5	10	388534	388543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000853	TA	3	6	392137	392142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000853	TG	3	6	396084	396089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000853	AC	3	6	396282	396287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_000853	CT	3	6	396462	396467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_000853	TG	3	6	396468	396473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000853	GT	3	6	396619	396624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000853	GA	3	6	397153	397158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000853	AT	3	6	402644	402649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000853	TA	3	6	410556	410561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000853	AC	3	6	411017	411022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_000853	GT	3	6	411204	411209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000853	TC	3	6	419117	419122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000853	AT	3	6	431073	431078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000853	GT	4	8	453772	453779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000853	GA	3	6	478347	478352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000853	GA	3	6	531856	531861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000853	TC	3	6	565905	565910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_000853	GA	3	6	593526	593531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000853	CT	3	6	593544	593549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_000853	CA	3	6	593804	593809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_000853	GT	4	8	600245	600252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000853	AG	3	6	630640	630645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000853	TC	3	6	632418	632423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000853	TC	3	6	632479	632484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000853	CT	3	6	632510	632515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_000853	TC	3	6	632563	632568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_000853	CT	3	6	632799	632804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_000853	AG	3	6	632834	632839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000853	AG	3	6	633007	633012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000853	CT	3	6	633086	633091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_000853	GA	3	6	643654	643659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000853	TC	3	6	645790	645795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_000853	AT	3	6	647655	647660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000853	TC	3	6	647784	647789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_000853	CT	3	6	647823	647828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_000853	TG	3	6	648057	648062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000853	TC	3	6	651958	651963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_000853	TG	3	6	653349	653354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000853	TC	3	6	654962	654967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_000853	TC	3	6	657774	657779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_000853	GA	4	8	669735	669742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000853	GT	3	6	679672	679677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000853	TC	3	6	702679	702684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_000853	GA	3	6	703229	703234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000853	AG	3	6	703470	703475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000853	CG	3	6	703489	703494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_000853	AC	3	6	707434	707439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_000853	AC	3	6	726175	726180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_000853	AT	3	6	779000	779005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000853	AT	3	6	784779	784784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000853	GA	3	6	788168	788173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000853	CA	3	6	809895	809900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_000853	TC	3	6	823850	823855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000853	GA	3	6	830342	830347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000853	GT	3	6	835062	835067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000853	GA	5	10	835086	835095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000853	CA	3	6	851880	851885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_000853	CT	3	6	866434	866439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_000853	CA	3	6	877073	877078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000853	TA	4	8	877145	877152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000853	GT	3	6	894970	894975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000853	CA	3	6	895438	895443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000853	AC	3	6	895900	895905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_000853	AC	3	6	896000	896005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000853	GA	3	6	896073	896078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000853	TC	3	6	905656	905661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000853	GT	3	6	905744	905749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000853	AC	3	6	934905	934910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000853	GA	3	6	978203	978208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000853	CA	3	6	988557	988562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000853	CA	3	6	990472	990477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_000853	CT	3	6	1006811	1006816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_000853	TC	3	6	1016663	1016668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000853	CT	3	6	1016733	1016738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_000853	TA	3	6	1018819	1018824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000853	AG	3	6	1021411	1021416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000853	TA	3	6	1021679	1021684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000853	CT	3	6	1024839	1024844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_000853	CT	3	6	1024916	1024921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_000853	AT	3	6	1034678	1034683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000853	AC	3	6	1043573	1043578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000853	AT	3	6	1045983	1045988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000853	AT	3	6	1060483	1060488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000853	CA	3	6	1060618	1060623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_000853	TG	3	6	1072929	1072934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000853	TG	3	6	1074373	1074378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000853	CA	3	6	1102236	1102241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000853	TC	3	6	1112055	1112060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_000853	GA	4	8	1112131	1112138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000853	GA	3	6	1112409	1112414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000853	GA	3	6	1135193	1135198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000853	AT	4	8	1138248	1138255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000853	TC	3	6	1143180	1143185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.