MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 2580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000853	GAG	2	6	342890	342895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_000853	CTTT	2	8	343949	343956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_000853	CAGA	2	8	343967	343974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_000853	GA	3	6	343978	343983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_000853	A	6	6	343988	343993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_000853	CGC	2	6	344026	344031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_000853	AGT	2	6	344123	344128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_000853	ATG	2	6	344186	344191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_000853	GAA	2	6	344209	344214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_000853	TG	3	6	344279	344284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_000853	AAC	2	6	344396	344401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_000853	CAA	2	6	344432	344437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_000853	AGG	2	6	344440	344445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_000853	GT	3	6	348379	348384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_000853	GCC	2	6	348431	348436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_000853	TTCCT	2	10	355106	355115	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
517	NC_000853	GAA	2	6	358046	358051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_000853	A	7	7	358081	358087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_000853	A	6	6	358109	358114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_000853	ACTT	2	8	358135	358142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_000853	TTC	2	6	358150	358155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_000853	CCA	2	6	358177	358182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_000853	TCT	2	6	358223	358228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_000853	CCT	2	6	358232	358237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_000853	ATC	3	9	358245	358253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_000853	TAA	2	6	358301	358306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_000853	ACC	2	6	358432	358437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_000853	CGG	2	6	358496	358501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_000853	T	7	7	358534	358540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_000853	AGG	2	6	358584	358589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_000853	GGA	2	6	359294	359299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_000853	TGT	2	6	359526	359531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_000853	T	7	7	359558	359564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_000853	CGG	2	6	359592	359597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_000853	GAG	2	6	359661	359666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_000853	GTT	2	6	360927	360932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_000853	GAA	2	6	360977	360982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_000853	ATT	3	9	361010	361018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_000853	T	7	7	361134	361140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_000853	AGG	2	6	361157	361162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_000853	TCC	2	6	368552	368557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_000853	AT	3	6	368613	368618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_000853	GAA	2	6	368704	368709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_000853	AAT	2	6	368788	368793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_000853	CTT	2	6	368900	368905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_000853	TCT	2	6	368987	368992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_000853	T	6	6	368994	368999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_000853	TTG	2	6	369015	369020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_000853	ATT	2	6	369030	369035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_000853	CT	3	6	369064	369069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_000853	TG	3	6	369070	369075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_000853	A	6	6	369113	369118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_000853	GT	3	6	369134	369139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_000853	AAT	2	6	369175	369180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_000853	TCA	2	6	369218	369223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_000853	AAT	2	6	369242	369247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_000853	AAT	2	6	369309	369314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_000853	CGA	2	6	369354	369359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_000853	AAT	2	6	369375	369380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_000853	CT	3	6	369430	369435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_000853	AAT	2	6	369442	369447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_000853	GTAG	2	8	369499	369506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_000853	AAT	2	6	369511	369516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_000853	AAT	2	6	369578	369583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_000853	AAT	2	6	369645	369650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_000853	TC	3	6	369759	369764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_000853	A	7	7	369784	369790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_000853	TGTT	2	8	369809	369816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_000853	ACC	2	6	374016	374021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_000853	CCT	2	6	375020	375025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_000853	CTT	2	6	375058	375063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_000853	A	6	6	375068	375073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_000853	CTT	2	6	375107	375112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_000853	CCT	2	6	378610	378615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_000853	AT	3	6	378647	378652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_000853	TGA	2	6	378679	378684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_000853	GAT	3	9	378746	378754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_000853	AAG	2	6	379507	379512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_000853	GGT	2	6	384706	384711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_000853	GTT	2	6	386025	386030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_000853	AAT	2	6	386085	386090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_000853	T	6	6	388475	388480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_000853	AAC	2	6	388484	388489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_000853	TA	5	10	388534	388543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_000853	TCCC	2	8	392040	392047	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
589	NC_000853	TTA	2	6	392086	392091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_000853	A	6	6	392130	392135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_000853	TA	3	6	392137	392142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_000853	ATGT	2	8	392168	392175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_000853	AGG	2	6	392255	392260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_000853	G	7	7	394061	394067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
596	NC_000853	T	6	6	394537	394542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_000853	TTTC	2	8	395194	395201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_000853	A	6	6	395956	395961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_000853	CTTTG	2	10	395988	395997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_000853	ATGTT	2	10	396027	396036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
601	NC_000853	TG	3	6	396084	396089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_000853	AAT	2	6	396186	396191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_000853	GAT	2	6	396193	396198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_000853	AC	3	6	396282	396287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_000853	CTT	2	6	396298	396303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_000853	TCT	2	6	396385	396390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_000853	T	6	6	396392	396397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_000853	TTCTT	2	10	396405	396414	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_000853	ATT	2	6	396428	396433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_000853	CT	3	6	396462	396467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_000853	TG	3	6	396468	396473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_000853	GGT	2	6	396615	396620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_000853	GT	3	6	396619	396624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_000853	AAT	2	6	396639	396644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_000853	AGG	2	6	396671	396676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_000853	AAT	2	6	396704	396709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_000853	AAT	2	6	396771	396776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_000853	AAT	2	6	396838	396843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_000853	CTA	2	6	396874	396879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_000853	GA	3	6	397153	397158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_000853	T	6	6	397195	397200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_000853	GAG	2	6	397229	397234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_000853	AGT	2	6	398259	398264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_000853	GAAA	2	8	399679	399686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_000853	AGC	2	6	399705	399710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_000853	ATC	2	6	399719	399724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_000853	AGA	3	9	399894	399902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_000853	CCCT	2	8	400012	400019	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
629	NC_000853	AGG	2	6	400037	400042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_000853	AACA	2	8	402577	402584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_000853	CCA	2	6	402605	402610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_000853	T	6	6	402615	402620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_000853	AAAC	2	8	402632	402639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_000853	AT	3	6	402644	402649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_000853	CAG	2	6	402663	402668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_000853	T	6	6	405190	405195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_000853	ATT	3	9	405204	405212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_000853	T	6	6	405229	405234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_000853	A	6	6	409211	409216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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