MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	512443504
2	NC_021508	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	512443505
3	NC_021508	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	512443508
4	NC_021508	ATCGG	2	10	7147	7156	20 %	20 %	40 %	20 %	512443509
5	NC_021508	GAAAG	2	10	11080	11089	60 %	0 %	40 %	0 %	512443510
6	NC_021508	CTGTG	2	10	11271	11280	0 %	40 %	40 %	20 %	512443510
7	NC_021508	CTGCG	2	10	15898	15907	0 %	20 %	40 %	40 %	512443513
8	NC_021508	TTGCG	2	10	19717	19726	0 %	40 %	40 %	20 %	512443515
9	NC_021508	GTTTT	2	10	20296	20305	0 %	80 %	20 %	0 %	512443515
10	NC_021508	TGCGA	2	10	22060	22069	20 %	20 %	40 %	20 %	512443516
11	NC_021508	TACCG	2	10	22200	22209	20 %	20 %	20 %	40 %	512443516
12	NC_021508	GCCAC	2	10	22295	22304	20 %	0 %	20 %	60 %	512443516
13	NC_021508	AAGGG	2	10	22897	22906	40 %	0 %	60 %	0 %	512443516
14	NC_021508	CGGTG	2	10	23464	23473	0 %	20 %	60 %	20 %	512443516
15	NC_021508	GTATC	2	10	26074	26083	20 %	40 %	20 %	20 %	512443518
16	NC_021508	GGTGG	2	10	26981	26990	0 %	20 %	80 %	0 %	512443518
17	NC_021508	TATTT	2	10	27707	27716	20 %	80 %	0 %	0 %	512443519
18	NC_021508	CTGCG	2	10	27773	27782	0 %	20 %	40 %	40 %	512443519
19	NC_021508	TGCGC	2	10	29961	29970	0 %	20 %	40 %	40 %	512443521
20	NC_021508	TCCAG	2	10	30787	30796	20 %	20 %	20 %	40 %	512443521
21	NC_021508	TGGGG	2	10	31345	31354	0 %	20 %	80 %	0 %	512443521
22	NC_021508	AAGAT	2	10	33651	33660	60 %	20 %	20 %	0 %	512443522
23	NC_021508	AAAGT	2	10	36209	36218	60 %	20 %	20 %	0 %	512443524
24	NC_021508	GTTGT	2	10	36309	36318	0 %	60 %	40 %	0 %	512443524
25	NC_021508	GATGT	2	10	37372	37381	20 %	40 %	40 %	0 %	512443525
26	NC_021508	TGCAT	2	10	38012	38021	20 %	40 %	20 %	20 %	512443525
27	NC_021508	GGTCA	2	10	39199	39208	20 %	20 %	40 %	20 %	512443526
28	NC_021508	CGGGT	2	10	39309	39318	0 %	20 %	60 %	20 %	512443526
29	NC_021508	TTTTC	2	10	40335	40344	0 %	80 %	0 %	20 %	512443528
30	NC_021508	TGCTG	2	10	43276	43285	0 %	40 %	40 %	20 %	512443531
31	NC_021508	ACGTA	2	10	43477	43486	40 %	20 %	20 %	20 %	512443531
32	NC_021508	CGTCG	2	10	44169	44178	0 %	20 %	40 %	40 %	512443532
33	NC_021508	TTTTG	2	10	46794	46803	0 %	80 %	20 %	0 %	512443535
34	NC_021508	TGTTT	2	10	47641	47650	0 %	80 %	20 %	0 %	512443536
35	NC_021508	AGTTG	2	10	49265	49274	20 %	40 %	40 %	0 %	512443536
36	NC_021508	GCGCA	2	10	49576	49585	20 %	0 %	40 %	40 %	512443537
37	NC_021508	GCGCA	2	10	50736	50745	20 %	0 %	40 %	40 %	512443538
38	NC_021508	TGCAG	2	10	52867	52876	20 %	20 %	40 %	20 %	512443539
39	NC_021508	CGCTG	2	10	53791	53800	0 %	20 %	40 %	40 %	512443539
40	NC_021508	GCTAC	2	10	54155	54164	20 %	20 %	20 %	40 %	512443539
41	NC_021508	TCGCT	2	10	54192	54201	0 %	40 %	20 %	40 %	512443539
42	NC_021508	CTGCA	2	10	56886	56895	20 %	20 %	20 %	40 %	512443542
43	NC_021508	GCAGG	2	10	58860	58869	20 %	0 %	60 %	20 %	512443545
44	NC_021508	CTGCA	2	10	59840	59849	20 %	20 %	20 %	40 %	512443546
45	NC_021508	TCAAA	2	10	60363	60372	60 %	20 %	0 %	20 %	512443546
46	NC_021508	GCCAC	2	10	63807	63816	20 %	0 %	20 %	60 %	512443549
47	NC_021508	TGCCT	2	10	65580	65589	0 %	40 %	20 %	40 %	512443551
48	NC_021508	TGAAG	2	10	66057	66066	40 %	20 %	40 %	0 %	512443551
49	NC_021508	TGGGG	2	10	66659	66668	0 %	20 %	80 %	0 %	512443552
50	NC_021508	CGTTG	2	10	67714	67723	0 %	40 %	40 %	20 %	512443553
51	NC_021508	TGAGT	2	10	67735	67744	20 %	40 %	40 %	0 %	512443553
52	NC_021508	CACGG	2	10	68033	68042	20 %	0 %	40 %	40 %	512443553
53	NC_021508	CAGAG	2	10	68852	68861	40 %	0 %	40 %	20 %	512443553
54	NC_021508	CGCTT	2	10	69197	69206	0 %	40 %	20 %	40 %	512443555
55	NC_021508	GAAAA	2	10	76669	76678	80 %	0 %	20 %	0 %	512443565
56	NC_021508	AATAA	2	10	77723	77732	80 %	20 %	0 %	0 %	512443565
57	NC_021508	GCGCC	2	10	79358	79367	0 %	0 %	40 %	60 %	512443567
58	NC_021508	CGTGT	2	10	81014	81023	0 %	40 %	40 %	20 %	512443568
59	NC_021508	ATGCA	2	10	83679	83688	40 %	20 %	20 %	20 %	512443570
60	NC_021508	GCACC	2	10	86619	86628	20 %	0 %	20 %	60 %	512443572
61	NC_021508	CGCAC	2	10	87080	87089	20 %	0 %	20 %	60 %	512443572
62	NC_021508	GTACC	2	10	88956	88965	20 %	20 %	20 %	40 %	512443573
63	NC_021508	CGTGT	2	10	92284	92293	0 %	40 %	40 %	20 %	512443576
64	NC_021508	GGTAT	2	10	92298	92307	20 %	40 %	40 %	0 %	512443576
65	NC_021508	CGTAT	2	10	96113	96122	20 %	40 %	20 %	20 %	512443580
66	NC_021508	CGTAC	2	10	96404	96413	20 %	20 %	20 %	40 %	512443581
67	NC_021508	CCCGT	2	10	96571	96580	0 %	20 %	20 %	60 %	512443581
68	NC_021508	AAGGA	2	10	98356	98365	60 %	0 %	40 %	0 %	512443583
69	NC_021508	ACTGC	2	10	100331	100340	20 %	20 %	20 %	40 %	512443585
70	NC_021508	TCCTC	2	10	102364	102373	0 %	40 %	0 %	60 %	512443587
71	NC_021508	CTGCT	2	10	103460	103469	0 %	40 %	20 %	40 %	512443588
72	NC_021508	CTACT	2	10	103523	103532	20 %	40 %	0 %	40 %	512443588
73	NC_021508	GCGGT	2	10	104031	104040	0 %	20 %	60 %	20 %	512443589
74	NC_021508	GTGCT	2	10	105713	105722	0 %	40 %	40 %	20 %	512443589
75	NC_021508	GCGTC	2	10	107121	107130	0 %	20 %	40 %	40 %	512443592
76	NC_021508	ACCTG	2	10	107736	107745	20 %	20 %	20 %	40 %	512443593
77	NC_021508	GAACG	2	10	108052	108061	40 %	0 %	40 %	20 %	512443593
78	NC_021508	GTTCC	2	10	108381	108390	0 %	40 %	20 %	40 %	512443594
79	NC_021508	CCTCG	2	10	110527	110536	0 %	20 %	20 %	60 %	512443596
80	NC_021508	CTGCG	2	10	112601	112610	0 %	20 %	40 %	40 %	512443597
81	NC_021508	TTCGT	2	10	112683	112692	0 %	60 %	20 %	20 %	512443597
82	NC_021508	GGACG	2	10	113200	113209	20 %	0 %	60 %	20 %	512443597
83	NC_021508	GATGT	2	10	113381	113390	20 %	40 %	40 %	0 %	512443597
84	NC_021508	GATTT	2	10	114212	114221	20 %	60 %	20 %	0 %	512443598
85	NC_021508	TCAGA	2	10	117439	117448	40 %	20 %	20 %	20 %	512443599
86	NC_021508	GCAGA	2	10	118439	118448	40 %	0 %	40 %	20 %	512443599
87	NC_021508	ACAGA	2	10	119794	119803	60 %	0 %	20 %	20 %	512443600
88	NC_021508	GGGAG	2	10	120000	120009	20 %	0 %	80 %	0 %	512443600
89	NC_021508	GTGCG	2	10	120131	120140	0 %	20 %	60 %	20 %	512443600
90	NC_021508	AGGAA	2	10	120288	120297	60 %	0 %	40 %	0 %	512443600
91	NC_021508	TACTG	2	10	120825	120834	20 %	40 %	20 %	20 %	512443601
92	NC_021508	CGTCA	2	10	121738	121747	20 %	20 %	20 %	40 %	512443601
93	NC_021508	TCTTT	2	10	122593	122602	0 %	80 %	0 %	20 %	512443602
94	NC_021508	CGCAG	2	10	124397	124406	20 %	0 %	40 %	40 %	512443603
95	NC_021508	AGCAC	2	10	124433	124442	40 %	0 %	20 %	40 %	512443603
96	NC_021508	CATTG	2	10	126727	126736	20 %	40 %	20 %	20 %	512443604
97	NC_021508	CCGTG	2	10	127088	127097	0 %	20 %	40 %	40 %	512443605
98	NC_021508	AACCA	2	10	128812	128821	60 %	0 %	0 %	40 %	512443606
99	NC_021508	AAAAG	2	10	129463	129472	80 %	0 %	20 %	0 %	512443606
100	NC_021508	TTATC	2	10	130078	130087	20 %	60 %	0 %	20 %	512443607
101	NC_021508	CGCGC	2	10	132213	132222	0 %	0 %	40 %	60 %	512443609
102	NC_021508	TATCG	2	10	133500	133509	20 %	40 %	20 %	20 %	512443610
103	NC_021508	GCGAT	2	10	134536	134545	20 %	20 %	40 %	20 %	512443610
104	NC_021508	TGTTT	2	10	135958	135967	0 %	80 %	20 %	0 %	512443611
105	NC_021508	GTCTT	2	10	137144	137153	0 %	60 %	20 %	20 %	512443612
106	NC_021508	ACCAA	2	10	142270	142279	60 %	0 %	0 %	40 %	512443616
107	NC_021508	AGCCA	2	10	142742	142751	40 %	0 %	20 %	40 %	512443616
108	NC_021508	GCAGC	2	10	145456	145465	20 %	0 %	40 %	40 %	512443617
109	NC_021508	GGATC	2	10	147517	147526	20 %	20 %	40 %	20 %	512443619
110	NC_021508	CTTGC	2	10	148905	148914	0 %	40 %	20 %	40 %	512443621
111	NC_021508	GTTTG	2	10	150975	150984	0 %	60 %	40 %	0 %	512443624
112	NC_021508	TGCGC	2	10	153137	153146	0 %	20 %	40 %	40 %	512443627
113	NC_021508	TGTTT	2	10	153411	153420	0 %	80 %	20 %	0 %	512443627
114	NC_021508	GGTCT	2	10	154486	154495	0 %	40 %	40 %	20 %	512443628
115	NC_021508	GGTCT	2	10	155715	155724	0 %	40 %	40 %	20 %	512443629
116	NC_021508	CGGGG	2	10	157089	157098	0 %	0 %	80 %	20 %	512443630
117	NC_021508	AACGG	2	10	159352	159361	40 %	0 %	40 %	20 %	512443631
118	NC_021508	TGCCT	2	10	164156	164165	0 %	40 %	20 %	40 %	512443636
119	NC_021508	AGAGG	2	10	166244	166253	40 %	0 %	60 %	0 %	512443638
120	NC_021508	GCAGC	2	10	166948	166957	20 %	0 %	40 %	40 %	512443638
121	NC_021508	TGAAG	2	10	168444	168453	40 %	20 %	40 %	0 %	512443639
122	NC_021508	CGGTA	2	10	171794	171803	20 %	20 %	40 %	20 %	512443640
123	NC_021508	ATTCC	2	10	171897	171906	20 %	40 %	0 %	40 %	512443640
124	NC_021508	ATAAG	2	10	172115	172124	60 %	20 %	20 %	0 %	512443640
125	NC_021508	ACGCA	2	10	172704	172713	40 %	0 %	20 %	40 %	512443641
126	NC_021508	CGTGA	2	10	173770	173779	20 %	20 %	40 %	20 %	512443643
127	NC_021508	CTTGC	2	10	173795	173804	0 %	40 %	20 %	40 %	512443643
128	NC_021508	CTTTT	2	10	173835	173844	0 %	80 %	0 %	20 %	512443643
129	NC_021508	CTTCT	2	10	175917	175926	0 %	60 %	0 %	40 %	512443645
130	NC_021508	GTGCT	2	10	176061	176070	0 %	40 %	40 %	20 %	512443645
131	NC_021508	GCGCG	2	10	176227	176236	0 %	0 %	60 %	40 %	512443645
132	NC_021508	GAACG	2	10	176315	176324	40 %	0 %	40 %	20 %	512443645
133	NC_021508	CAGTG	2	10	179201	179210	20 %	20 %	40 %	20 %	512443648
134	NC_021508	TGTGG	2	10	181009	181018	0 %	40 %	60 %	0 %	512443651
135	NC_021508	CGCTG	2	10	181518	181527	0 %	20 %	40 %	40 %	512443652
136	NC_021508	GGTGA	2	10	182226	182235	20 %	20 %	60 %	0 %	512443652
137	NC_021508	GTTTT	2	10	185510	185519	0 %	80 %	20 %	0 %	512443654
138	NC_021508	CGCAG	2	10	187130	187139	20 %	0 %	40 %	40 %	512443656
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140	NC_021508	CATTG	2	10	189166	189175	20 %	40 %	20 %	20 %	512443658
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142	NC_021508	TGCTT	2	10	192473	192482	0 %	60 %	20 %	20 %	512443662
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149	NC_021508	CTGTG	2	10	201194	201203	0 %	40 %	40 %	20 %	512443670
150	NC_021508	ATCCG	2	10	201938	201947	20 %	20 %	20 %	40 %	512443671
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169	NC_021508	AGAAA	2	10	236722	236731	80 %	0 %	20 %	0 %	512443712
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234	NC_021508	TGGGG	2	10	346847	346856	0 %	20 %	80 %	0 %	512443799
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245	NC_021508	TGACG	2	10	362085	362094	20 %	20 %	40 %	20 %	512443810
246	NC_021508	TGCAG	2	10	362238	362247	20 %	20 %	40 %	20 %	512443811
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248	NC_021508	CTTTT	2	10	363996	364005	0 %	80 %	0 %	20 %	512443812
249	NC_021508	TTATT	2	10	365364	365373	20 %	80 %	0 %	0 %	512443813
250	NC_021508	TGGAT	2	10	367067	367076	20 %	40 %	40 %	0 %	512443815
251	NC_021508	CGCAC	2	10	367886	367895	20 %	0 %	20 %	60 %	512443816
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253	NC_021508	GCGGT	2	10	374559	374568	0 %	20 %	60 %	20 %	512443819
254	NC_021508	GATCC	2	10	377944	377953	20 %	20 %	20 %	40 %	512443822
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256	NC_021508	CGCTG	2	10	383217	383226	0 %	20 %	40 %	40 %	512443830
257	NC_021508	GCCGT	2	10	384377	384386	0 %	20 %	40 %	40 %	512443832
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259	NC_021508	CAGTG	2	10	388887	388896	20 %	20 %	40 %	20 %	512443835
260	NC_021508	TGCGG	2	10	389113	389122	0 %	20 %	60 %	20 %	512443835
261	NC_021508	CTGAA	2	10	391745	391754	40 %	20 %	20 %	20 %	512443838
262	NC_021508	ACGTG	2	10	392016	392025	20 %	20 %	40 %	20 %	512443838
263	NC_021508	GCGCC	2	10	394076	394085	0 %	0 %	40 %	60 %	512443840
264	NC_021508	CCAAA	2	10	394407	394416	60 %	0 %	0 %	40 %	512443840
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381	NC_021508	AACAT	2	10	554623	554632	60 %	20 %	0 %	20 %	512443977
382	NC_021508	CTTAC	2	10	555203	555212	20 %	40 %	0 %	40 %	512443978
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390	NC_021508	GCACG	2	10	571500	571509	20 %	0 %	40 %	40 %	512443988
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499	NC_021508	CTTTC	2	10	742053	742062	0 %	60 %	0 %	40 %	512444127
500	NC_021508	GCAGC	2	10	743049	743058	20 %	0 %	40 %	40 %	512444128

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