MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021508	AGG	2	6	192546	192551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443662
3502	NC_021508	TGC	2	6	192557	192562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443662
3503	NC_021508	GCGCG	2	10	192576	192585	0 %	0 %	60 %	40 %	512443662
3504	NC_021508	GAAG	2	8	192590	192597	50 %	0 %	50 %	0 %	512443662
3505	NC_021508	ATT	2	6	192600	192605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443662
3506	NC_021508	TGG	2	6	192665	192670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443663
3507	NC_021508	G	6	6	192669	192674	0 %	0 %	100 %	0 %	512443663
3508	NC_021508	GAT	2	6	192685	192690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443663
3509	NC_021508	TCT	2	6	192704	192709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443663
3510	NC_021508	CCT	2	6	192735	192740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443663
3511	NC_021508	TAGT	2	8	192759	192766	25 %	50 %	25 %	0 %	512443663
3512	NC_021508	AGC	2	6	192894	192899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443663
3513	NC_021508	GAA	2	6	192937	192942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443663
3514	NC_021508	TCC	2	6	193067	193072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443663
3515	NC_021508	T	7	7	193127	193133	0 %	100 %	0 %	0 %	512443663
3516	NC_021508	AGC	2	6	193145	193150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443663
3517	NC_021508	GGAAGA	2	12	193174	193185	50 %	0 %	50 %	0 %	512443663
3518	NC_021508	C	7	7	193197	193203	0 %	0 %	0 %	100 %	512443663
3519	NC_021508	A	6	6	193236	193241	100 %	0 %	0 %	0 %	512443663
3520	NC_021508	CTC	2	6	193243	193248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443663
3521	NC_021508	GACACT	2	12	193335	193346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512443663
3522	NC_021508	GC	3	6	193390	193395	0 %	0 %	50 %	50 %	512443663
3523	NC_021508	CAG	2	6	193410	193415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443663
3524	NC_021508	GC	3	6	193423	193428	0 %	0 %	50 %	50 %	512443663
3525	NC_021508	GGTGAG	2	12	193498	193509	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512443663
3526	NC_021508	A	6	6	193537	193542	100 %	0 %	0 %	0 %	512443663
3527	NC_021508	GAGT	2	8	193554	193561	25 %	25 %	50 %	0 %	512443663
3528	NC_021508	ACA	2	6	193581	193586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443663
3529	NC_021508	AG	3	6	193640	193645	50 %	0 %	50 %	0 %	512443663
3530	NC_021508	CCA	2	6	193673	193678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443663
3531	NC_021508	GTC	2	6	193693	193698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443663
3532	NC_021508	AAC	2	6	193712	193717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443663
3533	NC_021508	A	6	6	193731	193736	100 %	0 %	0 %	0 %	512443663
3534	NC_021508	TCA	2	6	193757	193762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443663
3535	NC_021508	CG	3	6	193824	193829	0 %	0 %	50 %	50 %	512443663
3536	NC_021508	GCT	2	6	193860	193865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443663
3537	NC_021508	GC	3	6	193961	193966	0 %	0 %	50 %	50 %	512443663
3538	NC_021508	TCC	2	6	194007	194012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443663
3539	NC_021508	TTTGT	2	10	194058	194067	0 %	80 %	20 %	0 %	512443664
3540	NC_021508	GAG	2	6	194093	194098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443664
3541	NC_021508	A	6	6	194133	194138	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
3542	NC_021508	TAA	2	6	194140	194145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443664
3543	NC_021508	TTGT	2	8	194147	194154	0 %	75 %	25 %	0 %	512443664
3544	NC_021508	CTG	2	6	194173	194178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443664
3545	NC_021508	TCC	2	6	194258	194263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443664
3546	NC_021508	TG	3	6	194265	194270	0 %	50 %	50 %	0 %	512443664
3547	NC_021508	GCG	2	6	194323	194328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443664
3548	NC_021508	GGC	2	6	194462	194467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443664
3549	NC_021508	GCCA	2	8	194468	194475	25 %	0 %	25 %	50 %	512443664
3550	NC_021508	A	6	6	194496	194501	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
3551	NC_021508	GAA	2	6	194508	194513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443664
3552	NC_021508	CCT	2	6	194544	194549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443664
3553	NC_021508	GT	3	6	194655	194660	0 %	50 %	50 %	0 %	512443664
3554	NC_021508	A	7	7	194693	194699	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
3555	NC_021508	AC	3	6	194723	194728	50 %	0 %	0 %	50 %	512443664
3556	NC_021508	T	6	6	194782	194787	0 %	100 %	0 %	0 %	512443664
3557	NC_021508	A	6	6	195005	195010	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
3558	NC_021508	A	7	7	195038	195044	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
3559	NC_021508	GAT	2	6	195053	195058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443664
3560	NC_021508	GAA	2	6	195112	195117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443664
3561	NC_021508	ATA	2	6	195138	195143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443664
3562	NC_021508	GCA	2	6	195206	195211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443664
3563	NC_021508	A	6	6	195268	195273	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
3564	NC_021508	GCAG	2	8	195291	195298	25 %	0 %	50 %	25 %	512443664
3565	NC_021508	TTCT	2	8	195301	195308	0 %	75 %	0 %	25 %	512443664
3566	NC_021508	GAGTG	2	10	195333	195342	20 %	20 %	60 %	0 %	512443664
3567	NC_021508	AAG	2	6	195357	195362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443664
3568	NC_021508	TG	4	8	195377	195384	0 %	50 %	50 %	0 %	512443664
3569	NC_021508	T	8	8	195474	195481	0 %	100 %	0 %	0 %	512443664
3570	NC_021508	ATTA	2	8	196648	196655	50 %	50 %	0 %	0 %	512443665
3571	NC_021508	AGAA	2	8	196656	196663	75 %	0 %	25 %	0 %	512443665
3572	NC_021508	GGA	2	6	196934	196939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443666
3573	NC_021508	CGTC	2	8	196940	196947	0 %	25 %	25 %	50 %	512443666
3574	NC_021508	GC	3	6	196949	196954	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
3575	NC_021508	AGT	2	6	196956	196961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443666
3576	NC_021508	TGA	2	6	196973	196978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443666
3577	NC_021508	GAA	2	6	197065	197070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443666
3578	NC_021508	CAG	2	6	197158	197163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443666
3579	NC_021508	GAA	2	6	197189	197194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443666
3580	NC_021508	CGG	2	6	197195	197200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443666
3581	NC_021508	G	6	6	197199	197204	0 %	0 %	100 %	0 %	512443666
3582	NC_021508	AGC	2	6	197279	197284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443666
3583	NC_021508	GC	3	6	197343	197348	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
3584	NC_021508	ACGC	2	8	197370	197377	25 %	0 %	25 %	50 %	512443666
3585	NC_021508	CTC	2	6	197379	197384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443666
3586	NC_021508	CCTG	2	8	197558	197565	0 %	25 %	25 %	50 %	512443666
3587	NC_021508	GTC	2	6	197572	197577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443666
3588	NC_021508	GCAG	2	8	197587	197594	25 %	0 %	50 %	25 %	512443666
3589	NC_021508	AGG	2	6	197605	197610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443666
3590	NC_021508	GTG	3	9	197638	197646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443666
3591	NC_021508	GAGAAA	2	12	197691	197702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443666
3592	NC_021508	CG	3	6	197706	197711	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
3593	NC_021508	GA	3	6	197721	197726	50 %	0 %	50 %	0 %	512443666
3594	NC_021508	GTA	2	6	197760	197765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443666
3595	NC_021508	GC	4	8	197803	197810	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
3596	NC_021508	CTC	2	6	197885	197890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443667
3597	NC_021508	TCT	2	6	197893	197898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443667
3598	NC_021508	AGC	2	6	197916	197921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3599	NC_021508	TCG	2	6	197952	197957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3600	NC_021508	GTC	4	12	198182	198193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3601	NC_021508	GCT	2	6	198217	198222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3602	NC_021508	GGA	2	6	198248	198253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443667
3603	NC_021508	CG	3	6	198412	198417	0 %	0 %	50 %	50 %	512443667
3604	NC_021508	GTC	2	6	198428	198433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3605	NC_021508	CAC	2	6	198499	198504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443667
3606	NC_021508	TGA	2	6	198556	198561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443667
3607	NC_021508	TCGTC	2	10	198595	198604	0 %	40 %	20 %	40 %	512443667
3608	NC_021508	ATC	2	6	198608	198613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443667
3609	NC_021508	TTCC	2	8	198646	198653	0 %	50 %	0 %	50 %	512443667
3610	NC_021508	CTG	2	6	198744	198749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3611	NC_021508	GAA	2	6	198900	198905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443667
3612	NC_021508	CGT	2	6	198958	198963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3613	NC_021508	GTC	2	6	198983	198988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3614	NC_021508	GTG	2	6	198996	199001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443667
3615	NC_021508	TGC	2	6	199027	199032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3616	NC_021508	CG	3	6	199036	199041	0 %	0 %	50 %	50 %	512443667
3617	NC_021508	GGC	2	6	199047	199052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443667
3618	NC_021508	GTC	2	6	199097	199102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3619	NC_021508	TCG	2	6	199131	199136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
3620	NC_021508	ACG	2	6	199138	199143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443667
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3622	NC_021508	GGA	3	9	199193	199201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443667
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3624	NC_021508	TCC	2	6	199245	199250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443667
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3629	NC_021508	CTG	2	6	199510	199515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
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3661	NC_021508	GC	3	6	201351	201356	0 %	0 %	50 %	50 %	512443670
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3876	NC_021508	TACGC	2	10	212273	212282	20 %	20 %	20 %	40 %	512443689
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3994	NC_021508	AAG	2	6	218876	218881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443701
3995	NC_021508	GC	3	6	218902	218907	0 %	0 %	50 %	50 %	512443701
3996	NC_021508	GCG	3	9	219166	219174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443702
3997	NC_021508	CG	3	6	219237	219242	0 %	0 %	50 %	50 %	512443702
3998	NC_021508	GCGT	2	8	219401	219408	0 %	25 %	50 %	25 %	512443702
3999	NC_021508	AGG	2	6	219421	219426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443702
4000	NC_021508	GCT	2	6	219449	219454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443702

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