MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021508	CGTC	2	8	166907	166914	0 %	25 %	25 %	50 %	512443638
3002	NC_021508	CAG	3	9	166927	166935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443638
3003	NC_021508	GCAGC	2	10	166948	166957	20 %	0 %	40 %	40 %	512443638
3004	NC_021508	AGA	2	6	166958	166963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443638
3005	NC_021508	GT	4	8	167099	167106	0 %	50 %	50 %	0 %	512443639
3006	NC_021508	TCC	2	6	167113	167118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443639
3007	NC_021508	CTGC	2	8	167188	167195	0 %	25 %	25 %	50 %	512443639
3008	NC_021508	CTT	2	6	167234	167239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443639
3009	NC_021508	GTG	2	6	167303	167308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443639
3010	NC_021508	GCA	2	6	167380	167385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443639
3011	NC_021508	GCAC	2	8	167449	167456	25 %	0 %	25 %	50 %	512443639
3012	NC_021508	A	6	6	167485	167490	100 %	0 %	0 %	0 %	512443639
3013	NC_021508	CG	3	6	167493	167498	0 %	0 %	50 %	50 %	512443639
3014	NC_021508	GTT	2	6	167535	167540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443639
3015	NC_021508	GCGG	2	8	167545	167552	0 %	0 %	75 %	25 %	512443639
3016	NC_021508	T	6	6	167616	167621	0 %	100 %	0 %	0 %	512443639
3017	NC_021508	CAGG	2	8	167672	167679	25 %	0 %	50 %	25 %	512443639
3018	NC_021508	CG	4	8	167705	167712	0 %	0 %	50 %	50 %	512443639
3019	NC_021508	CTA	2	6	167720	167725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443639
3020	NC_021508	GTG	2	6	167764	167769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443639
3021	NC_021508	GT	3	6	167824	167829	0 %	50 %	50 %	0 %	512443639
3022	NC_021508	TG	3	6	167859	167864	0 %	50 %	50 %	0 %	512443639
3023	NC_021508	TGC	2	6	168057	168062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443639
3024	NC_021508	GCA	2	6	168085	168090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443639
3025	NC_021508	CGT	2	6	168148	168153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443639
3026	NC_021508	CGC	2	6	168167	168172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443639
3027	NC_021508	TG	3	6	168181	168186	0 %	50 %	50 %	0 %	512443639
3028	NC_021508	GAA	2	6	168249	168254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443639
3029	NC_021508	CCT	2	6	168263	168268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443639
3030	NC_021508	G	8	8	168286	168293	0 %	0 %	100 %	0 %	512443639
3031	NC_021508	TCC	2	6	168300	168305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443639
3032	NC_021508	TGAAG	2	10	168444	168453	40 %	20 %	40 %	0 %	512443639
3033	NC_021508	GGTT	2	8	168580	168587	0 %	50 %	50 %	0 %	512443639
3034	NC_021508	GTGG	2	8	168616	168623	0 %	25 %	75 %	0 %	512443639
3035	NC_021508	AAG	2	6	168646	168651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443639
3036	NC_021508	TGC	2	6	168662	168667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443639
3037	NC_021508	GTG	2	6	168668	168673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443639
3038	NC_021508	GA	3	6	168674	168679	50 %	0 %	50 %	0 %	512443639
3039	NC_021508	GGC	2	6	168768	168773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443639
3040	NC_021508	GAA	2	6	168844	168849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443639
3041	NC_021508	GTG	2	6	168868	168873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443639
3042	NC_021508	AGG	2	6	169001	169006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443639
3043	NC_021508	TGC	2	6	170719	170724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3044	NC_021508	A	6	6	170745	170750	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3045	NC_021508	TCA	2	6	170771	170776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443640
3046	NC_021508	A	6	6	170809	170814	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3047	NC_021508	T	6	6	170840	170845	0 %	100 %	0 %	0 %	512443640
3048	NC_021508	A	6	6	170878	170883	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3049	NC_021508	T	7	7	170890	170896	0 %	100 %	0 %	0 %	512443640
3050	NC_021508	TTC	2	6	170917	170922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443640
3051	NC_021508	AG	3	6	171055	171060	50 %	0 %	50 %	0 %	512443640
3052	NC_021508	CTG	2	6	171099	171104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3053	NC_021508	A	6	6	171123	171128	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3054	NC_021508	TCA	2	6	171174	171179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443640
3055	NC_021508	GA	4	8	171189	171196	50 %	0 %	50 %	0 %	512443640
3056	NC_021508	GA	3	6	171235	171240	50 %	0 %	50 %	0 %	512443640
3057	NC_021508	ATT	2	6	171241	171246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443640
3058	NC_021508	AC	3	6	171249	171254	50 %	0 %	0 %	50 %	512443640
3059	NC_021508	GTGC	2	8	171260	171267	0 %	25 %	50 %	25 %	512443640
3060	NC_021508	AGG	2	6	171284	171289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443640
3061	NC_021508	GC	3	6	171309	171314	0 %	0 %	50 %	50 %	512443640
3062	NC_021508	AGA	2	6	171340	171345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443640
3063	NC_021508	A	8	8	171349	171356	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3064	NC_021508	ATG	2	6	171391	171396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443640
3065	NC_021508	GTT	2	6	171402	171407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443640
3066	NC_021508	GTAC	2	8	171438	171445	25 %	25 %	25 %	25 %	512443640
3067	NC_021508	ATC	2	6	171446	171451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443640
3068	NC_021508	ACA	2	6	171459	171464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443640
3069	NC_021508	CG	3	6	171467	171472	0 %	0 %	50 %	50 %	512443640
3070	NC_021508	TG	3	6	171473	171478	0 %	50 %	50 %	0 %	512443640
3071	NC_021508	ATT	2	6	171485	171490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443640
3072	NC_021508	AGG	2	6	171562	171567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443640
3073	NC_021508	GT	3	6	171664	171669	0 %	50 %	50 %	0 %	512443640
3074	NC_021508	A	6	6	171670	171675	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3075	NC_021508	CGGTA	2	10	171794	171803	20 %	20 %	40 %	20 %	512443640
3076	NC_021508	CAA	2	6	171807	171812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443640
3077	NC_021508	TGC	2	6	171819	171824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3078	NC_021508	TAG	2	6	171846	171851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443640
3079	NC_021508	ATTCC	2	10	171897	171906	20 %	40 %	0 %	40 %	512443640
3080	NC_021508	GCG	2	6	171932	171937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443640
3081	NC_021508	AGC	2	6	171960	171965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3082	NC_021508	GAGG	2	8	172038	172045	25 %	0 %	75 %	0 %	512443640
3083	NC_021508	CCG	2	6	172070	172075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443640
3084	NC_021508	TTG	2	6	172109	172114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443640
3085	NC_021508	ATAAG	2	10	172115	172124	60 %	20 %	20 %	0 %	512443640
3086	NC_021508	T	7	7	172139	172145	0 %	100 %	0 %	0 %	512443640
3087	NC_021508	A	7	7	172156	172162	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3088	NC_021508	GTT	2	6	172191	172196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443640
3089	NC_021508	A	7	7	172215	172221	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3090	NC_021508	GCA	2	6	172286	172291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3091	NC_021508	T	6	6	172321	172326	0 %	100 %	0 %	0 %	512443640
3092	NC_021508	CGC	2	6	172347	172352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443641
3093	NC_021508	CG	3	6	172482	172487	0 %	0 %	50 %	50 %	512443641
3094	NC_021508	TGG	2	6	172493	172498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443641
3095	NC_021508	ACGCA	2	10	172704	172713	40 %	0 %	20 %	40 %	512443641
3096	NC_021508	GA	3	6	172811	172816	50 %	0 %	50 %	0 %	512443641
3097	NC_021508	GAT	2	6	173030	173035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443642
3098	NC_021508	ATG	2	6	173115	173120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443642
3099	NC_021508	CAT	2	6	173225	173230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443642
3100	NC_021508	CATA	2	8	173266	173273	50 %	25 %	0 %	25 %	512443642
3101	NC_021508	TGG	2	6	173275	173280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443642
3102	NC_021508	AGAC	2	8	173292	173299	50 %	0 %	25 %	25 %	512443642
3103	NC_021508	A	6	6	173330	173335	100 %	0 %	0 %	0 %	512443642
3104	NC_021508	GA	3	6	173340	173345	50 %	0 %	50 %	0 %	512443642
3105	NC_021508	CAG	2	6	173354	173359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443642
3106	NC_021508	A	7	7	173365	173371	100 %	0 %	0 %	0 %	512443642
3107	NC_021508	AGT	2	6	173394	173399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443642
3108	NC_021508	CG	3	6	173465	173470	0 %	0 %	50 %	50 %	512443642
3109	NC_021508	TACT	2	8	173481	173488	25 %	50 %	0 %	25 %	512443642
3110	NC_021508	GC	3	6	173541	173546	0 %	0 %	50 %	50 %	512443643
3111	NC_021508	T	6	6	173622	173627	0 %	100 %	0 %	0 %	512443643
3112	NC_021508	A	7	7	173635	173641	100 %	0 %	0 %	0 %	512443643
3113	NC_021508	T	6	6	173710	173715	0 %	100 %	0 %	0 %	512443643
3114	NC_021508	CGTGA	2	10	173770	173779	20 %	20 %	40 %	20 %	512443643
3115	NC_021508	CTTGC	2	10	173795	173804	0 %	40 %	20 %	40 %	512443643
3116	NC_021508	GCG	2	6	173815	173820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443643
3117	NC_021508	TGA	2	6	173825	173830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443643
3118	NC_021508	CTTTT	2	10	173835	173844	0 %	80 %	0 %	20 %	512443643
3119	NC_021508	A	6	6	173845	173850	100 %	0 %	0 %	0 %	512443643
3120	NC_021508	GC	3	6	173859	173864	0 %	0 %	50 %	50 %	512443643
3121	NC_021508	TAG	2	6	173969	173974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443644
3122	NC_021508	AGT	2	6	174020	174025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443644
3123	NC_021508	T	6	6	174083	174088	0 %	100 %	0 %	0 %	512443644
3124	NC_021508	A	6	6	174094	174099	100 %	0 %	0 %	0 %	512443644
3125	NC_021508	GC	3	6	174195	174200	0 %	0 %	50 %	50 %	512443644
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3231	NC_021508	A	6	6	178736	178741	100 %	0 %	0 %	0 %	512443648
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3242	NC_021508	CGG	2	6	179145	179150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443648
3243	NC_021508	CAGTG	2	10	179201	179210	20 %	20 %	40 %	20 %	512443648
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3247	NC_021508	ATT	2	6	179324	179329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443648
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3374	NC_021508	GAA	2	6	185292	185297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443654
3375	NC_021508	CTCA	2	8	185307	185314	25 %	25 %	0 %	50 %	512443654
3376	NC_021508	CGT	2	6	185415	185420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443654
3377	NC_021508	G	6	6	185434	185439	0 %	0 %	100 %	0 %	512443654
3378	NC_021508	CG	3	6	185477	185482	0 %	0 %	50 %	50 %	512443654
3379	NC_021508	TGAA	2	8	185488	185495	50 %	25 %	25 %	0 %	512443654
3380	NC_021508	GTTTT	2	10	185510	185519	0 %	80 %	20 %	0 %	512443654
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3385	NC_021508	CAG	3	9	186313	186321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443655
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3387	NC_021508	GT	3	6	186380	186385	0 %	50 %	50 %	0 %	512443655
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3392	NC_021508	TGC	2	6	186711	186716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443655
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3395	NC_021508	TCT	2	6	187050	187055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443656
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3402	NC_021508	TTG	2	6	187466	187471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443656
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3417	NC_021508	TCA	2	6	188085	188090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443657
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3442	NC_021508	CATTG	2	10	189166	189175	20 %	40 %	20 %	20 %	512443658
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3484	NC_021508	CGG	2	6	191414	191419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443661
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3487	NC_021508	TGCAG	2	10	191555	191564	20 %	20 %	40 %	20 %	512443661
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3495	NC_021508	GGT	2	6	192353	192358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443662
3496	NC_021508	AAG	2	6	192376	192381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443662
3497	NC_021508	AG	3	6	192459	192464	50 %	0 %	50 %	0 %	512443662
3498	NC_021508	TGCTT	2	10	192473	192482	0 %	60 %	20 %	20 %	512443662
3499	NC_021508	TGG	2	6	192502	192507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443662
3500	NC_021508	TTC	2	6	192530	192535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443662

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