MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021508	ATC	2	6	113990	113995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443598
2002	NC_021508	GCG	2	6	114070	114075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443598
2003	NC_021508	TGCG	2	8	114098	114105	0 %	25 %	50 %	25 %	512443598
2004	NC_021508	GAA	2	6	114111	114116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443598
2005	NC_021508	TGCA	2	8	114128	114135	25 %	25 %	25 %	25 %	512443598
2006	NC_021508	TGA	2	6	114197	114202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443598
2007	NC_021508	GATTT	2	10	114212	114221	20 %	60 %	20 %	0 %	512443598
2008	NC_021508	T	7	7	114219	114225	0 %	100 %	0 %	0 %	512443598
2009	NC_021508	TC	3	6	114300	114305	0 %	50 %	0 %	50 %	512443598
2010	NC_021508	TGC	2	6	114324	114329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443598
2011	NC_021508	TGA	2	6	114462	114467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443598
2012	NC_021508	CGT	2	6	114481	114486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443598
2013	NC_021508	GCA	3	9	114501	114509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443598
2014	NC_021508	TAAA	2	8	114515	114522	75 %	25 %	0 %	0 %	512443598
2015	NC_021508	TCC	2	6	114527	114532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443598
2016	NC_021508	GAA	2	6	114552	114557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443598
2017	NC_021508	TAA	2	6	114779	114784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443598
2018	NC_021508	T	6	6	114807	114812	0 %	100 %	0 %	0 %	512443598
2019	NC_021508	A	8	8	114833	114840	100 %	0 %	0 %	0 %	512443598
2020	NC_021508	A	6	6	114852	114857	100 %	0 %	0 %	0 %	512443598
2021	NC_021508	GAG	2	6	114868	114873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443598
2022	NC_021508	GCT	2	6	114888	114893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443598
2023	NC_021508	GAA	2	6	114961	114966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443598
2024	NC_021508	AGG	2	6	114980	114985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443598
2025	NC_021508	GGT	2	6	115033	115038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443598
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2027	NC_021508	TGG	2	6	115253	115258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443598
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2029	NC_021508	A	8	8	115418	115425	100 %	0 %	0 %	0 %	512443598
2030	NC_021508	GC	4	8	115452	115459	0 %	0 %	50 %	50 %	512443598
2031	NC_021508	GA	3	6	115520	115525	50 %	0 %	50 %	0 %	512443598
2032	NC_021508	CG	3	6	115535	115540	0 %	0 %	50 %	50 %	512443598
2033	NC_021508	TGCG	2	8	115589	115596	0 %	25 %	50 %	25 %	512443598
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2038	NC_021508	CG	3	6	115885	115890	0 %	0 %	50 %	50 %	512443599
2039	NC_021508	T	7	7	115939	115945	0 %	100 %	0 %	0 %	512443599
2040	NC_021508	TTG	2	6	115989	115994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443599
2041	NC_021508	TC	3	6	116006	116011	0 %	50 %	0 %	50 %	512443599
2042	NC_021508	GAA	2	6	116102	116107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443599
2043	NC_021508	TG	3	6	116112	116117	0 %	50 %	50 %	0 %	512443599
2044	NC_021508	GAC	2	6	116159	116164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443599
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2046	NC_021508	TG	4	8	116248	116255	0 %	50 %	50 %	0 %	512443599
2047	NC_021508	CGTA	2	8	116313	116320	25 %	25 %	25 %	25 %	512443599
2048	NC_021508	TC	4	8	116364	116371	0 %	50 %	0 %	50 %	512443599
2049	NC_021508	TCC	2	6	116381	116386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443599
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2053	NC_021508	GAA	2	6	116521	116526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443599
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2055	NC_021508	T	6	6	116580	116585	0 %	100 %	0 %	0 %	512443599
2056	NC_021508	TGT	2	6	116600	116605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443599
2057	NC_021508	CTG	2	6	116625	116630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443599
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2060	NC_021508	CAA	2	6	116709	116714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443599
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2095	NC_021508	GC	3	6	118625	118630	0 %	0 %	50 %	50 %	512443599
2096	NC_021508	TTG	2	6	118649	118654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443599
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2099	NC_021508	A	6	6	118872	118877	100 %	0 %	0 %	0 %	512443600
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2107	NC_021508	CG	3	6	119202	119207	0 %	0 %	50 %	50 %	512443600
2108	NC_021508	AGGA	2	8	119223	119230	50 %	0 %	50 %	0 %	512443600
2109	NC_021508	GGT	2	6	119231	119236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443600
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2111	NC_021508	CAG	2	6	119302	119307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443600
2112	NC_021508	CGA	2	6	119315	119320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443600
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2116	NC_021508	CA	3	6	119561	119566	50 %	0 %	0 %	50 %	512443600
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2123	NC_021508	ACAGA	2	10	119794	119803	60 %	0 %	20 %	20 %	512443600
2124	NC_021508	TAT	2	6	119820	119825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443600
2125	NC_021508	TACG	2	8	119832	119839	25 %	25 %	25 %	25 %	512443600
2126	NC_021508	CAG	2	6	119844	119849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443600
2127	NC_021508	GAC	2	6	119852	119857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443600
2128	NC_021508	TG	5	10	119873	119882	0 %	50 %	50 %	0 %	512443600
2129	NC_021508	CTT	2	6	119886	119891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443600
2130	NC_021508	GAA	2	6	119924	119929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443600
2131	NC_021508	ATG	2	6	119947	119952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443600
2132	NC_021508	GCC	2	6	119977	119982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443600
2133	NC_021508	GGGAG	2	10	120000	120009	20 %	0 %	80 %	0 %	512443600
2134	NC_021508	AGT	2	6	120038	120043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443600
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2137	NC_021508	GTGCG	2	10	120131	120140	0 %	20 %	60 %	20 %	512443600
2138	NC_021508	GTA	2	6	120142	120147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443600
2139	NC_021508	CGT	2	6	120189	120194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443600
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2141	NC_021508	GTTT	2	8	120236	120243	0 %	75 %	25 %	0 %	512443600
2142	NC_021508	AGGAA	2	10	120288	120297	60 %	0 %	40 %	0 %	512443600
2143	NC_021508	GA	4	8	120339	120346	50 %	0 %	50 %	0 %	512443600
2144	NC_021508	TTTC	2	8	120362	120369	0 %	75 %	0 %	25 %	512443600
2145	NC_021508	TCT	2	6	120548	120553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443601
2146	NC_021508	TCT	2	6	120590	120595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443601
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2148	NC_021508	T	6	6	120789	120794	0 %	100 %	0 %	0 %	512443601
2149	NC_021508	TACTG	2	10	120825	120834	20 %	40 %	20 %	20 %	512443601
2150	NC_021508	TGAT	2	8	120904	120911	25 %	50 %	25 %	0 %	512443601
2151	NC_021508	GC	3	6	120919	120924	0 %	0 %	50 %	50 %	512443601
2152	NC_021508	CTT	2	6	121077	121082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443601
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2154	NC_021508	TGTT	2	8	121337	121344	0 %	75 %	25 %	0 %	512443601
2155	NC_021508	CG	3	6	121399	121404	0 %	0 %	50 %	50 %	512443601
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2158	NC_021508	CCA	2	6	121505	121510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443601
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2162	NC_021508	CGA	2	6	121755	121760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443601
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2203	NC_021508	GCA	2	6	124595	124600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443603
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2236	NC_021508	GC	3	6	126439	126444	0 %	0 %	50 %	50 %	512443604
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2240	NC_021508	CTTG	2	8	126699	126706	0 %	50 %	25 %	25 %	512443604
2241	NC_021508	CATTG	2	10	126727	126736	20 %	40 %	20 %	20 %	512443604
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2246	NC_021508	CCGTG	2	10	127088	127097	0 %	20 %	40 %	40 %	512443605
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2253	NC_021508	GTA	2	6	127390	127395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443605
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2369	NC_021508	GAAC	2	8	134198	134205	50 %	0 %	25 %	25 %	512443610
2370	NC_021508	A	8	8	134228	134235	100 %	0 %	0 %	0 %	512443610
2371	NC_021508	ATT	2	6	134254	134259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443610
2372	NC_021508	TGCG	2	8	134338	134345	0 %	25 %	50 %	25 %	512443610
2373	NC_021508	TTA	2	6	134376	134381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443610
2374	NC_021508	CATT	2	8	134410	134417	25 %	50 %	0 %	25 %	512443610
2375	NC_021508	T	6	6	134444	134449	0 %	100 %	0 %	0 %	512443610
2376	NC_021508	CGA	3	9	134455	134463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443610
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2381	NC_021508	GC	3	6	134711	134716	0 %	0 %	50 %	50 %	512443610
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2384	NC_021508	TGC	2	6	134741	134746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443610
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2392	NC_021508	AGT	2	6	135399	135404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443611
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2395	NC_021508	GC	3	6	135648	135653	0 %	0 %	50 %	50 %	512443611
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2400	NC_021508	CCT	2	6	135935	135940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443611
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2402	NC_021508	AGC	2	6	136040	136045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443611
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2405	NC_021508	CCGGAG	2	12	136214	136225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512443611
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2491	NC_021508	GT	3	6	140041	140046	0 %	50 %	50 %	0 %	512443615
2492	NC_021508	CGC	2	6	140094	140099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443615
2493	NC_021508	ATT	2	6	140151	140156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443615
2494	NC_021508	GGT	2	6	140202	140207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443615
2495	NC_021508	CACT	2	8	140212	140219	25 %	25 %	0 %	50 %	512443615
2496	NC_021508	ATT	2	6	140280	140285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443615
2497	NC_021508	GC	3	6	140417	140422	0 %	0 %	50 %	50 %	512443615
2498	NC_021508	GGA	2	6	140697	140702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443615
2499	NC_021508	GCA	2	6	140729	140734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443615
2500	NC_021508	GCT	2	6	141112	141117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443616

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