MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021508	GCC	2	6	86747	86752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443572
1502	NC_021508	T	7	7	86783	86789	0 %	100 %	0 %	0 %	512443572
1503	NC_021508	ATTTGT	2	12	86823	86834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512443572
1504	NC_021508	ATT	2	6	86884	86889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443572
1505	NC_021508	T	6	6	86945	86950	0 %	100 %	0 %	0 %	512443572
1506	NC_021508	TG	3	6	86961	86966	0 %	50 %	50 %	0 %	512443572
1507	NC_021508	ACGCTT	2	12	87011	87022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512443572
1508	NC_021508	GTG	2	6	87074	87079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443572
1509	NC_021508	CGCAC	2	10	87080	87089	20 %	0 %	20 %	60 %	512443572
1510	NC_021508	AT	4	8	87112	87119	50 %	50 %	0 %	0 %	512443572
1511	NC_021508	GC	3	6	87142	87147	0 %	0 %	50 %	50 %	512443573
1512	NC_021508	CG	3	6	87182	87187	0 %	0 %	50 %	50 %	512443573
1513	NC_021508	TGC	2	6	87197	87202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1514	NC_021508	CT	3	6	87219	87224	0 %	50 %	0 %	50 %	512443573
1515	NC_021508	GCA	2	6	87250	87255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1516	NC_021508	GGT	2	6	87321	87326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443573
1517	NC_021508	TGA	2	6	87363	87368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443573
1518	NC_021508	TGG	2	6	87398	87403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443573
1519	NC_021508	CA	3	6	87524	87529	50 %	0 %	0 %	50 %	512443573
1520	NC_021508	CTC	2	6	87537	87542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443573
1521	NC_021508	ACT	2	6	87566	87571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443573
1522	NC_021508	GCT	2	6	87628	87633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1523	NC_021508	GCA	2	6	87711	87716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1524	NC_021508	GGC	2	6	87771	87776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443573
1525	NC_021508	CGC	2	6	87891	87896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443573
1526	NC_021508	TGTT	2	8	87914	87921	0 %	75 %	25 %	0 %	512443573
1527	NC_021508	GATC	2	8	87957	87964	25 %	25 %	25 %	25 %	512443573
1528	NC_021508	ATGG	2	8	88073	88080	25 %	25 %	50 %	0 %	512443573
1529	NC_021508	AT	3	6	88142	88147	50 %	50 %	0 %	0 %	512443573
1530	NC_021508	TG	3	6	88223	88228	0 %	50 %	50 %	0 %	512443573
1531	NC_021508	AGGA	2	8	88229	88236	50 %	0 %	50 %	0 %	512443573
1532	NC_021508	TCG	2	6	88242	88247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1533	NC_021508	GC	3	6	88408	88413	0 %	0 %	50 %	50 %	512443573
1534	NC_021508	TCA	2	6	88472	88477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443573
1535	NC_021508	GGA	2	6	88494	88499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443573
1536	NC_021508	T	6	6	88507	88512	0 %	100 %	0 %	0 %	512443573
1537	NC_021508	AGT	2	6	88516	88521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443573
1538	NC_021508	GT	3	6	88602	88607	0 %	50 %	50 %	0 %	512443573
1539	NC_021508	AAG	2	6	88678	88683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443573
1540	NC_021508	GTG	2	6	88699	88704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443573
1541	NC_021508	CTG	2	6	88775	88780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1542	NC_021508	GCAC	2	8	88835	88842	25 %	0 %	25 %	50 %	512443573
1543	NC_021508	TAT	2	6	88857	88862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443573
1544	NC_021508	GTTT	2	8	88914	88921	0 %	75 %	25 %	0 %	512443573
1545	NC_021508	GTACC	2	10	88956	88965	20 %	20 %	20 %	40 %	512443573
1546	NC_021508	GC	3	6	89026	89031	0 %	0 %	50 %	50 %	512443573
1547	NC_021508	ATC	2	6	89047	89052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443573
1548	NC_021508	ATCC	2	8	89054	89061	25 %	25 %	0 %	50 %	512443573
1549	NC_021508	CTC	2	6	89066	89071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443573
1550	NC_021508	TGC	3	9	89100	89108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1551	NC_021508	CTG	2	6	89144	89149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1552	NC_021508	TAC	2	6	89152	89157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443573
1553	NC_021508	GCA	2	6	89158	89163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443573
1554	NC_021508	TTG	2	6	89213	89218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443573
1555	NC_021508	T	6	6	89228	89233	0 %	100 %	0 %	0 %	512443573
1556	NC_021508	CTTC	2	8	89361	89368	0 %	50 %	0 %	50 %	512443574
1557	NC_021508	GA	3	6	89392	89397	50 %	0 %	50 %	0 %	512443574
1558	NC_021508	T	6	6	89454	89459	0 %	100 %	0 %	0 %	512443574
1559	NC_021508	T	7	7	89492	89498	0 %	100 %	0 %	0 %	512443574
1560	NC_021508	TTG	2	6	89524	89529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443574
1561	NC_021508	GCA	2	6	89540	89545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443574
1562	NC_021508	AG	3	6	89594	89599	50 %	0 %	50 %	0 %	512443574
1563	NC_021508	TTA	2	6	89601	89606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443574
1564	NC_021508	GAA	2	6	89628	89633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443574
1565	NC_021508	TTAT	2	8	89773	89780	25 %	75 %	0 %	0 %	512443575
1566	NC_021508	TG	3	6	89803	89808	0 %	50 %	50 %	0 %	512443575
1567	NC_021508	TAC	2	6	89812	89817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443575
1568	NC_021508	GTT	2	6	89907	89912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443575
1569	NC_021508	TGG	2	6	89969	89974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443575
1570	NC_021508	GCAA	2	8	89987	89994	50 %	0 %	25 %	25 %	512443575
1571	NC_021508	GAA	2	6	90007	90012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443575
1572	NC_021508	A	6	6	90011	90016	100 %	0 %	0 %	0 %	512443575
1573	NC_021508	CGCA	2	8	90046	90053	25 %	0 %	25 %	50 %	512443575
1574	NC_021508	G	6	6	90087	90092	0 %	0 %	100 %	0 %	512443575
1575	NC_021508	CTA	2	6	90290	90295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443575
1576	NC_021508	ATT	2	6	90317	90322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443575
1577	NC_021508	CAG	3	9	90354	90362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443575
1578	NC_021508	T	7	7	90393	90399	0 %	100 %	0 %	0 %	512443575
1579	NC_021508	GTA	2	6	90405	90410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443575
1580	NC_021508	AG	3	6	90498	90503	50 %	0 %	50 %	0 %	512443575
1581	NC_021508	CTT	2	6	90548	90553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443575
1582	NC_021508	CTG	2	6	90558	90563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443575
1583	NC_021508	GCAG	2	8	92177	92184	25 %	0 %	50 %	25 %	512443576
1584	NC_021508	G	6	6	92184	92189	0 %	0 %	100 %	0 %	512443576
1585	NC_021508	GC	3	6	92193	92198	0 %	0 %	50 %	50 %	512443576
1586	NC_021508	AGA	2	6	92237	92242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443576
1587	NC_021508	CGTGT	2	10	92284	92293	0 %	40 %	40 %	20 %	512443576
1588	NC_021508	GGTAT	2	10	92298	92307	20 %	40 %	40 %	0 %	512443576
1589	NC_021508	T	6	6	92334	92339	0 %	100 %	0 %	0 %	512443576
1590	NC_021508	CG	3	6	92352	92357	0 %	0 %	50 %	50 %	512443576
1591	NC_021508	TCGG	2	8	93532	93539	0 %	25 %	50 %	25 %	512443577
1592	NC_021508	TTG	2	6	93554	93559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443577
1593	NC_021508	A	7	7	93590	93596	100 %	0 %	0 %	0 %	512443577
1594	NC_021508	GGT	2	6	93679	93684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443577
1595	NC_021508	GAA	2	6	93724	93729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443577
1596	NC_021508	AAG	2	6	93794	93799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443577
1597	NC_021508	AG	3	6	93889	93894	50 %	0 %	50 %	0 %	512443577
1598	NC_021508	GGAT	2	8	93899	93906	25 %	25 %	50 %	0 %	512443577
1599	NC_021508	CG	4	8	93939	93946	0 %	0 %	50 %	50 %	512443577
1600	NC_021508	GGT	2	6	93992	93997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443577
1601	NC_021508	GC	4	8	94007	94014	0 %	0 %	50 %	50 %	512443577
1602	NC_021508	CTA	3	9	94137	94145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443577
1603	NC_021508	GGT	2	6	94182	94187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443577
1604	NC_021508	CTAC	2	8	94212	94219	25 %	25 %	0 %	50 %	512443577
1605	NC_021508	TAC	2	6	94240	94245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443577
1606	NC_021508	TGGC	2	8	94271	94278	0 %	25 %	50 %	25 %	512443577
1607	NC_021508	AATC	2	8	94286	94293	50 %	25 %	0 %	25 %	512443577
1608	NC_021508	AAC	2	6	94315	94320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443577
1609	NC_021508	GC	4	8	94352	94359	0 %	0 %	50 %	50 %	512443577
1610	NC_021508	GCC	2	6	94368	94373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443577
1611	NC_021508	GAA	2	6	94454	94459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443578
1612	NC_021508	GCT	2	6	94499	94504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443578
1613	NC_021508	AAC	2	6	94520	94525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443578
1614	NC_021508	T	7	7	94596	94602	0 %	100 %	0 %	0 %	512443578
1615	NC_021508	GC	4	8	94637	94644	0 %	0 %	50 %	50 %	512443578
1616	NC_021508	TAA	2	6	94813	94818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443579
1617	NC_021508	TTG	2	6	94831	94836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443579
1618	NC_021508	ACT	2	6	95018	95023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443579
1619	NC_021508	TCGA	2	8	95090	95097	25 %	25 %	25 %	25 %	512443579
1620	NC_021508	CA	3	6	95099	95104	50 %	0 %	0 %	50 %	512443579
1621	NC_021508	GCA	2	6	95112	95117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443579
1622	NC_021508	TCG	2	6	95163	95168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443579
1623	NC_021508	TCC	2	6	95175	95180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443579
1624	NC_021508	ATTC	2	8	95237	95244	25 %	50 %	0 %	25 %	512443579
1625	NC_021508	GC	3	6	95353	95358	0 %	0 %	50 %	50 %	512443580
1626	NC_021508	CCA	2	6	95369	95374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443580
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1628	NC_021508	TAC	2	6	95392	95397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443580
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1755	NC_021508	GTG	2	6	101793	101798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443586
1756	NC_021508	CGT	2	6	101826	101831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443586
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1758	NC_021508	TG	3	6	101873	101878	0 %	50 %	50 %	0 %	512443586
1759	NC_021508	GC	3	6	101933	101938	0 %	0 %	50 %	50 %	512443586
1760	NC_021508	GC	3	6	102069	102074	0 %	0 %	50 %	50 %	512443586
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