MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021508	TCC	2	6	57284	57289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443543
1002	NC_021508	GAT	2	6	57293	57298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443543
1003	NC_021508	CGC	2	6	57316	57321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443543
1004	NC_021508	CG	4	8	57327	57334	0 %	0 %	50 %	50 %	512443543
1005	NC_021508	ACA	2	6	57408	57413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443543
1006	NC_021508	CTG	2	6	58246	58251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443544
1007	NC_021508	CTT	2	6	58252	58257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443544
1008	NC_021508	CCG	2	6	58306	58311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443544
1009	NC_021508	A	8	8	58351	58358	100 %	0 %	0 %	0 %	512443544
1010	NC_021508	AGA	2	6	58383	58388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443544
1011	NC_021508	GTA	2	6	58410	58415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443544
1012	NC_021508	GCG	2	6	58479	58484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443544
1013	NC_021508	GC	3	6	58490	58495	0 %	0 %	50 %	50 %	512443544
1014	NC_021508	TGC	2	6	58820	58825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443545
1015	NC_021508	TTG	2	6	58835	58840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443545
1016	NC_021508	GCAGG	2	10	58860	58869	20 %	0 %	60 %	20 %	512443545
1017	NC_021508	GTA	3	9	58879	58887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443545
1018	NC_021508	AG	3	6	58915	58920	50 %	0 %	50 %	0 %	512443545
1019	NC_021508	AGT	2	6	58986	58991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443545
1020	NC_021508	ATC	2	6	59128	59133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443545
1021	NC_021508	AGG	2	6	59170	59175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443545
1022	NC_021508	TGA	2	6	59196	59201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443545
1023	NC_021508	CGC	2	6	59204	59209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443545
1024	NC_021508	AGG	2	6	59257	59262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443545
1025	NC_021508	TCA	2	6	59393	59398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443545
1026	NC_021508	GAA	2	6	59599	59604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443546
1027	NC_021508	GC	3	6	59607	59612	0 %	0 %	50 %	50 %	512443546
1028	NC_021508	CAG	2	6	59629	59634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443546
1029	NC_021508	CTGCA	2	10	59840	59849	20 %	20 %	20 %	40 %	512443546
1030	NC_021508	GCT	2	6	59874	59879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443546
1031	NC_021508	C	6	6	59884	59889	0 %	0 %	0 %	100 %	512443546
1032	NC_021508	AGA	2	6	59903	59908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443546
1033	NC_021508	CGG	2	6	59928	59933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443546
1034	NC_021508	CGG	2	6	59937	59942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443546
1035	NC_021508	TGA	2	6	59943	59948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443546
1036	NC_021508	AGC	2	6	59949	59954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443546
1037	NC_021508	TGC	2	6	59961	59966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443546
1038	NC_021508	GGA	2	6	60049	60054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443546
1039	NC_021508	TGC	2	6	60194	60199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443546
1040	NC_021508	CGTG	2	8	60240	60247	0 %	25 %	50 %	25 %	512443546
1041	NC_021508	TGG	2	6	60273	60278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443546
1042	NC_021508	GT	3	6	60282	60287	0 %	50 %	50 %	0 %	512443546
1043	NC_021508	CTAC	2	8	60322	60329	25 %	25 %	0 %	50 %	512443546
1044	NC_021508	TGTC	2	8	60342	60349	0 %	50 %	25 %	25 %	512443546
1045	NC_021508	TCAAA	2	10	60363	60372	60 %	20 %	0 %	20 %	512443546
1046	NC_021508	GCA	2	6	60401	60406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443546
1047	NC_021508	ATC	2	6	60533	60538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443546
1048	NC_021508	GCGT	2	8	60539	60546	0 %	25 %	50 %	25 %	512443546
1049	NC_021508	GA	3	6	60623	60628	50 %	0 %	50 %	0 %	512443546
1050	NC_021508	CG	3	6	60677	60682	0 %	0 %	50 %	50 %	512443547
1051	NC_021508	GTT	2	6	60686	60691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443547
1052	NC_021508	AC	3	6	60721	60726	50 %	0 %	0 %	50 %	512443547
1053	NC_021508	TTGC	2	8	60759	60766	0 %	50 %	25 %	25 %	512443547
1054	NC_021508	CGTG	2	8	60774	60781	0 %	25 %	50 %	25 %	512443547
1055	NC_021508	CAG	2	6	60795	60800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443547
1056	NC_021508	T	6	6	60894	60899	0 %	100 %	0 %	0 %	512443547
1057	NC_021508	ATG	2	6	60993	60998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443547
1058	NC_021508	TGCG	2	8	61108	61115	0 %	25 %	50 %	25 %	512443547
1059	NC_021508	CT	3	6	61129	61134	0 %	50 %	0 %	50 %	512443547
1060	NC_021508	CG	3	6	61187	61192	0 %	0 %	50 %	50 %	512443547
1061	NC_021508	CG	3	6	61219	61224	0 %	0 %	50 %	50 %	512443547
1062	NC_021508	ATG	2	6	61321	61326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443547
1063	NC_021508	GC	5	10	61365	61374	0 %	0 %	50 %	50 %	512443547
1064	NC_021508	CAC	2	6	61455	61460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443547
1065	NC_021508	AAGG	2	8	61476	61483	50 %	0 %	50 %	0 %	512443547
1066	NC_021508	GC	3	6	61530	61535	0 %	0 %	50 %	50 %	512443547
1067	NC_021508	GCA	2	6	61545	61550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443547
1068	NC_021508	TC	3	6	61580	61585	0 %	50 %	0 %	50 %	512443547
1069	NC_021508	ATC	2	6	61750	61755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443548
1070	NC_021508	A	7	7	61798	61804	100 %	0 %	0 %	0 %	512443548
1071	NC_021508	CCA	2	6	61941	61946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443548
1072	NC_021508	C	6	6	61989	61994	0 %	0 %	0 %	100 %	512443548
1073	NC_021508	AAT	2	6	62092	62097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443548
1074	NC_021508	GT	4	8	62116	62123	0 %	50 %	50 %	0 %	512443548
1075	NC_021508	TTA	2	6	62174	62179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443548
1076	NC_021508	AGA	2	6	62193	62198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443548
1077	NC_021508	AAAT	2	8	62216	62223	75 %	25 %	0 %	0 %	512443548
1078	NC_021508	CAG	2	6	62257	62262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443548
1079	NC_021508	GC	3	6	62320	62325	0 %	0 %	50 %	50 %	512443548
1080	NC_021508	TCG	2	6	62336	62341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443548
1081	NC_021508	TTC	2	6	62371	62376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443548
1082	NC_021508	TGTAAC	2	12	62400	62411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512443548
1083	NC_021508	AAGG	2	8	62530	62537	50 %	0 %	50 %	0 %	512443548
1084	NC_021508	TTC	2	6	62614	62619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443548
1085	NC_021508	GTT	2	6	62632	62637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443548
1086	NC_021508	TGCC	2	8	62641	62648	0 %	25 %	25 %	50 %	512443548
1087	NC_021508	C	6	6	62710	62715	0 %	0 %	0 %	100 %	512443548
1088	NC_021508	GC	3	6	62763	62768	0 %	0 %	50 %	50 %	512443548
1089	NC_021508	CAT	2	6	62794	62799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443548
1090	NC_021508	CCT	2	6	63021	63026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443549
1091	NC_021508	GCG	2	6	63029	63034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443549
1092	NC_021508	CT	3	6	63041	63046	0 %	50 %	0 %	50 %	512443549
1093	NC_021508	GCA	2	6	63082	63087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443549
1094	NC_021508	T	6	6	63114	63119	0 %	100 %	0 %	0 %	512443549
1095	NC_021508	TGCG	2	8	63127	63134	0 %	25 %	50 %	25 %	512443549
1096	NC_021508	TG	3	6	63151	63156	0 %	50 %	50 %	0 %	512443549
1097	NC_021508	TGC	2	6	63164	63169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443549
1098	NC_021508	TGC	2	6	63245	63250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443549
1099	NC_021508	TGT	2	6	63323	63328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443549
1100	NC_021508	TGC	2	6	63380	63385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443549
1101	NC_021508	T	7	7	63386	63392	0 %	100 %	0 %	0 %	512443549
1102	NC_021508	CACT	2	8	63399	63406	25 %	25 %	0 %	50 %	512443549
1103	NC_021508	GGT	2	6	63407	63412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443549
1104	NC_021508	CAG	2	6	63426	63431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443549
1105	NC_021508	GGA	2	6	63468	63473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443549
1106	NC_021508	TTG	2	6	63489	63494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443549
1107	NC_021508	TG	3	6	63526	63531	0 %	50 %	50 %	0 %	512443549
1108	NC_021508	GAA	2	6	63609	63614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443549
1109	NC_021508	GAG	2	6	63639	63644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443549
1110	NC_021508	ATC	2	6	63679	63684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443549
1111	NC_021508	GCAG	2	8	63696	63703	25 %	0 %	50 %	25 %	512443549
1112	NC_021508	T	7	7	63745	63751	0 %	100 %	0 %	0 %	512443549
1113	NC_021508	GCCAC	2	10	63807	63816	20 %	0 %	20 %	60 %	512443549
1114	NC_021508	TCC	2	6	64206	64211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443550
1115	NC_021508	TG	3	6	64235	64240	0 %	50 %	50 %	0 %	512443550
1116	NC_021508	GC	3	6	64242	64247	0 %	0 %	50 %	50 %	512443550
1117	NC_021508	TCT	2	6	64253	64258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443550
1118	NC_021508	AGG	2	6	64309	64314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443550
1119	NC_021508	CGC	2	6	64321	64326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443550
1120	NC_021508	ACG	2	6	64523	64528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443551
1121	NC_021508	TAT	2	6	64602	64607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443551
1122	NC_021508	TCAG	2	8	64745	64752	25 %	25 %	25 %	25 %	512443551
1123	NC_021508	TGC	2	6	64761	64766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443551
1124	NC_021508	GC	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	512443551
1125	NC_021508	ACT	2	6	64990	64995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443551
1126	NC_021508	GGC	2	6	65022	65027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443551
1127	NC_021508	AGC	2	6	65169	65174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443551
1128	NC_021508	CAGT	2	8	65410	65417	25 %	25 %	25 %	25 %	512443551
1129	NC_021508	ACC	2	6	65441	65446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443551
1130	NC_021508	CTG	2	6	65453	65458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443551
1131	NC_021508	CCT	2	6	65501	65506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443551
1132	NC_021508	TGG	2	6	65519	65524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443551
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1135	NC_021508	TGCCT	2	10	65580	65589	0 %	40 %	20 %	40 %	512443551
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1149	NC_021508	TG	3	6	66229	66234	0 %	50 %	50 %	0 %	512443552
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1162	NC_021508	CT	3	6	66790	66795	0 %	50 %	0 %	50 %	512443552
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1240	NC_021508	TTAC	2	8	71462	71469	25 %	50 %	0 %	25 %	512443559
1241	NC_021508	TTC	2	6	71473	71478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443559
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1247	NC_021508	A	6	6	72205	72210	100 %	0 %	0 %	0 %	512443560
1248	NC_021508	GT	3	6	72251	72256	0 %	50 %	50 %	0 %	512443560
1249	NC_021508	CT	3	6	72418	72423	0 %	50 %	0 %	50 %	512443561
1250	NC_021508	GCT	2	6	72440	72445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443561
1251	NC_021508	TAT	2	6	72591	72596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443561
1252	NC_021508	TA	3	6	72662	72667	50 %	50 %	0 %	0 %	512443561
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