MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021508	GC	3	6	629998	630003	0 %	0 %	50 %	50 %	512444037
12002	NC_021508	CG	3	6	630049	630054	0 %	0 %	50 %	50 %	512444037
12003	NC_021508	CGA	2	6	630084	630089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444037
12004	NC_021508	AGA	3	9	630093	630101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444037
12005	NC_021508	GAA	2	6	630106	630111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444037
12006	NC_021508	ACG	2	6	630162	630167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444038
12007	NC_021508	T	6	6	630202	630207	0 %	100 %	0 %	0 %	512444038
12008	NC_021508	GC	3	6	630209	630214	0 %	0 %	50 %	50 %	512444038
12009	NC_021508	GCT	2	6	630222	630227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444038
12010	NC_021508	AG	3	6	630258	630263	50 %	0 %	50 %	0 %	512444038
12011	NC_021508	CA	3	6	630270	630275	50 %	0 %	0 %	50 %	512444038
12012	NC_021508	CGC	2	6	630285	630290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444038
12013	NC_021508	GC	3	6	630289	630294	0 %	0 %	50 %	50 %	512444038
12014	NC_021508	CTG	2	6	630443	630448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444038
12015	NC_021508	GCC	2	6	630499	630504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444038
12016	NC_021508	GCA	2	6	630520	630525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444038
12017	NC_021508	AAC	2	6	630533	630538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444038
12018	NC_021508	CAC	2	6	630544	630549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444038
12019	NC_021508	G	6	6	630585	630590	0 %	0 %	100 %	0 %	512444038
12020	NC_021508	CTG	2	6	630599	630604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444038
12021	NC_021508	GC	4	8	630633	630640	0 %	0 %	50 %	50 %	512444038
12022	NC_021508	CCA	2	6	630782	630787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444038
12023	NC_021508	AC	3	6	630866	630871	50 %	0 %	0 %	50 %	512444038
12024	NC_021508	T	6	6	630890	630895	0 %	100 %	0 %	0 %	512444038
12025	NC_021508	CAT	2	6	630897	630902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444038
12026	NC_021508	G	6	6	630938	630943	0 %	0 %	100 %	0 %	512444038
12027	NC_021508	CG	4	8	630972	630979	0 %	0 %	50 %	50 %	512444038
12028	NC_021508	GTTT	2	8	630981	630988	0 %	75 %	25 %	0 %	512444038
12029	NC_021508	GAT	2	6	631010	631015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444038
12030	NC_021508	CAG	2	6	631040	631045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444039
12031	NC_021508	TG	3	6	631063	631068	0 %	50 %	50 %	0 %	512444039
12032	NC_021508	GC	3	6	631078	631083	0 %	0 %	50 %	50 %	512444039
12033	NC_021508	A	6	6	631132	631137	100 %	0 %	0 %	0 %	512444039
12034	NC_021508	TCC	2	6	631155	631160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444039
12035	NC_021508	TCA	2	6	631272	631277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444039
12036	NC_021508	A	6	6	631453	631458	100 %	0 %	0 %	0 %	512444039
12037	NC_021508	ACCAC	2	10	631464	631473	40 %	0 %	0 %	60 %	512444039
12038	NC_021508	AC	4	8	631472	631479	50 %	0 %	0 %	50 %	512444039
12039	NC_021508	CG	4	8	631485	631492	0 %	0 %	50 %	50 %	512444039
12040	NC_021508	TCG	2	6	631513	631518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444039
12041	NC_021508	CG	3	6	631534	631539	0 %	0 %	50 %	50 %	512444039
12042	NC_021508	ACGC	2	8	631552	631559	25 %	0 %	25 %	50 %	512444039
12043	NC_021508	ACGCGC	2	12	631573	631584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512444039
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12046	NC_021508	AAGG	2	8	631710	631717	50 %	0 %	50 %	0 %	512444039
12047	NC_021508	GGAA	2	8	631747	631754	50 %	0 %	50 %	0 %	512444039
12048	NC_021508	GC	4	8	631845	631852	0 %	0 %	50 %	50 %	512444040
12049	NC_021508	T	8	8	631877	631884	0 %	100 %	0 %	0 %	512444040
12050	NC_021508	CAG	2	6	631948	631953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444040
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12052	NC_021508	TAT	2	6	632098	632103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444040
12053	NC_021508	GC	3	6	632242	632247	0 %	0 %	50 %	50 %	512444040
12054	NC_021508	GTAC	2	8	632257	632264	25 %	25 %	25 %	25 %	512444040
12055	NC_021508	CAC	2	6	632412	632417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444040
12056	NC_021508	ACG	2	6	632428	632433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444040
12057	NC_021508	TCTT	2	8	632492	632499	0 %	75 %	0 %	25 %	512444040
12058	NC_021508	T	7	7	632553	632559	0 %	100 %	0 %	0 %	512444040
12059	NC_021508	AGA	2	6	632576	632581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444040
12060	NC_021508	CTT	2	6	632593	632598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444040
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12062	NC_021508	GAA	2	6	632671	632676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444040
12063	NC_021508	GTCA	2	8	632707	632714	25 %	25 %	25 %	25 %	512444040
12064	NC_021508	CT	4	8	632763	632770	0 %	50 %	0 %	50 %	512444040
12065	NC_021508	AAT	2	6	632814	632819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444040
12066	NC_021508	CTG	2	6	632834	632839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444040
12067	NC_021508	CTT	2	6	632888	632893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444040
12068	NC_021508	GT	3	6	632897	632902	0 %	50 %	50 %	0 %	512444040
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12070	NC_021508	ATGA	2	8	633062	633069	50 %	25 %	25 %	0 %	512444040
12071	NC_021508	TTCT	2	8	633075	633082	0 %	75 %	0 %	25 %	512444041
12072	NC_021508	AAGT	2	8	633090	633097	50 %	25 %	25 %	0 %	512444041
12073	NC_021508	CTG	2	6	633106	633111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444041
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12076	NC_021508	GCAC	2	8	633295	633302	25 %	0 %	25 %	50 %	512444041
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12079	NC_021508	GC	3	6	633472	633477	0 %	0 %	50 %	50 %	512444041
12080	NC_021508	CAT	2	6	633479	633484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444041
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12082	NC_021508	CAG	2	6	633522	633527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444041
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12085	NC_021508	CAG	2	6	633716	633721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444041
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12090	NC_021508	CAT	2	6	633966	633971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444042
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12092	NC_021508	CAC	2	6	634020	634025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444042
12093	NC_021508	GAT	2	6	634029	634034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444042
12094	NC_021508	GCAAC	2	10	634096	634105	40 %	0 %	20 %	40 %	512444042
12095	NC_021508	TCAC	2	8	634167	634174	25 %	25 %	0 %	50 %	512444042
12096	NC_021508	GATG	2	8	634175	634182	25 %	25 %	50 %	0 %	512444042
12097	NC_021508	G	6	6	634228	634233	0 %	0 %	100 %	0 %	512444042
12098	NC_021508	T	8	8	634257	634264	0 %	100 %	0 %	0 %	512444042
12099	NC_021508	AC	3	6	634338	634343	50 %	0 %	0 %	50 %	512444042
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12101	NC_021508	GC	3	6	634455	634460	0 %	0 %	50 %	50 %	512444042
12102	NC_021508	GGT	2	6	634461	634466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444042
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12105	NC_021508	CTTT	2	8	634567	634574	0 %	75 %	0 %	25 %	512444042
12106	NC_021508	ATCG	2	8	634685	634692	25 %	25 %	25 %	25 %	512444042
12107	NC_021508	GTTATT	2	12	634722	634733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512444042
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12109	NC_021508	TGG	2	6	634784	634789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444042
12110	NC_021508	CTC	2	6	634841	634846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444042
12111	NC_021508	AGG	2	6	635133	635138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444042
12112	NC_021508	CAT	2	6	635166	635171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444042
12113	NC_021508	GAA	2	6	635325	635330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444043
12114	NC_021508	TGC	2	6	635464	635469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444043
12115	NC_021508	T	6	6	635612	635617	0 %	100 %	0 %	0 %	512444043
12116	NC_021508	ACT	2	6	635623	635628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444043
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12118	NC_021508	AC	3	6	635734	635739	50 %	0 %	0 %	50 %	512444043
12119	NC_021508	GCT	2	6	635775	635780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444043
12120	NC_021508	CAGCA	2	10	635846	635855	40 %	0 %	20 %	40 %	512444043
12121	NC_021508	CAA	2	6	635948	635953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444043
12122	NC_021508	GA	3	6	636044	636049	50 %	0 %	50 %	0 %	512444043
12123	NC_021508	TCC	2	6	636088	636093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444043
12124	NC_021508	GAA	2	6	636102	636107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444043
12125	NC_021508	TCT	2	6	636108	636113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444043
12126	NC_021508	TAC	2	6	636157	636162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444043
12127	NC_021508	GAG	2	6	636234	636239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444043
12128	NC_021508	CTT	2	6	636263	636268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444043
12129	NC_021508	GTC	3	9	636336	636344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444043
12130	NC_021508	GT	3	6	636413	636418	0 %	50 %	50 %	0 %	512444043
12131	NC_021508	AGC	2	6	636487	636492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444043
12132	NC_021508	TGA	2	6	636557	636562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444043
12133	NC_021508	TAC	2	6	636564	636569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444043
12134	NC_021508	GC	3	6	636590	636595	0 %	0 %	50 %	50 %	512444043
12135	NC_021508	CAC	2	6	636632	636637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444043
12136	NC_021508	CGC	2	6	636745	636750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444044
12137	NC_021508	GTA	2	6	636763	636768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444044
12138	NC_021508	CTT	2	6	636775	636780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444044
12139	NC_021508	CT	3	6	636788	636793	0 %	50 %	0 %	50 %	512444044
12140	NC_021508	TTCC	2	8	636794	636801	0 %	50 %	0 %	50 %	512444044
12141	NC_021508	A	10	10	636803	636812	100 %	0 %	0 %	0 %	512444044
12142	NC_021508	CGC	2	6	636821	636826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444044
12143	NC_021508	GAAA	2	8	636838	636845	75 %	0 %	25 %	0 %	512444044
12144	NC_021508	CG	3	6	636902	636907	0 %	0 %	50 %	50 %	512444044
12145	NC_021508	GCT	2	6	636921	636926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444044
12146	NC_021508	TTTC	2	8	637053	637060	0 %	75 %	0 %	25 %	512444044
12147	NC_021508	GAATG	2	10	637123	637132	40 %	20 %	40 %	0 %	512444044
12148	NC_021508	T	6	6	637146	637151	0 %	100 %	0 %	0 %	512444044
12149	NC_021508	CAG	2	6	637268	637273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444044
12150	NC_021508	TTCA	2	8	637279	637286	25 %	50 %	0 %	25 %	512444044
12151	NC_021508	CAC	2	6	637297	637302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444044
12152	NC_021508	CCACC	2	10	637317	637326	20 %	0 %	0 %	80 %	512444044
12153	NC_021508	CG	3	6	637353	637358	0 %	0 %	50 %	50 %	512444044
12154	NC_021508	CA	3	6	637376	637381	50 %	0 %	0 %	50 %	512444044
12155	NC_021508	ACA	2	6	637419	637424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444044
12156	NC_021508	GTG	2	6	637441	637446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444044
12157	NC_021508	GC	3	6	637528	637533	0 %	0 %	50 %	50 %	512444044
12158	NC_021508	GGA	2	6	637719	637724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444044
12159	NC_021508	CG	3	6	637731	637736	0 %	0 %	50 %	50 %	512444044
12160	NC_021508	TATT	2	8	637738	637745	25 %	75 %	0 %	0 %	512444044
12161	NC_021508	GTA	2	6	637795	637800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444044
12162	NC_021508	GC	4	8	637816	637823	0 %	0 %	50 %	50 %	512444044
12163	NC_021508	CG	3	6	637825	637830	0 %	0 %	50 %	50 %	512444044
12164	NC_021508	CTC	2	6	637871	637876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444044
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12166	NC_021508	CTG	2	6	638137	638142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444044
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12187	NC_021508	CAATC	2	10	639418	639427	40 %	20 %	0 %	40 %	512444045
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12223	NC_021508	GC	3	6	641280	641285	0 %	0 %	50 %	50 %	512444046
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12227	NC_021508	TG	3	6	641525	641530	0 %	50 %	50 %	0 %	512444046
12228	NC_021508	GCG	2	6	641564	641569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444046
12229	NC_021508	A	8	8	641579	641586	100 %	0 %	0 %	0 %	512444046
12230	NC_021508	GTT	2	6	641624	641629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444046
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12232	NC_021508	AAG	2	6	641642	641647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444046
12233	NC_021508	CCT	2	6	641659	641664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444046
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12235	NC_021508	T	6	6	641714	641719	0 %	100 %	0 %	0 %	512444046
12236	NC_021508	AAC	2	6	641727	641732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444046
12237	NC_021508	A	6	6	641737	641742	100 %	0 %	0 %	0 %	512444046
12238	NC_021508	GC	3	6	641826	641831	0 %	0 %	50 %	50 %	512444046
12239	NC_021508	GCC	2	6	641834	641839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444046
12240	NC_021508	CTT	2	6	641879	641884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444046
12241	NC_021508	CG	3	6	642024	642029	0 %	0 %	50 %	50 %	512444046
12242	NC_021508	CCT	2	6	642034	642039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444046
12243	NC_021508	GCA	2	6	642231	642236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444047
12244	NC_021508	CAAC	2	8	642256	642263	50 %	0 %	0 %	50 %	512444047
12245	NC_021508	AGCCAT	2	12	642287	642298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444047
12246	NC_021508	ATA	2	6	642306	642311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444047
12247	NC_021508	ATC	2	6	642502	642507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444048
12248	NC_021508	ATA	2	6	642514	642519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444048
12249	NC_021508	TGC	2	6	642529	642534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444048
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12252	NC_021508	TTCC	2	8	642644	642651	0 %	50 %	0 %	50 %	512444048
12253	NC_021508	TAG	2	6	642696	642701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444048
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12264	NC_021508	AAAG	2	8	643094	643101	75 %	0 %	25 %	0 %	512444048
12265	NC_021508	CTCG	2	8	643102	643109	0 %	25 %	25 %	50 %	512444048
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12271	NC_021508	TCG	2	6	644223	644228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444049
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12274	NC_021508	GC	3	6	644331	644336	0 %	0 %	50 %	50 %	512444049
12275	NC_021508	CAT	2	6	644490	644495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444049
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12277	NC_021508	AGA	2	6	644544	644549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444049
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12284	NC_021508	ATC	2	6	644998	645003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444049
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12351	NC_021508	AATT	2	8	647892	647899	50 %	50 %	0 %	0 %	512444051
12352	NC_021508	CCA	2	6	647942	647947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444051
12353	NC_021508	ACCA	2	8	647995	648002	50 %	0 %	0 %	50 %	512444051
12354	NC_021508	CTT	2	6	648025	648030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444051
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12358	NC_021508	GCCC	2	8	648311	648318	0 %	0 %	25 %	75 %	512444051
12359	NC_021508	CAAC	2	8	648338	648345	50 %	0 %	0 %	50 %	512444051
12360	NC_021508	A	6	6	648365	648370	100 %	0 %	0 %	0 %	512444051
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12363	NC_021508	TCC	2	6	648575	648580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444052
12364	NC_021508	CTC	2	6	648594	648599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444052
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12366	NC_021508	CT	4	8	648619	648626	0 %	50 %	0 %	50 %	512444052
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12489	NC_021508	C	6	6	654216	654221	0 %	0 %	0 %	100 %	512444056
12490	NC_021508	TTTC	2	8	654261	654268	0 %	75 %	0 %	25 %	512444056
12491	NC_021508	GCG	2	6	654328	654333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444056
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12493	NC_021508	CAC	2	6	654375	654380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444056
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12499	NC_021508	TCT	2	6	654504	654509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444057
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