MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021508	TG	3	6	605961	605966	0 %	50 %	50 %	0 %	512444019
11502	NC_021508	GCG	2	6	605995	606000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444019
11503	NC_021508	GT	3	6	606044	606049	0 %	50 %	50 %	0 %	512444019
11504	NC_021508	CA	3	6	606065	606070	50 %	0 %	0 %	50 %	512444019
11505	NC_021508	GCAC	2	8	606073	606080	25 %	0 %	25 %	50 %	512444019
11506	NC_021508	CTT	2	6	606120	606125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444019
11507	NC_021508	TC	4	8	606134	606141	0 %	50 %	0 %	50 %	512444019
11508	NC_021508	CGGG	2	8	606170	606177	0 %	0 %	75 %	25 %	512444019
11509	NC_021508	GC	3	6	606200	606205	0 %	0 %	50 %	50 %	512444019
11510	NC_021508	GT	3	6	606214	606219	0 %	50 %	50 %	0 %	512444019
11511	NC_021508	TTTA	2	8	606273	606280	25 %	75 %	0 %	0 %	512444019
11512	NC_021508	CTG	2	6	606287	606292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444019
11513	NC_021508	GTT	2	6	606294	606299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444019
11514	NC_021508	TGA	2	6	606302	606307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444019
11515	NC_021508	T	6	6	606428	606433	0 %	100 %	0 %	0 %	512444019
11516	NC_021508	AGA	2	6	606443	606448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444019
11517	NC_021508	GTG	2	6	606611	606616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444020
11518	NC_021508	AAG	2	6	606662	606667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444020
11519	NC_021508	GCAG	2	8	606752	606759	25 %	0 %	50 %	25 %	512444020
11520	NC_021508	CCT	2	6	606780	606785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444020
11521	NC_021508	ACC	2	6	606797	606802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444020
11522	NC_021508	CTG	2	6	606824	606829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444020
11523	NC_021508	GCT	3	9	606845	606853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444020
11524	NC_021508	CGCT	2	8	606909	606916	0 %	25 %	25 %	50 %	512444020
11525	NC_021508	GC	3	6	606917	606922	0 %	0 %	50 %	50 %	512444020
11526	NC_021508	GGCGC	2	10	606949	606958	0 %	0 %	60 %	40 %	512444020
11527	NC_021508	CCA	2	6	607018	607023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444020
11528	NC_021508	GCGCGA	2	12	607081	607092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512444020
11529	NC_021508	CGG	2	6	607174	607179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444020
11530	NC_021508	CTGT	2	8	607234	607241	0 %	50 %	25 %	25 %	512444020
11531	NC_021508	CCT	2	6	607265	607270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444020
11532	NC_021508	GC	3	6	607310	607315	0 %	0 %	50 %	50 %	512444020
11533	NC_021508	GACA	2	8	607351	607358	50 %	0 %	25 %	25 %	512444020
11534	NC_021508	AC	3	6	607376	607381	50 %	0 %	0 %	50 %	512444020
11535	NC_021508	GCCCCT	2	12	607382	607393	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512444020
11536	NC_021508	ATG	2	6	607421	607426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444020
11537	NC_021508	GC	3	6	607456	607461	0 %	0 %	50 %	50 %	512444020
11538	NC_021508	CCGC	2	8	607558	607565	0 %	0 %	25 %	75 %	512444020
11539	NC_021508	AGA	2	6	607582	607587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444020
11540	NC_021508	TAT	2	6	607588	607593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444020
11541	NC_021508	GTAC	2	8	607614	607621	25 %	25 %	25 %	25 %	512444020
11542	NC_021508	TCCG	2	8	607632	607639	0 %	25 %	25 %	50 %	512444020
11543	NC_021508	CTG	2	6	607648	607653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444020
11544	NC_021508	AGA	2	6	607696	607701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444020
11545	NC_021508	AGA	2	6	607744	607749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444020
11546	NC_021508	ACGC	2	8	607768	607775	25 %	0 %	25 %	50 %	512444020
11547	NC_021508	ATT	2	6	607888	607893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444021
11548	NC_021508	CCA	2	6	607895	607900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444021
11549	NC_021508	CGG	2	6	607907	607912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444021
11550	NC_021508	CTC	2	6	608045	608050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444021
11551	NC_021508	CTG	2	6	608078	608083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11552	NC_021508	CACACG	2	12	608115	608126	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512444021
11553	NC_021508	CTC	2	6	608235	608240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444021
11554	NC_021508	AC	3	6	608307	608312	50 %	0 %	0 %	50 %	512444021
11555	NC_021508	GCA	2	6	608327	608332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11556	NC_021508	TCT	2	6	608359	608364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444021
11557	NC_021508	CAG	2	6	608369	608374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11558	NC_021508	CGCA	2	8	608400	608407	25 %	0 %	25 %	50 %	512444021
11559	NC_021508	AGCG	2	8	608412	608419	25 %	0 %	50 %	25 %	512444021
11560	NC_021508	TCT	2	6	608446	608451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444021
11561	NC_021508	AGT	2	6	608531	608536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444021
11562	NC_021508	A	6	6	608540	608545	100 %	0 %	0 %	0 %	512444021
11563	NC_021508	ACGC	2	8	608564	608571	25 %	0 %	25 %	50 %	512444021
11564	NC_021508	CCG	2	6	608575	608580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444021
11565	NC_021508	GCC	2	6	608643	608648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444021
11566	NC_021508	CAGAG	2	10	608744	608753	40 %	0 %	40 %	20 %	512444021
11567	NC_021508	GACA	2	8	608816	608823	50 %	0 %	25 %	25 %	512444021
11568	NC_021508	AGCT	2	8	608829	608836	25 %	25 %	25 %	25 %	512444021
11569	NC_021508	AGC	2	6	608865	608870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11570	NC_021508	A	7	7	608997	609003	100 %	0 %	0 %	0 %	512444021
11571	NC_021508	T	6	6	609031	609036	0 %	100 %	0 %	0 %	512444021
11572	NC_021508	CT	3	6	609039	609044	0 %	50 %	0 %	50 %	512444021
11573	NC_021508	CG	3	6	609079	609084	0 %	0 %	50 %	50 %	512444021
11574	NC_021508	AAT	2	6	609114	609119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444021
11575	NC_021508	GA	3	6	609135	609140	50 %	0 %	50 %	0 %	512444021
11576	NC_021508	ATA	2	6	609178	609183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444021
11577	NC_021508	GCA	2	6	609209	609214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11578	NC_021508	GCCA	2	8	609218	609225	25 %	0 %	25 %	50 %	512444021
11579	NC_021508	TCA	2	6	609298	609303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444021
11580	NC_021508	A	6	6	609305	609310	100 %	0 %	0 %	0 %	512444021
11581	NC_021508	GTG	2	6	609405	609410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444021
11582	NC_021508	TCA	2	6	609427	609432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444021
11583	NC_021508	GTT	2	6	609511	609516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444021
11584	NC_021508	CGT	2	6	609605	609610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11585	NC_021508	GCA	2	6	609628	609633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11586	NC_021508	GCA	2	6	609736	609741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11587	NC_021508	CTG	2	6	609746	609751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444021
11588	NC_021508	CG	3	6	609831	609836	0 %	0 %	50 %	50 %	512444021
11589	NC_021508	CTT	2	6	609842	609847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444021
11590	NC_021508	AGC	2	6	609960	609965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444022
11591	NC_021508	ACC	3	9	610001	610009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444022
11592	NC_021508	CTC	2	6	610021	610026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444022
11593	NC_021508	CGC	2	6	610083	610088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444022
11594	NC_021508	GAA	2	6	610097	610102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444022
11595	NC_021508	C	6	6	610140	610145	0 %	0 %	0 %	100 %	512444022
11596	NC_021508	A	6	6	610153	610158	100 %	0 %	0 %	0 %	512444022
11597	NC_021508	GCA	2	6	610159	610164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444022
11598	NC_021508	GAA	2	6	610166	610171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444022
11599	NC_021508	CTG	2	6	610247	610252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444022
11600	NC_021508	AC	3	6	610303	610308	50 %	0 %	0 %	50 %	512444022
11601	NC_021508	TGCA	2	8	610367	610374	25 %	25 %	25 %	25 %	512444022
11602	NC_021508	CG	4	8	610430	610437	0 %	0 %	50 %	50 %	512444022
11603	NC_021508	CAA	2	6	610540	610545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444022
11604	NC_021508	GC	3	6	610646	610651	0 %	0 %	50 %	50 %	512444022
11605	NC_021508	CCT	2	6	610684	610689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444022
11606	NC_021508	GCC	2	6	610704	610709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444022
11607	NC_021508	ACC	2	6	610716	610721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444022
11608	NC_021508	AG	4	8	610727	610734	50 %	0 %	50 %	0 %	512444022
11609	NC_021508	GC	3	6	610757	610762	0 %	0 %	50 %	50 %	512444022
11610	NC_021508	GCA	2	6	610770	610775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444022
11611	NC_021508	GA	3	6	610776	610781	50 %	0 %	50 %	0 %	512444022
11612	NC_021508	ATAC	2	8	610788	610795	50 %	25 %	0 %	25 %	512444022
11613	NC_021508	GTT	2	6	611006	611011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444023
11614	NC_021508	CG	4	8	611077	611084	0 %	0 %	50 %	50 %	512444023
11615	NC_021508	GCA	3	9	611110	611118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444023
11616	NC_021508	GAG	2	6	611221	611226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444023
11617	NC_021508	CACG	2	8	611266	611273	25 %	0 %	25 %	50 %	512444023
11618	NC_021508	GCT	2	6	611404	611409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444023
11619	NC_021508	CCT	2	6	611445	611450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444023
11620	NC_021508	GCC	2	6	611480	611485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444023
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11622	NC_021508	GCT	2	6	611568	611573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444023
11623	NC_021508	TCG	2	6	611675	611680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444023
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11868	NC_021508	ATC	2	6	622696	622701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444033
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11871	NC_021508	CCG	2	6	622932	622937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444033
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11887	NC_021508	CGCA	2	8	623759	623766	25 %	0 %	25 %	50 %	512444034
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11991	NC_021508	AGA	2	6	629361	629366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444037
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11993	NC_021508	CTG	2	6	629417	629422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444037
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