MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021508	AG	3	6	29862	29867	50 %	0 %	50 %	0 %	512443521
502	NC_021508	ACC	2	6	29939	29944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443521
503	NC_021508	TGCGC	2	10	29961	29970	0 %	20 %	40 %	40 %	512443521
504	NC_021508	AGT	2	6	29975	29980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443521
505	NC_021508	CCG	2	6	30117	30122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443521
506	NC_021508	TCT	2	6	30156	30161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
507	NC_021508	CAC	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443521
508	NC_021508	T	6	6	30333	30338	0 %	100 %	0 %	0 %	512443521
509	NC_021508	TC	3	6	30391	30396	0 %	50 %	0 %	50 %	512443521
510	NC_021508	AGC	2	6	30458	30463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443521
511	NC_021508	TGC	2	6	30488	30493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
512	NC_021508	TGT	2	6	30533	30538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443521
513	NC_021508	GTG	2	6	30562	30567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443521
514	NC_021508	TG	3	6	30631	30636	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
515	NC_021508	TCCAG	2	10	30787	30796	20 %	20 %	20 %	40 %	512443521
516	NC_021508	TTC	2	6	30799	30804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
517	NC_021508	TGC	2	6	30814	30819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
518	NC_021508	CGT	2	6	30920	30925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
519	NC_021508	AAAG	2	8	30935	30942	75 %	0 %	25 %	0 %	512443521
520	NC_021508	CA	3	6	30957	30962	50 %	0 %	0 %	50 %	512443521
521	NC_021508	GT	3	6	31050	31055	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
522	NC_021508	CTA	2	6	31101	31106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443521
523	NC_021508	GCGG	2	8	31111	31118	0 %	0 %	75 %	25 %	512443521
524	NC_021508	ATG	2	6	31165	31170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443521
525	NC_021508	CTT	2	6	31224	31229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
526	NC_021508	CTG	2	6	31245	31250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
527	NC_021508	TCGT	2	8	31277	31284	0 %	50 %	25 %	25 %	512443521
528	NC_021508	GAACAG	2	12	31302	31313	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512443521
529	NC_021508	A	6	6	31318	31323	100 %	0 %	0 %	0 %	512443521
530	NC_021508	TGGGG	2	10	31345	31354	0 %	20 %	80 %	0 %	512443521
531	NC_021508	GTT	2	6	31362	31367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443521
532	NC_021508	TCC	2	6	31400	31405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443521
533	NC_021508	TGTC	2	8	31417	31424	0 %	50 %	25 %	25 %	512443521
534	NC_021508	GC	3	6	31456	31461	0 %	0 %	50 %	50 %	512443521
535	NC_021508	GCT	2	6	31463	31468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
536	NC_021508	TCA	2	6	31517	31522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443521
537	NC_021508	T	7	7	31525	31531	0 %	100 %	0 %	0 %	512443521
538	NC_021508	GTCTGG	2	12	31537	31548	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512443521
539	NC_021508	GCA	2	6	31581	31586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443521
540	NC_021508	TGG	2	6	31622	31627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443521
541	NC_021508	GA	3	6	31729	31734	50 %	0 %	50 %	0 %	512443521
542	NC_021508	GCG	2	6	31750	31755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443521
543	NC_021508	CAA	2	6	31824	31829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443521
544	NC_021508	TGC	2	6	31880	31885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
545	NC_021508	A	8	8	31903	31910	100 %	0 %	0 %	0 %	512443521
546	NC_021508	AGC	2	6	31996	32001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443521
547	NC_021508	ATCC	2	8	32107	32114	25 %	25 %	0 %	50 %	512443521
548	NC_021508	CTCG	2	8	32116	32123	0 %	25 %	25 %	50 %	512443521
549	NC_021508	GTAC	2	8	32140	32147	25 %	25 %	25 %	25 %	512443521
550	NC_021508	G	6	6	32171	32176	0 %	0 %	100 %	0 %	512443521
551	NC_021508	G	6	6	32179	32184	0 %	0 %	100 %	0 %	512443521
552	NC_021508	T	6	6	32299	32304	0 %	100 %	0 %	0 %	512443521
553	NC_021508	CCT	2	6	32357	32362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443521
554	NC_021508	GT	3	6	32398	32403	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
555	NC_021508	AC	3	6	32439	32444	50 %	0 %	0 %	50 %	512443521
556	NC_021508	TTCA	2	8	32452	32459	25 %	50 %	0 %	25 %	512443521
557	NC_021508	GTTG	2	8	32481	32488	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
558	NC_021508	CTT	2	6	32514	32519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
559	NC_021508	AGT	2	6	32586	32591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443521
560	NC_021508	AGG	3	9	32604	32612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443521
561	NC_021508	CTT	2	6	32763	32768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
562	NC_021508	CAAA	2	8	32790	32797	75 %	0 %	0 %	25 %	512443521
563	NC_021508	T	7	7	32841	32847	0 %	100 %	0 %	0 %	512443521
564	NC_021508	GAA	2	6	32916	32921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443521
565	NC_021508	GC	3	6	32983	32988	0 %	0 %	50 %	50 %	512443522
566	NC_021508	AG	3	6	33095	33100	50 %	0 %	50 %	0 %	512443522
567	NC_021508	AG	3	6	33104	33109	50 %	0 %	50 %	0 %	512443522
568	NC_021508	GAT	2	6	33130	33135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443522
569	NC_021508	TGA	2	6	33142	33147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443522
570	NC_021508	GCA	2	6	33150	33155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443522
571	NC_021508	T	6	6	33160	33165	0 %	100 %	0 %	0 %	512443522
572	NC_021508	ATC	2	6	33218	33223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443522
573	NC_021508	TGCG	2	8	33237	33244	0 %	25 %	50 %	25 %	512443522
574	NC_021508	T	7	7	33267	33273	0 %	100 %	0 %	0 %	512443522
575	NC_021508	GAA	2	6	33286	33291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443522
576	NC_021508	CG	3	6	33305	33310	0 %	0 %	50 %	50 %	512443522
577	NC_021508	GCA	2	6	33418	33423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443522
578	NC_021508	CTT	2	6	33470	33475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443522
579	NC_021508	CTC	2	6	33476	33481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443522
580	NC_021508	TGG	2	6	33547	33552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443522
581	NC_021508	AGG	2	6	33570	33575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443522
582	NC_021508	CCGC	2	8	33640	33647	0 %	0 %	25 %	75 %	512443522
583	NC_021508	AAGAT	2	10	33651	33660	60 %	20 %	20 %	0 %	512443522
584	NC_021508	TTC	2	6	33668	33673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443522
585	NC_021508	GCA	2	6	33702	33707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443522
586	NC_021508	AC	3	6	33730	33735	50 %	0 %	0 %	50 %	512443522
587	NC_021508	CTT	2	6	33775	33780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443522
588	NC_021508	ACC	2	6	33816	33821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443522
589	NC_021508	GCC	2	6	33861	33866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443522
590	NC_021508	GAG	2	6	33961	33966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443522
591	NC_021508	TGT	2	6	34219	34224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443523
592	NC_021508	CTG	2	6	34228	34233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443523
593	NC_021508	TGC	2	6	34346	34351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443523
594	NC_021508	CTT	2	6	34473	34478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443523
595	NC_021508	ATT	2	6	34488	34493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443523
596	NC_021508	GCCG	2	8	34513	34520	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
597	NC_021508	GAC	2	6	34668	34673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443523
598	NC_021508	TAT	2	6	34778	34783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443523
599	NC_021508	ATTG	2	8	34799	34806	25 %	50 %	25 %	0 %	512443523
600	NC_021508	CG	4	8	34813	34820	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
601	NC_021508	AGA	2	6	34852	34857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443523
602	NC_021508	GAA	2	6	34922	34927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443523
603	NC_021508	AGA	2	6	34940	34945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443523
604	NC_021508	GACG	2	8	34950	34957	25 %	0 %	50 %	25 %	512443523
605	NC_021508	AGA	2	6	34964	34969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443523
606	NC_021508	GC	3	6	34996	35001	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
607	NC_021508	GCA	2	6	35039	35044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443523
608	NC_021508	GC	3	6	35051	35056	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
609	NC_021508	TGA	2	6	35084	35089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443523
610	NC_021508	AT	3	6	35125	35130	50 %	50 %	0 %	0 %	512443523
611	NC_021508	T	6	6	35139	35144	0 %	100 %	0 %	0 %	512443523
612	NC_021508	TA	3	6	35214	35219	50 %	50 %	0 %	0 %	512443523
613	NC_021508	TTC	2	6	35273	35278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443523
614	NC_021508	CAC	2	6	35342	35347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443523
615	NC_021508	TG	3	6	35370	35375	0 %	50 %	50 %	0 %	512443523
616	NC_021508	TAG	2	6	35430	35435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443523
617	NC_021508	TG	3	6	35490	35495	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
618	NC_021508	GTC	2	6	35529	35534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443524
619	NC_021508	CT	3	6	35668	35673	0 %	50 %	0 %	50 %	512443524
620	NC_021508	GTG	2	6	35677	35682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443524
621	NC_021508	CGTG	2	8	35744	35751	0 %	25 %	50 %	25 %	512443524
622	NC_021508	ATT	2	6	35752	35757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443524
623	NC_021508	T	6	6	35829	35834	0 %	100 %	0 %	0 %	512443524
624	NC_021508	GT	4	8	35868	35875	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
625	NC_021508	T	7	7	35906	35912	0 %	100 %	0 %	0 %	512443524
626	NC_021508	ACG	2	6	35923	35928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443524
627	NC_021508	GAA	2	6	35941	35946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443524
628	NC_021508	GC	3	6	36015	36020	0 %	0 %	50 %	50 %	512443524
629	NC_021508	CA	4	8	36064	36071	50 %	0 %	0 %	50 %	512443524
630	NC_021508	AC	3	6	36092	36097	50 %	0 %	0 %	50 %	512443524
631	NC_021508	TG	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
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762	NC_021508	GTT	2	6	44020	44025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443532
763	NC_021508	GCT	2	6	44100	44105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443532
764	NC_021508	TGA	2	6	44118	44123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443532
765	NC_021508	CG	3	6	44130	44135	0 %	0 %	50 %	50 %	512443532
766	NC_021508	GCA	2	6	44149	44154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443532
767	NC_021508	CGTCG	2	10	44169	44178	0 %	20 %	40 %	40 %	512443532
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770	NC_021508	GGGT	2	8	44279	44286	0 %	25 %	75 %	0 %	512443532
771	NC_021508	TGG	2	6	44300	44305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443532
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773	NC_021508	GGT	3	9	44400	44408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443532
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775	NC_021508	GCA	2	6	44601	44606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443533
776	NC_021508	GTG	2	6	44609	44614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443533
777	NC_021508	GAT	2	6	44686	44691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443533
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779	NC_021508	GCA	2	6	44792	44797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443533
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782	NC_021508	TGC	3	9	45076	45084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443533
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785	NC_021508	CG	3	6	45195	45200	0 %	0 %	50 %	50 %	512443533
786	NC_021508	CGG	2	6	45222	45227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443533
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791	NC_021508	GCA	2	6	45734	45739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443534
792	NC_021508	AGGA	2	8	45740	45747	50 %	0 %	50 %	0 %	512443534
793	NC_021508	CG	3	6	45778	45783	0 %	0 %	50 %	50 %	512443534
794	NC_021508	CAA	2	6	45828	45833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443534
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820	NC_021508	TGG	2	6	47935	47940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443536
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874	NC_021508	CA	3	6	50781	50786	50 %	0 %	0 %	50 %	512443538
875	NC_021508	GCAG	2	8	50846	50853	25 %	0 %	50 %	25 %	512443538
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887	NC_021508	TTCT	2	8	51460	51467	0 %	75 %	0 %	25 %	512443538
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