MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021508	TTA	2	6	333960	333965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443791
6003	NC_021508	GGTG	2	8	334036	334043	0 %	25 %	75 %	0 %	512443791
6004	NC_021508	AGA	2	6	334166	334171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443791
6005	NC_021508	AC	3	6	334235	334240	50 %	0 %	0 %	50 %	512443791
6006	NC_021508	ACGC	2	8	334276	334283	25 %	0 %	25 %	50 %	512443791
6007	NC_021508	CTG	2	6	334307	334312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443791
6008	NC_021508	TCT	3	9	334333	334341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443791
6009	NC_021508	CTT	2	6	334345	334350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443791
6010	NC_021508	TTG	2	6	334442	334447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443791
6011	NC_021508	GCAA	2	8	334491	334498	50 %	0 %	25 %	25 %	512443791
6012	NC_021508	TCT	2	6	334512	334517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443791
6013	NC_021508	TGA	2	6	334537	334542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443791
6014	NC_021508	TGC	2	6	334550	334555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443791
6015	NC_021508	CAC	2	6	334637	334642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443791
6016	NC_021508	GCA	2	6	334660	334665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443791
6017	NC_021508	AGG	2	6	334718	334723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443791
6018	NC_021508	CTT	2	6	334865	334870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443791
6019	NC_021508	CCAG	2	8	334882	334889	25 %	0 %	25 %	50 %	512443791
6020	NC_021508	TG	3	6	334959	334964	0 %	50 %	50 %	0 %	512443791
6021	NC_021508	CAG	2	6	335072	335077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443791
6022	NC_021508	TCT	2	6	335130	335135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443791
6023	NC_021508	TACT	2	8	335220	335227	25 %	50 %	0 %	25 %	512443791
6024	NC_021508	GA	3	6	335271	335276	50 %	0 %	50 %	0 %	512443791
6025	NC_021508	GCC	2	6	335336	335341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443791
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6028	NC_021508	AGTGT	2	10	335473	335482	20 %	40 %	40 %	0 %	512443791
6029	NC_021508	TGC	2	6	335583	335588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443791
6030	NC_021508	GTGG	2	8	335600	335607	0 %	25 %	75 %	0 %	512443791
6031	NC_021508	GTA	2	6	335646	335651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443791
6032	NC_021508	CGCT	2	8	335803	335810	0 %	25 %	25 %	50 %	512443791
6033	NC_021508	CAC	3	9	335819	335827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443791
6034	NC_021508	AC	3	6	335826	335831	50 %	0 %	0 %	50 %	512443791
6035	NC_021508	C	11	11	335870	335880	0 %	0 %	0 %	100 %	512443792
6036	NC_021508	TAG	2	6	335890	335895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443792
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6038	NC_021508	CAC	2	6	335932	335937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443792
6039	NC_021508	CCT	2	6	335946	335951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443792
6040	NC_021508	GA	4	8	336022	336029	50 %	0 %	50 %	0 %	512443793
6041	NC_021508	CG	3	6	336038	336043	0 %	0 %	50 %	50 %	512443793
6042	NC_021508	T	6	6	336054	336059	0 %	100 %	0 %	0 %	512443793
6043	NC_021508	TGC	2	6	336066	336071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443793
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6046	NC_021508	TCG	2	6	336138	336143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443793
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6049	NC_021508	GTT	2	6	336428	336433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443793
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6053	NC_021508	G	6	6	336712	336717	0 %	0 %	100 %	0 %	512443793
6054	NC_021508	GC	3	6	336743	336748	0 %	0 %	50 %	50 %	512443793
6055	NC_021508	TCG	2	6	336751	336756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443793
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6057	NC_021508	GCGGA	2	10	336875	336884	20 %	0 %	60 %	20 %	512443793
6058	NC_021508	G	6	6	336917	336922	0 %	0 %	100 %	0 %	512443793
6059	NC_021508	GAG	2	6	337019	337024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443793
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6063	NC_021508	TTTG	2	8	337137	337144	0 %	75 %	25 %	0 %	512443794
6064	NC_021508	CGT	2	6	337156	337161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443794
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6090	NC_021508	GGTGC	2	10	338209	338218	0 %	20 %	60 %	20 %	512443795
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6097	NC_021508	GCA	2	6	338506	338511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443795
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6101	NC_021508	CG	3	6	338664	338669	0 %	0 %	50 %	50 %	512443795
6102	NC_021508	G	7	7	338727	338733	0 %	0 %	100 %	0 %	512443795
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6106	NC_021508	A	7	7	338900	338906	100 %	0 %	0 %	0 %	512443795
6107	NC_021508	GCT	2	6	338967	338972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443796
6108	NC_021508	GGT	2	6	339015	339020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443796
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6489	NC_021508	GAAG	2	8	359151	359158	50 %	0 %	50 %	0 %	512443807
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6495	NC_021508	TTG	2	6	359428	359433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443808
6496	NC_021508	GTG	2	6	359441	359446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443808
6497	NC_021508	GGA	2	6	359483	359488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443808
6498	NC_021508	T	7	7	359534	359540	0 %	100 %	0 %	0 %	512443808
6499	NC_021508	TG	3	6	359555	359560	0 %	50 %	50 %	0 %	512443808
6500	NC_021508	CCTC	2	8	359579	359586	0 %	25 %	0 %	75 %	512443808

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