MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021508	GC	3	6	278663	278668	0 %	0 %	50 %	50 %	512443750
5003	NC_021508	GGCG	2	8	278690	278697	0 %	0 %	75 %	25 %	512443750
5004	NC_021508	A	6	6	278733	278738	100 %	0 %	0 %	0 %	512443750
5005	NC_021508	GGGA	2	8	278799	278806	25 %	0 %	75 %	0 %	512443750
5006	NC_021508	GTG	2	6	278884	278889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443750
5007	NC_021508	AGG	2	6	278978	278983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443750
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5010	NC_021508	GAA	2	6	279087	279092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443750
5011	NC_021508	TGT	2	6	279096	279101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443750
5012	NC_021508	AT	3	6	279102	279107	50 %	50 %	0 %	0 %	512443750
5013	NC_021508	AGT	2	6	279118	279123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443750
5014	NC_021508	GATG	2	8	279137	279144	25 %	25 %	50 %	0 %	512443750
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5018	NC_021508	GAT	2	6	284791	284796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443751
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5020	NC_021508	GAG	2	6	284920	284925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443751
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5043	NC_021508	GGCGC	2	10	285956	285965	0 %	0 %	60 %	40 %	512443753
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5056	NC_021508	CG	3	6	286696	286701	0 %	0 %	50 %	50 %	512443753
5057	NC_021508	TCATTT	2	12	286709	286720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512443753
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5060	NC_021508	GAA	2	6	286821	286826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443753
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5093	NC_021508	CGT	2	6	288352	288357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443754
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5124	NC_021508	CTT	2	6	289881	289886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443756
5125	NC_021508	AGA	2	6	289920	289925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443756
5126	NC_021508	CAAT	2	8	290090	290097	50 %	25 %	0 %	25 %	512443756
5127	NC_021508	CTA	2	6	290169	290174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443756
5128	NC_021508	GCA	2	6	290244	290249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443756
5129	NC_021508	TG	3	6	290259	290264	0 %	50 %	50 %	0 %	512443756
5130	NC_021508	AAG	2	6	290275	290280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443756
5131	NC_021508	TTTC	2	8	290359	290366	0 %	75 %	0 %	25 %	512443756
5132	NC_021508	ACCC	2	8	290413	290420	25 %	0 %	0 %	75 %	512443756
5133	NC_021508	A	7	7	290625	290631	100 %	0 %	0 %	0 %	512443757
5134	NC_021508	CATTG	2	10	290632	290641	20 %	40 %	20 %	20 %	512443757
5135	NC_021508	GGGTA	2	10	290696	290705	20 %	20 %	60 %	0 %	512443757
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5139	NC_021508	GT	3	6	290932	290937	0 %	50 %	50 %	0 %	512443757
5140	NC_021508	GCAC	2	8	290950	290957	25 %	0 %	25 %	50 %	512443757
5141	NC_021508	GTGC	2	8	291040	291047	0 %	25 %	50 %	25 %	512443757
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5143	NC_021508	T	6	6	291097	291102	0 %	100 %	0 %	0 %	512443757
5144	NC_021508	CCTT	2	8	291119	291126	0 %	50 %	0 %	50 %	512443757
5145	NC_021508	T	6	6	291174	291179	0 %	100 %	0 %	0 %	512443757
5146	NC_021508	TGC	2	6	291221	291226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443757
5147	NC_021508	TCG	2	6	291240	291245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443757
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5149	NC_021508	GGC	2	6	291276	291281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443757
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5156	NC_021508	TGC	2	6	291705	291710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443758
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5235	NC_021508	CTG	2	6	295906	295911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443762
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5240	NC_021508	GC	3	6	296188	296193	0 %	0 %	50 %	50 %	512443762
5241	NC_021508	G	7	7	296199	296205	0 %	0 %	100 %	0 %	512443762
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5245	NC_021508	GAG	2	6	296309	296314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443762
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5372	NC_021508	TGCT	2	8	303353	303360	0 %	50 %	25 %	25 %	512443767
5373	NC_021508	G	6	6	303369	303374	0 %	0 %	100 %	0 %	512443767
5374	NC_021508	T	6	6	303535	303540	0 %	100 %	0 %	0 %	512443767
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5379	NC_021508	CG	4	8	303598	303605	0 %	0 %	50 %	50 %	512443767
5380	NC_021508	ACGG	3	12	303675	303686	25 %	0 %	50 %	25 %	512443767
5381	NC_021508	CTT	2	6	303704	303709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443767
5382	NC_021508	GCTGCA	2	12	303781	303792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512443767
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5385	NC_021508	CTG	2	6	303872	303877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443767
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5400	NC_021508	AC	3	6	304412	304417	50 %	0 %	0 %	50 %	512443767
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5488	NC_021508	T	6	6	308362	308367	0 %	100 %	0 %	0 %	512443772
5489	NC_021508	TG	3	6	308377	308382	0 %	50 %	50 %	0 %	512443772
5490	NC_021508	ACGT	2	8	308392	308399	25 %	25 %	25 %	25 %	512443772
5491	NC_021508	AATG	2	8	308475	308482	50 %	25 %	25 %	0 %	512443772
5492	NC_021508	ATC	2	6	308524	308529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443772
5493	NC_021508	A	7	7	308559	308565	100 %	0 %	0 %	0 %	512443772
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5496	NC_021508	GTA	2	6	308892	308897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443772
5497	NC_021508	TTC	2	6	308939	308944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443772
5498	NC_021508	A	6	6	308951	308956	100 %	0 %	0 %	0 %	512443772
5499	NC_021508	GAT	2	6	308966	308971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443772
5500	NC_021508	ATT	2	6	308986	308991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443772

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