MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021508	CGGCG	2	10	250067	250076	0 %	0 %	60 %	40 %	512443726
4502	NC_021508	GAT	2	6	250110	250115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443726
4503	NC_021508	GAA	2	6	250284	250289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443726
4504	NC_021508	AATT	2	8	250430	250437	50 %	50 %	0 %	0 %	512443727
4505	NC_021508	T	6	6	250468	250473	0 %	100 %	0 %	0 %	512443727
4506	NC_021508	TAC	2	6	250490	250495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4507	NC_021508	GGAATG	2	12	250499	250510	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512443727
4508	NC_021508	TAC	2	6	250647	250652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4509	NC_021508	A	6	6	250763	250768	100 %	0 %	0 %	0 %	512443727
4510	NC_021508	GGC	2	6	250821	250826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4511	NC_021508	CGG	2	6	250831	250836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4512	NC_021508	ACCTTG	2	12	250873	250884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512443727
4513	NC_021508	TTG	2	6	250891	250896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443727
4514	NC_021508	GAT	2	6	250913	250918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4515	NC_021508	TGC	2	6	250948	250953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4516	NC_021508	GAT	2	6	251006	251011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4517	NC_021508	ATC	2	6	251166	251171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4518	NC_021508	TAT	2	6	251438	251443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443727
4519	NC_021508	GAAA	2	8	251459	251466	75 %	0 %	25 %	0 %	512443727
4520	NC_021508	TGG	2	6	251620	251625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443727
4521	NC_021508	TG	3	6	251654	251659	0 %	50 %	50 %	0 %	512443727
4522	NC_021508	GGC	2	6	251720	251725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4523	NC_021508	TGT	2	6	251749	251754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443727
4524	NC_021508	TAT	2	6	251829	251834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443727
4525	NC_021508	CT	3	6	251849	251854	0 %	50 %	0 %	50 %	512443727
4526	NC_021508	GGA	2	6	251891	251896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4527	NC_021508	ATG	2	6	251901	251906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4528	NC_021508	TGA	2	6	252053	252058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4529	NC_021508	AATT	2	8	252073	252080	50 %	50 %	0 %	0 %	512443727
4530	NC_021508	CTT	2	6	252164	252169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443727
4531	NC_021508	GAC	2	6	252189	252194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4532	NC_021508	ATC	2	6	252195	252200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4533	NC_021508	G	6	6	252273	252278	0 %	0 %	100 %	0 %	512443727
4534	NC_021508	CGT	2	6	252308	252313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4535	NC_021508	GAG	2	6	252336	252341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4536	NC_021508	ATG	2	6	252354	252359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4537	NC_021508	GGAT	2	8	252380	252387	25 %	25 %	50 %	0 %	512443727
4538	NC_021508	ATG	2	6	252402	252407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4539	NC_021508	GC	3	6	252420	252425	0 %	0 %	50 %	50 %	512443727
4540	NC_021508	ATC	2	6	252492	252497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4541	NC_021508	T	6	6	252546	252551	0 %	100 %	0 %	0 %	512443727
4542	NC_021508	CGT	2	6	252624	252629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4543	NC_021508	TGG	2	6	252652	252657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443727
4544	NC_021508	GAG	2	6	252663	252668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4545	NC_021508	CG	3	6	252699	252704	0 %	0 %	50 %	50 %	512443727
4546	NC_021508	ATT	2	6	252723	252728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443727
4547	NC_021508	CTG	2	6	252798	252803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4548	NC_021508	CGA	2	6	252824	252829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4549	NC_021508	GAA	2	6	252849	252854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443727
4550	NC_021508	GAG	2	6	252907	252912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4551	NC_021508	TG	5	10	252913	252922	0 %	50 %	50 %	0 %	512443727
4552	NC_021508	CAA	2	6	252947	252952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443727
4553	NC_021508	TAC	2	6	253061	253066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4554	NC_021508	GGA	2	6	253136	253141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4555	NC_021508	T	6	6	253176	253181	0 %	100 %	0 %	0 %	512443727
4556	NC_021508	CG	4	8	253239	253246	0 %	0 %	50 %	50 %	512443727
4557	NC_021508	ACCAC	2	10	253270	253279	40 %	0 %	0 %	60 %	512443727
4558	NC_021508	ATCG	2	8	253326	253333	25 %	25 %	25 %	25 %	512443727
4559	NC_021508	GTA	2	6	253389	253394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4560	NC_021508	GCC	2	6	253415	253420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443727
4561	NC_021508	ATT	2	6	253500	253505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443727
4562	NC_021508	TGG	2	6	253549	253554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443727
4563	NC_021508	ACG	2	6	253566	253571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443727
4564	NC_021508	TGA	2	6	253613	253618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4565	NC_021508	TAC	2	6	253641	253646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443727
4566	NC_021508	GC	3	6	253659	253664	0 %	0 %	50 %	50 %	512443727
4567	NC_021508	GAA	2	6	253674	253679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443727
4568	NC_021508	GC	3	6	253681	253686	0 %	0 %	50 %	50 %	512443727
4569	NC_021508	G	7	7	253751	253757	0 %	0 %	100 %	0 %	512443727
4570	NC_021508	ATT	2	6	253775	253780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443727
4571	NC_021508	GCG	2	6	253787	253792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4572	NC_021508	GTG	2	6	253872	253877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443727
4573	NC_021508	GGAA	2	8	253891	253898	50 %	0 %	50 %	0 %	512443727
4574	NC_021508	AGGC	2	8	253957	253964	25 %	0 %	50 %	25 %	512443727
4575	NC_021508	TG	3	6	253972	253977	0 %	50 %	50 %	0 %	512443727
4576	NC_021508	TGA	2	6	254041	254046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4577	NC_021508	TCAA	2	8	254082	254089	50 %	25 %	0 %	25 %	512443727
4578	NC_021508	GTG	2	6	254109	254114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443727
4579	NC_021508	G	6	6	254229	254234	0 %	0 %	100 %	0 %	512443727
4580	NC_021508	GC	3	6	254247	254252	0 %	0 %	50 %	50 %	512443727
4581	NC_021508	GGC	2	6	254276	254281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4582	NC_021508	GCG	2	6	254346	254351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4583	NC_021508	TGA	2	6	254366	254371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443727
4584	NC_021508	TG	3	6	254374	254379	0 %	50 %	50 %	0 %	512443727
4585	NC_021508	GCG	2	6	254432	254437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443727
4586	NC_021508	GGA	2	6	254492	254497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4587	NC_021508	AGG	2	6	254524	254529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443727
4588	NC_021508	T	6	6	254728	254733	0 %	100 %	0 %	0 %	512443728
4589	NC_021508	GT	3	6	254781	254786	0 %	50 %	50 %	0 %	512443728
4590	NC_021508	TGA	2	6	254794	254799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443728
4591	NC_021508	A	6	6	254810	254815	100 %	0 %	0 %	0 %	512443728
4592	NC_021508	TCTGC	2	10	254823	254832	0 %	40 %	20 %	40 %	512443728
4593	NC_021508	G	6	6	254980	254985	0 %	0 %	100 %	0 %	512443728
4594	NC_021508	GTG	2	6	255003	255008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443728
4595	NC_021508	CG	3	6	255051	255056	0 %	0 %	50 %	50 %	512443728
4596	NC_021508	CCG	2	6	255114	255119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443729
4597	NC_021508	CG	3	6	255125	255130	0 %	0 %	50 %	50 %	512443729
4598	NC_021508	GTG	2	6	255141	255146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443729
4599	NC_021508	ATG	2	6	255168	255173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443729
4600	NC_021508	AAG	2	6	255183	255188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443729
4601	NC_021508	TAT	2	6	255203	255208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443729
4602	NC_021508	GAG	2	6	255246	255251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443729
4603	NC_021508	CGG	2	6	255312	255317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443729
4604	NC_021508	TGG	2	6	255320	255325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443729
4605	NC_021508	GCA	2	6	255399	255404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443729
4606	NC_021508	GCA	2	6	255441	255446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443729
4607	NC_021508	TTG	2	6	255575	255580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443730
4608	NC_021508	G	7	7	255709	255715	0 %	0 %	100 %	0 %	512443730
4609	NC_021508	GC	4	8	255740	255747	0 %	0 %	50 %	50 %	512443730
4610	NC_021508	GGT	2	6	255793	255798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443730
4611	NC_021508	TGCG	2	8	255843	255850	0 %	25 %	50 %	25 %	512443730
4612	NC_021508	GC	3	6	255913	255918	0 %	0 %	50 %	50 %	512443730
4613	NC_021508	TGCAG	2	10	255926	255935	20 %	20 %	40 %	20 %	512443730
4614	NC_021508	TGT	2	6	255942	255947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443730
4615	NC_021508	ATA	2	6	255969	255974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443730
4616	NC_021508	CG	3	6	256015	256020	0 %	0 %	50 %	50 %	512443730
4617	NC_021508	GGA	2	6	256138	256143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443730
4618	NC_021508	AGC	2	6	256150	256155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443730
4619	NC_021508	TGC	2	6	256195	256200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443730
4620	NC_021508	TGC	2	6	256264	256269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443730
4621	NC_021508	CGC	2	6	256360	256365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443730
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4623	NC_021508	CTG	2	6	256431	256436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443730
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4748	NC_021508	TTC	2	6	262890	262895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443733
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4750	NC_021508	TGC	2	6	262917	262922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443733
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4859	NC_021508	TTTTC	2	10	268783	268792	0 %	80 %	0 %	20 %	512443741
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4862	NC_021508	TTTTTC	2	12	268938	268949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512443741
4863	NC_021508	ATG	2	6	268976	268981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443741
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4867	NC_021508	TGCG	2	8	269139	269146	0 %	25 %	50 %	25 %	512443741
4868	NC_021508	GCC	2	6	269151	269156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443741
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4996	NC_021508	GTAT	2	8	278236	278243	25 %	50 %	25 %	0 %	512443750
4997	NC_021508	GCG	2	6	278285	278290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443750
4998	NC_021508	GGC	2	6	278343	278348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443750
4999	NC_021508	AC	3	6	278516	278521	50 %	0 %	0 %	50 %	512443750
5000	NC_021508	AGGC	2	8	278581	278588	25 %	0 %	50 %	25 %	512443750

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